Treponema denticola ATCC 35405 [gbbct]: 2767 CDS's (869602 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 44.2( 38463)  UCU 14.2( 12350)  UAU 28.1( 24461)  UGU  6.4(  5570)
UUC  9.1(  7953)  UCC 10.6(  9194)  UAC 10.8(  9366)  UGC  5.1(  4457)
UUA 27.6( 24012)  UCA 12.7( 11069)  UAA  2.0(  1766)  UGA  0.6(   479)
UUG 16.6( 14428)  UCG  9.8(  8498)  UAG  0.6(   528)  UGG  8.8(  7654)

CUU 30.3( 26382)  CCU 13.3( 11577)  CAU  9.7(  8449)  CGU  5.2(  4542)
CUC  7.6(  6618)  CCC  9.4(  8207)  CAC  4.8(  4162)  CGC  6.1(  5269)
CUA  6.0(  5219)  CCA  2.7(  2352)  CAA 17.2( 14948)  CGA  3.3(  2877)
CUG  7.4(  6447)  CCG  8.5(  7369)  CAG 10.0(  8675)  CGG  3.2(  2817)

AUU 36.2( 31512)  ACU 10.9(  9449)  AAU 33.0( 28735)  AGU  9.1(  7910)
AUC 16.3( 14152)  ACC 14.0( 12162)  AAC 18.1( 15741)  AGC 11.2(  9707)
AUA 32.5( 28230)  ACA 16.0( 13899)  AAA 60.3( 52404)  AGA 12.4( 10784)
AUG 22.9( 19907)  ACG  9.0(  7820)  AAG 25.8( 22411)  AGG  7.3(  6307)

GUU 24.0( 20883)  GCU 19.6( 17050)  GAU 36.9( 32095)  GGU 15.6( 13593)
GUC  7.4(  6393)  GCC 21.2( 18407)  GAC 15.9( 13840)  GGC 17.3( 15086)
GUA 19.8( 17222)  GCA 22.4( 19464)  GAA 55.8( 48544)  GGA 23.4( 20375)
GUG  5.5(  4789)  GCG  6.3(  5475)  GAG 15.6( 13573)  GGG  6.4(  5525)

Coding GC 38.27% 1st letter GC 45.79% 2nd letter GC 34.19% 3rd letter GC 34.84%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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