Neisseria gonorrhoeae FA 1090 [gbbct]: 2002 CDS's (564135 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 20.2( 11370)  UCU  5.4(  3045)  UAU 13.4(  7586)  UGU  2.9(  1626)
UUC 21.7( 12233)  UCC 14.3(  8076)  UAC 15.8(  8939)  UGC  8.3(  4659)
UUA  6.3(  3542)  UCA  4.1(  2287)  UAA  1.8(  1010)  UGA  1.4(   774)
UUG 30.5( 17180)  UCG 10.0(  5667)  UAG  0.4(   218)  UGG 11.5(  6481)

CUU  9.9(  5564)  CCU  6.9(  3910)  CAU  8.4(  4716)  CGU 10.9(  6143)
CUC 13.7(  7756)  CCC 15.0(  8487)  CAC 13.3(  7496)  CGC 29.8( 16799)
CUA  1.6(   930)  CCA  2.0(  1150)  CAA 21.6( 12171)  CGA  2.7(  1503)
CUG 35.2( 19865)  CCG 19.4( 10952)  CAG 16.8(  9482)  CGG  8.0(  4523)

AUU 20.6( 11647)  ACU  4.9(  2784)  AAU 13.6(  7695)  AGU  3.8(  2167)
AUC 31.2( 17584)  ACC 25.7( 14484)  AAC 25.9( 14593)  AGC 16.2(  9134)
AUA  5.4(  3025)  ACA  5.8(  3300)  AAA 45.2( 25527)  AGA  2.3(  1306)
AUG 24.7( 13946)  ACG 13.7(  7740)  AAG 10.9(  6133)  AGG  3.9(  2224)

GUU 16.1(  9106)  GCU  7.9(  4458)  GAU 21.4( 12098)  GGU 15.2(  8591)
GUC 24.1( 13590)  GCC 43.7( 24648)  GAC 30.7( 17344)  GGC 46.7( 26329)
GUA  9.7(  5463)  GCA 19.1( 10765)  GAA 49.5( 27905)  GGA  8.6(  4827)
GUG 17.9( 10085)  GCG 31.6( 17842)  GAG 12.2(  6884)  GGG  8.5(  4771)

Coding GC 53.99% 1st letter GC 57.81% 2nd letter GC 41.03% 3rd letter GC 63.13%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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