Thermoplasma acidophilum [gbbct]: 1514 CDS's (467591 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 15.0(  7027)  UCU 10.3(  4810)  UAU 20.1(  9380)  UGU  1.4(   657)
UUC 31.4( 14703)  UCC 15.9(  7450)  UAC 26.0( 12170)  UGC  4.6(  2155)
UUA  4.0(  1868)  UCA 16.1(  7525)  UAA  0.7(   339)  UGA  2.1(   969)
UUG  6.7(  3117)  UCG 12.3(  5774)  UAG  0.4(   206)  UGG  8.6(  4012)

CUU 20.1(  9391)  CCU  8.2(  3837)  CAU  8.8(  4098)  CGU  3.1(  1469)
CUC 18.8(  8789)  CCC  6.5(  3017)  CAC  7.7(  3594)  CGC  5.2(  2426)
CUA  6.2(  2922)  CCA 12.5(  5844)  CAA  2.9(  1375)  CGA  2.0(   943)
CUG 28.0( 13106)  CCG 12.5(  5847)  CAG 18.9(  8823)  CGG  2.6(  1224)

AUU 12.3(  5771)  ACU  6.8(  3169)  AAU 18.8(  8768)  AGU  4.8(  2222)
AUC 22.4( 10464)  ACC 13.6(  6348)  AAC 23.7( 11075)  AGC 15.9(  7453)
AUA 55.2( 25825)  ACA 13.7(  6405)  AAA 17.3(  8104)  AGA 15.5(  7261)
AUG 30.7( 14347)  ACG 14.2(  6624)  AAG 38.9( 18199)  AGG 26.1( 12218)

GUU 20.9(  9796)  GCU 12.6(  5893)  GAU 37.3( 17436)  GGU 14.9(  6951)
GUC 16.0(  7490)  GCC 20.8(  9729)  GAC 20.0(  9360)  GGC 24.9( 11664)
GUA 14.1(  6593)  GCA 22.4( 10486)  GAA 28.0( 13109)  GGA 22.5( 10531)
GUG 20.6(  9636)  GCG 13.5(  6327)  GAG 31.7( 14803)  GGG 10.0(  4667)

Coding GC 47.33% 1st letter GC 49.44% 2nd letter GC 37.62% 3rd letter GC 54.92%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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