Hyphomonas neptunium ATCC 15444 [gbbct]: 3505 CDS's (1118106 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number]) 
UUU 12.1( 13511)  UCU  5.0(  5537)  UAU 14.3( 15941)  UGU  1.8(  2045)
UUC 25.4( 28416)  UCC 14.3( 16035)  UAC  8.9(  9937)  UGC  6.5(  7219)
UUA  0.6(   701)  UCA  4.3(  4836)  UAA  0.6(   709)  UGA  1.9(  2124)
UUG  6.1(  6864)  UCG 14.5( 16253)  UAG  0.6(   673)  UGG 13.8( 15375)

CUU 14.0( 15707)  CCU  6.1(  6830)  CAU  9.8( 10972)  CGU  6.8(  7629)
CUC 28.1( 31440)  CCC 17.8( 19930)  CAC  8.5(  9500)  CGC 37.8( 42258)
CUA  1.3(  1448)  CCA  4.5(  5032)  CAA  4.6(  5118)  CGA  1.9(  2180)
CUG 47.6( 53223)  CCG 24.8( 27762)  CAG 25.9( 28978)  CGG 16.2( 18167)

AUU 12.9( 14378)  ACU  3.0(  3409)  AAU 10.6( 11799)  AGU  2.4(  2719)
AUC 36.4( 40725)  ACC 24.7( 27644)  AAC 15.5( 17316)  AGC 15.1( 16900)
AUA  2.5(  2766)  ACA  6.8(  7658)  AAA 11.9( 13262)  AGA  1.4(  1615)
AUG 25.2( 28130)  ACG 19.0( 21297)  AAG 22.0( 24626)  AGG  2.3(  2516)

GUU 11.9( 13255)  GCU 11.7( 13118)  GAU 23.8( 26632)  GGU  9.2( 10300)
GUC 25.2( 28200)  GCC 56.9( 63601)  GAC 33.1( 37064)  GGC 57.3( 64069)
GUA  3.9(  4336)  GCA 14.2( 15873)  GAA 31.8( 35593)  GGA  6.9(  7683)
GUG 27.7( 31010)  GCG 44.1( 49360)  GAG 29.9( 33459)  GGG 13.8( 15443)
Coding GC 62.34% 1st letter GC 65.75% 2nd letter GC 46.72% 3rd letter GC 74.54%
Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM
CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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