Chlamydophila caviae GPIC [gbbct]: 1005 CDS's (351818 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 30.4( 10701)  UCU 32.1( 11276)  UAU 22.6(  7940)  UGU 10.3(  3628)
UUC 15.8(  5573)  UCC 10.3(  3607)  UAC  9.8(  3445)  UGC  5.7(  2016)
UUA 38.1( 13418)  UCA 12.1(  4262)  UAA  1.8(   635)  UGA  0.3(   119)
UUG 14.9(  5256)  UCG  5.8(  2028)  UAG  0.7(   251)  UGG  9.5(  3339)

CUU 24.5(  8612)  CCU 23.4(  8222)  CAU 17.5(  6150)  CGU 14.8(  5196)
CUC 10.4(  3675)  CCC  7.6(  2664)  CAC  6.2(  2167)  CGC  7.0(  2457)
CUA 15.7(  5532)  CCA  8.7(  3046)  CAA 26.5(  9326)  CGA  5.0(  1759)
CUG  6.3(  2230)  CCG  3.5(  1245)  CAG 12.6(  4432)  CGG  2.2(   788)

AUU 36.4( 12801)  ACU 16.0(  5618)  AAU 28.3(  9945)  AGU 11.1(  3903)
AUC 18.3(  6449)  ACC  9.5(  3337)  AAC 12.5(  4381)  AGC  8.7(  3067)
AUA 16.4(  5768)  ACA 19.5(  6848)  AAA 43.4( 15255)  AGA 11.9(  4201)
AUG 20.0(  7049)  ACG  8.0(  2822)  AAG 19.3(  6777)  AGG  3.7(  1318)

GUU 24.1(  8486)  GCU 33.0( 11594)  GAU 37.3( 13122)  GGU 16.0(  5627)
GUC  8.6(  3012)  GCC 10.1(  3537)  GAC  9.8(  3435)  GGC  9.5(  3341)
GUA 17.7(  6233)  GCA 19.0(  6699)  GAA 44.0( 15478)  GGA 24.7(  8696)
GUG 10.3(  3632)  GCG  8.9(  3119)  GAG 20.5(  7206)  GGG 11.6(  4067)

Coding GC 39.79% 1st letter GC 49.68% 2nd letter GC 37.93% 3rd letter GC 31.76%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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