Bacteroides thetaiotaomicron VPI-5482 [gbbct]: 4816 CDS's (1878135 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 22.6( 42439)  UCU 13.4( 25136)  UAU 32.5( 61054)  UGU  6.8( 12737)
UUC 23.0( 43118)  UCC 10.8( 20258)  UAC 13.9( 26185)  UGC  5.4( 10191)
UUA 12.7( 23856)  UCA  8.6( 16169)  UAA  1.7(  3173)  UGA  0.5(   971)
UUG 21.0( 39406)  UCG  7.8( 14720)  UAG  0.4(   672)  UGG 13.6( 25571)

CUU 14.7( 27668)  CCU 11.6( 21766)  CAU 12.1( 22641)  CGU 17.0( 31950)
CUC  8.6( 16162)  CCC  7.3( 13692)  CAC  6.1( 11440)  CGC  9.1( 17002)
CUA  4.6(  8684)  CCA  4.2(  7936)  CAA 15.0( 28169)  CGA  3.3(  6275)
CUG 28.3( 53230)  CCG 14.6( 27435)  CAG 19.9( 37437)  CGG  6.3( 11741)

AUU 26.1( 48972)  ACU 15.5( 29123)  AAU 31.7( 59602)  AGU 12.0( 22490)
AUC 26.4( 49627)  ACC 14.4( 26987)  AAC 20.7( 38831)  AGC 10.3( 19352)
AUA 16.2( 30465)  ACA 16.0( 29967)  AAA 41.1( 77136)  AGA  7.0( 13056)
AUG 27.0( 50799)  ACG 11.1( 20800)  AAG 25.6( 48059)  AGG  2.8(  5336)

GUU 13.5( 25435)  GCU 20.3( 38117)  GAU 32.8( 61651)  GGU 20.8( 38979)
GUC 10.8( 20242)  GCC 18.7( 35105)  GAC 22.4( 42062)  GGC 13.1( 24678)
GUA 21.8( 40978)  GCA 19.6( 36783)  GAA 46.8( 87867)  GGA 26.8( 50343)
GUG 16.6( 31239)  GCG  9.7( 18153)  GAG 18.2( 34190)  GGG  6.8( 12827)

Coding GC 43.91% 1st letter GC 50.15% 2nd letter GC 36.51% 3rd letter GC 45.07%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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