Aquifex aeolicus VF5 [gbbct]: 1553 CDS's (491074 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number]) 
UUU 28.9( 14194)  UCU  8.9(  4359)  UAU  7.7(  3760)  UGU  3.9(  1897)
UUC 22.4( 11024)  UCC 12.8(  6274)  UAC 33.7( 16537)  UGC  4.0(  1979)
UUA 17.6(  8631)  UCA  7.1(  3502)  UAA  1.6(   789)  UGA  1.2(   571)
UUG  8.1(  3998)  UCG  3.5(  1695)  UAG  0.4(   194)  UGG  9.3(  4590)

CUU 26.9( 13203)  CCU 10.8(  5325)  CAU  2.6(  1287)  CGU  1.5(   744)
CUC 30.8( 15145)  CCC 17.1(  8375)  CAC 12.8(  6285)  CGC  1.2(   609)
CUA  7.7(  3804)  CCA  5.6(  2750)  CAA  7.3(  3590)  CGA  0.6(   275)
CUG 14.5(  7121)  CCG  7.0(  3436)  CAG 13.1(  6432)  CGG  0.8(   379)

AUU 17.4(  8532)  ACU  9.7(  4779)  AAU 10.9(  5350)  AGU  7.8(  3850)
AUC  9.8(  4789)  ACC 11.3(  5559)  AAC 25.1( 12346)  AGC  7.9(  3867)
AUA 45.9( 22535)  ACA  8.7(  4286)  AAA 45.3( 22228)  AGA 19.1(  9389)
AUG 18.7(  9162)  ACG 12.2(  6007)  AAG 48.8( 23970)  AGG 25.9( 12723)

GUU 30.1( 14782)  GCU 15.8(  7763)  GAU 16.2(  7954)  GGU 15.5(  7636)
GUC  8.4(  4130)  GCC 12.4(  6077)  GAC 26.8( 13185)  GGC  8.1(  3966)
GUA 25.4( 12459)  GCA 16.8(  8226)  GAA 62.7( 30766)  GGA 33.5( 16465)
GUG 15.3(  7537)  GCG 13.6(  6702)  GAG 33.4( 16418)  GGG  9.9(  4882)
Coding GC 43.58% 1st letter GC 50.44% 2nd letter GC 32.37% 3rd letter GC 47.93%
Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM
CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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