Vibrio parahaemolyticus RIMD 2210633 [gbbct]: 4832 CDS's (1497215 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 23.9( 35771)  UCU 15.5( 23263)  UAU 11.7( 17561)  UGU  6.5(  9755)
UUC 18.0( 26906)  UCC  4.8(  7179)  UAC 18.6( 27819)  UGC  3.9(  5830)
UUA 17.8( 26687)  UCA 11.5( 17199)  UAA  2.2(  3224)  UGA  0.5(   727)
UUG 23.4( 35058)  UCG  9.2( 13841)  UAG  0.6(   881)  UGG 12.4( 18505)

CUU 17.8( 26710)  CCU 11.7( 17478)  CAU 10.5( 15750)  CGU 18.5( 27768)
CUC  9.5( 14231)  CCC  2.6(  3845)  CAC 11.8( 17705)  CGC 13.6( 20293)
CUA 15.2( 22751)  CCA 16.3( 24411)  CAA 31.8( 47583)  CGA  6.4(  9646)
CUG 18.0( 26998)  CCG  8.2( 12333)  CAG 13.4( 20069)  CGG  1.0(  1540)

AUU 29.7( 44493)  ACU 13.5( 20161)  AAU 16.8( 25172)  AGU 10.7( 15955)
AUC 27.3( 40827)  ACC 14.4( 21556)  AAC 25.7( 38502)  AGC 13.9( 20860)
AUA  4.6(  6901)  ACA 11.9( 17856)  AAA 37.3( 55783)  AGA  3.8(  5747)
AUG 26.7( 39983)  ACG 14.1( 21146)  AAG 16.4( 24568)  AGG  1.2(  1804)

GUU 22.9( 34350)  GCU 20.5( 30663)  GAU 32.6( 48760)  GGU 30.2( 45256)
GUC 12.3( 18448)  GCC 13.0( 19483)  GAC 22.3( 33349)  GGC 24.2( 36239)
GUA 14.8( 22184)  GCA 25.3( 37825)  GAA 42.8( 64033)  GGA  6.9( 10375)
GUG 22.0( 32917)  GCG 26.6( 39839)  GAG 22.4( 33601)  GGG  6.2(  9262)

Coding GC 46.28% 1st letter GC 55.15% 2nd letter GC 37.91% 3rd letter GC 45.78%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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