Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000 [gbbct]: 5616 CDS's (1855630 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 13.0( 24036)  UCU  3.8(  7044)  UAU  9.2( 16997)  UGU  2.5(  4584)
UUC 23.2( 43122)  UCC  9.5( 17703)  UAC 16.3( 30291)  UGC  7.3( 13601)
UUA  2.2(  4173)  UCA  4.5(  8310)  UAA  0.8(  1459)  UGA  1.9(  3506)
UUG 18.0( 33343)  UCG 14.4( 26654)  UAG  0.4(   651)  UGG 13.9( 25795)

CUU  8.8( 16294)  CCU  7.8( 14466)  CAU  9.3( 17209)  CGU 15.5( 28672)
CUC 14.8( 27469)  CCC 10.3( 19027)  CAC 13.6( 25203)  CGC 30.4( 56423)
CUA  2.3(  4261)  CCA  5.9( 10956)  CAA 12.6( 23407)  CGA  4.4(  8216)
CUG 67.4(125106)  CCG 23.9( 44309)  CAG 32.9( 61112)  CGG  8.4( 15504)

AUU 14.4( 26735)  ACU  5.9( 11000)  AAU  9.5( 17666)  AGU  6.6( 12318)
AUC 32.3( 59851)  ACC 27.3( 50617)  AAC 22.3( 41384)  AGC 22.6( 41855)
AUA  2.9(  5394)  ACA  5.0(  9228)  AAA 15.7( 29051)  AGA  2.0(  3731)
AUG 23.3( 43283)  ACG 12.8( 23792)  AAG 21.8( 40461)  AGG  2.8(  5163)

GUU 10.0( 18519)  GCU 13.7( 25510)  GAU 20.9( 38824)  GGU 17.6( 32575)
GUC 24.1( 44720)  GCC 43.4( 80492)  GAC 33.5( 62138)  GGC 44.5( 82643)
GUA  6.3( 11640)  GCA 16.3( 30329)  GAA 30.5( 56516)  GGA  3.9(  7291)
GUG 30.6( 56694)  GCG 32.5( 60304)  GAG 25.8( 47821)  GGG 10.3( 19182)

Coding GC 59.27% 1st letter GC 63.20% 2nd letter GC 43.16% 3rd letter GC 71.44%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
Homepage