Erwinia carotovora subsp. atroseptica SCRI1043 [gbbct]: 4439 CDS's (1448553 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 20.2( 29264)  UCU  9.4( 13590)  UAU 16.9( 24506)  UGU  4.8(  6958)
UUC 17.5( 25313)  UCC  9.5( 13773)  UAC 11.6( 16759)  UGC  5.4(  7803)
UUA 11.9( 17234)  UCA  8.4( 12212)  UAA  1.7(  2473)  UGA  0.9(  1356)
UUG 17.6( 25491)  UCG  9.7( 14086)  UAG  0.4(   610)  UGG 13.8( 19986)

CUU 10.2( 14748)  CCU  9.1( 13201)  CAU 12.1( 17468)  CGU 20.1( 29047)
CUC 10.9( 15739)  CCC  7.4( 10735)  CAC 10.8( 15654)  CGC 20.8( 30068)
CUA  7.3( 10576)  CCA  8.8( 12690)  CAA 15.3( 22166)  CGA  4.4(  6436)
CUG 51.5( 74620)  CCG 18.7( 27079)  CAG 31.7( 45868)  CGG  6.3(  9082)

AUU 28.3( 41058)  ACU  7.1( 10320)  AAU 18.7( 27066)  AGU  8.8( 12680)
AUC 25.7( 37291)  ACC 19.4( 28053)  AAC 19.3( 28022)  AGC 17.6( 25512)
AUA  5.3(  7616)  ACA  7.9( 11503)  AAA 28.4( 41098)  AGA  3.0(  4394)
AUG 25.6( 37056)  ACG 20.8( 30095)  AAG 12.9( 18620)  AGG  1.6(  2320)

GUU 17.4( 25240)  GCU 16.4( 23721)  GAU 34.6( 50172)  GGU 22.0( 31875)
GUC 17.5( 25285)  GCC 25.4( 36854)  GAC 18.3( 26453)  GGC 28.9( 41898)
GUA 10.0( 14468)  GCA 19.9( 28888)  GAA 36.5( 52867)  GGA  8.7( 12606)
GUG 24.9( 36140)  GCG 33.1( 47963)  GAG 18.7( 27101)  GGG 12.2( 17727)

Coding GC 52.19% 1st letter GC 58.99% 2nd letter GC 41.04% 3rd letter GC 56.54%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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