Shewanella oneidensis MR-1 [gbbct]: 4779 CDS's (1421402 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number]) 
UUU 28.7( 40750)  UCU  9.2( 13080)  UAU 19.3( 27439)  UGU  5.8(  8283)
UUC 10.8( 15386)  UCC  6.5(  9216)  UAC 11.3( 15995)  UGC  5.0(  7173)
UUA 33.1( 47078)  UCA 10.7( 15184)  UAA  2.1(  3048)  UGA  0.6(   856)
UUG 17.8( 25334)  UCG  8.0( 11370)  UAG  0.6(   876)  UGG 12.8( 18134)

CUU 14.6( 20682)  CCU 11.8( 16750)  CAU 14.6( 20778)  CGU 16.0( 22743)
CUC 13.7( 19442)  CCC  9.3( 13160)  CAC  8.6( 12265)  CGC 15.6( 22205)
CUA 10.0( 14202)  CCA 12.0( 16994)  CAA 31.7( 45113)  CGA  4.6(  6577)
CUG 19.9( 28337)  CCG  7.3( 10369)  CAG 17.2( 24428)  CGG  3.8(  5428)

AUU 31.0( 44015)  ACU 13.4( 19078)  AAU 23.8( 33860)  AGU 13.9( 19765)
AUC 22.5( 31991)  ACC 21.2( 30202)  AAC 17.3( 24637)  AGC 16.4( 23369)
AUA  6.6(  9413)  ACA  9.6( 13673)  AAA 33.6( 47738)  AGA  4.0(  5632)
AUG 25.2( 35886)  ACG  9.4( 13370)  AAG 18.0( 25594)  AGG  2.4(  3411)

GUU 16.9( 23966)  GCU 19.9( 28329)  GAU 38.0( 53945)  GGU 25.6( 36423)
GUC 13.1( 18558)  GCC 29.9( 42567)  GAC 14.8( 21102)  GGC 26.2( 37268)
GUA 11.7( 16579)  GCA 20.3( 28917)  GAA 35.3( 50207)  GGA  7.0(  9986)
GUG 25.9( 36815)  GCG 23.3( 33115)  GAG 21.8( 30934)  GGG  8.7( 12382)
Coding GC 46.81% 1st letter GC 54.92% 2nd letter GC 39.05% 3rd letter GC 46.46%
Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM
CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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