Pseudomonas fluorescens PfO-1 [gbbct]: 5736 CDS's (1930712 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU  8.2( 15781)  UCU  2.0(  3834)  UAU  7.9( 15232)  UGU  1.8(  3484)
UUC 29.1( 56098)  UCC 10.4( 20081)  UAC 17.5( 33702)  UGC  7.7( 14906)
UUA  1.3(  2456)  UCA  2.4(  4651)  UAA  0.8(  1640)  UGA  1.9(  3589)
UUG 17.5( 33700)  UCG 15.7( 30267)  UAG  0.3(   507)  UGG 14.3( 27602)

CUU  5.0(  9579)  CCU  4.1(  7926)  CAU  7.7( 14849)  CGU 13.7( 26432)
CUC 19.2( 36987)  CCC  8.0( 15510)  CAC 14.9( 28672)  CGC 31.7( 61248)
CUA  1.3(  2582)  CCA  4.5(  8779)  CAA 12.9( 24841)  CGA  3.5(  6773)
CUG 71.7(138498)  CCG 31.9( 61627)  CAG 31.6( 61053)  CGG 10.6( 20423)

AUU 10.7( 20587)  ACU  4.8(  9222)  AAU  7.5( 14573)  AGU  6.0( 11616)
AUC 37.2( 71776)  ACC 32.8( 63255)  AAC 24.5( 47306)  AGC 22.5( 43377)
AUA  1.2(  2295)  ACA  2.9(  5559)  AAA 15.0( 28947)  AGA  1.0(  1977)
AUG 22.6( 43551)  ACG 10.4( 20115)  AAG 21.4( 41290)  AGG  1.3(  2476)

GUU  6.8( 13066)  GCU  9.5( 18357)  GAU 19.8( 38252)  GGU 17.3( 33306)
GUC 24.2( 46796)  GCC 51.5( 99429)  GAC 34.3( 66137)  GGC 47.7( 92061)
GUA  4.2(  8166)  GCA  9.9( 19072)  GAA 33.6( 64813)  GGA  3.9(  7608)
GUG 35.6( 68787)  GCG 36.4( 70229)  GAG 23.1( 44671)  GGG  9.7( 18731)

Coding GC 61.28% 1st letter GC 63.98% 2nd letter GC 43.17% 3rd letter GC 76.70%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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