Pseudomonas syringae pv. syringae B728a [gbbct]: 5089 CDS's (1781948 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 10.7( 19116)  UCU  3.3(  5929)  UAU  9.2( 16325)  UGU  2.3(  4121)
UUC 25.5( 45378)  UCC 10.2( 18159)  UAC 16.3( 29109)  UGC  7.2( 12828)
UUA  1.8(  3259)  UCA  4.0(  7206)  UAA  0.7(  1228)  UGA  1.8(  3282)
UUG 15.6( 27856)  UCG 15.0( 26660)  UAG  0.3(   579)  UGG 13.7( 24379)

CUU  7.6( 13626)  CCU  7.2( 12854)  CAU  9.3( 16582)  CGU 15.4( 27469)
CUC 15.9( 28379)  CCC 10.3( 18393)  CAC 13.3( 23669)  CGC 30.7( 54728)
CUA  1.7(  2991)  CCA  5.2(  9345)  CAA 11.0( 19546)  CGA  3.8(  6702)
CUG 71.4(127296)  CCG 25.0( 44471)  CAG 34.3( 61190)  CGG  8.2( 14622)

AUU 12.8( 22830)  ACU  5.5(  9850)  AAU  9.6( 17190)  AGU  7.0( 12509)
AUC 34.0( 60628)  ACC 28.2( 50282)  AAC 21.9( 39093)  AGC 22.4( 39868)
AUA  2.8(  4910)  ACA  4.4(  7827)  AAA 12.9( 23008)  AGA  1.9(  3390)
AUG 23.5( 41913)  ACG 12.5( 22193)  AAG 22.6( 40346)  AGG  2.9(  5118)

GUU  8.6( 15294)  GCU 12.6( 22525)  GAU 21.3( 37894)  GGU 17.9( 31812)
GUC 25.9( 46145)  GCC 45.5( 81017)  GAC 34.0( 60670)  GGC 44.8( 79808)
GUA  6.4( 11451)  GCA 15.6( 27742)  GAA 30.2( 53770)  GGA  4.3(  7715)
GUG 30.3( 53991)  GCG 32.9( 58690)  GAG 26.4( 47127)  GGG 10.1( 18065)

Coding GC 60.01% 1st letter GC 63.73% 2nd letter GC 43.19% 3rd letter GC 73.10%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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