Clostridium thermocellum ATCC 27405 [gbbct]: 3191 CDS's (1072649 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 31.4( 33708)  UCU  7.9(  8481)  UAU 28.5( 30600)  UGU  5.6(  6020)
UUC 10.8( 11609)  UCC 10.8( 11589)  UAC 13.6( 14622)  UGC  6.0(  6488)
UUA 13.6( 14541)  UCA 11.9( 12797)  UAA  1.6(  1762)  UGA  0.7(   796)
UUG 20.6( 22069)  UCG  6.5(  6968)  UAG  0.6(   633)  UGG  8.8(  9460)

CUU 27.3( 29310)  CCU 10.9( 11646)  CAU  9.6( 10285)  CGU  3.9(  4135)
CUC  5.5(  5946)  CCC  6.6(  7085)  CAC  4.6(  4968)  CGC  2.8(  2988)
CUA  3.1(  3307)  CCA  5.0(  5359)  CAA 10.3( 11015)  CGA  1.9(  1989)
CUG 16.5( 17685)  CCG 11.4( 12219)  CAG 15.3( 16436)  CGG  3.3(  3581)

AUU 36.1( 38715)  ACU 11.8( 12643)  AAU 32.1( 34401)  AGU 10.7( 11506)
AUC 11.7( 12546)  ACC 13.2( 14186)  AAC 21.7( 23283)  AGC 12.4( 13305)
AUA 36.9( 39530)  ACA 16.8( 17970)  AAA 52.2( 55999)  AGA 19.1( 20471)
AUG 24.5( 26236)  ACG  8.5(  9132)  AAG 28.4( 30476)  AGG 12.6( 13476)

GUU 25.6( 27407)  GCU 14.7( 15775)  GAU 32.8( 35175)  GGU 16.9( 18094)
GUC  7.8(  8318)  GCC 15.0( 16131)  GAC 24.1( 25798)  GGC 14.0( 15050)
GUA 20.8( 22260)  GCA 23.0( 24707)  GAA 51.3( 54980)  GGA 27.7( 29764)
GUG 17.2( 18418)  GCG 10.9( 11699)  GAG 24.7( 26502)  GGG  8.0(  8599)

Coding GC 40.34% 1st letter GC 47.23% 2nd letter GC 33.94% 3rd letter GC 39.85%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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