Shigella flexneri 2a str. 301 [gbbct]: 4445 CDS's (1288776 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number]) 
UUU 21.1( 27256)  UCU  8.9( 11441)  UAU 16.1( 20796)  UGU  5.4(  6985)
UUC 16.7( 21502)  UCC  8.9( 11495)  UAC 12.8( 16492)  UGC  6.7(  8645)
UUA 13.3( 17162)  UCA  7.8( 10116)  UAA  2.2(  2812)  UGA  1.0(  1286)
UUG 12.9( 16576)  UCG  8.8( 11385)  UAG  0.3(   349)  UGG 15.5( 19916)

CUU 11.4( 14714)  CCU  7.0(  9066)  CAU 13.2( 16989)  CGU 21.6( 27825)
CUC 11.1( 14331)  CCC  5.4(  6972)  CAC 10.2( 13086)  CGC 22.0( 28299)
CUA  4.1(  5338)  CCA  8.2( 10596)  CAA 14.6( 18854)  CGA  3.9(  4978)
CUG 53.2( 68540)  CCG 22.5( 28953)  CAG 29.3( 37729)  CGG  6.5(  8338)

AUU 28.6( 36863)  ACU  9.3( 12029)  AAU 17.7( 22794)  AGU  9.1( 11735)
AUC 24.5( 31588)  ACC 21.8( 28076)  AAC 21.3( 27478)  AGC 15.7( 20194)
AUA  5.1(  6538)  ACA  7.8( 10014)  AAA 34.4( 44339)  AGA  3.0(  3897)
AUG 27.5( 35503)  ACG 14.4( 18582)  AAG 11.3( 14505)  AGG  2.1(  2664)

GUU 18.3( 23526)  GCU 16.0( 20634)  GAU 31.0( 40003)  GGU 24.3( 31311)
GUC 15.1( 19438)  GCC 25.0( 32259)  GAC 19.1( 24593)  GGC 28.1( 36250)
GUA 11.0( 14184)  GCA 20.3( 26107)  GAA 39.5( 50865)  GGA  8.9( 11460)
GUG 25.9( 33443)  GCG 31.8( 40984)  GAG 18.7( 24144)  GGG 10.8( 13954)
Coding GC 51.74% 1st letter GC 58.80% 2nd letter GC 40.85% 3rd letter GC 55.58%
Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM
CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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