Nocardioides sp. JS614 [gbbct]: 4937 CDS's (1614681 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU  0.5(   772)  UCU  0.8(  1293)  UAU  0.9(  1449)  UGU  0.7(  1169)
UUC 27.1( 43750)  UCC 15.2( 24524)  UAC 18.9( 30477)  UGC  6.9( 11064)
UUA  0.1(   123)  UCA  1.2(  1982)  UAA  0.1(   114)  UGA  2.5(  3998)
UUG  3.5(  5702)  UCG 18.0( 29124)  UAG  0.5(   825)  UGG 15.2( 24568)

CUU  1.8(  2919)  CCU  1.9(  3000)  CAU  1.7(  2764)  CGU  4.9(  7962)
CUC 43.4( 70126)  CCC 19.6( 31618)  CAC 21.1( 34002)  CGC 35.8( 57804)
CUA  0.8(  1225)  CCA  2.1(  3349)  CAA  1.5(  2430)  CGA  4.2(  6817)
CUG 53.1( 85818)  CCG 32.9( 53072)  CAG 26.2( 42277)  CGG 31.2( 50420)

AUU  0.7(  1096)  ACU  1.4(  2298)  AAU  0.7(  1077)  AGU  1.3(  2156)
AUC 33.8( 54617)  ACC 39.2( 63310)  AAC 16.8( 27091)  AGC 14.4( 23234)
AUA  0.2(   265)  ACA  1.4(  2195)  AAA  0.4(   695)  AGA  0.5(   833)
AUG 17.1( 27682)  ACG 17.8( 28771)  AAG 18.1( 29163)  AGG  2.4(  3834)

GUU  1.9(  3028)  GCU  4.6(  7465)  GAU  4.2(  6748)  GGU  8.8( 14178)
GUC 53.0( 85575)  GCC 67.8(109408)  GAC 59.5( 96140)  GGC 58.2( 94005)
GUA  1.6(  2602)  GCA  6.1(  9910)  GAA  3.6(  5888)  GGA  5.5(  8824)
GUG 37.4( 60321)  GCG 53.7( 86697)  GAG 54.0( 87213)  GGG 19.7( 31825)

Coding GC 71.64% 1st letter GC 72.18% 2nd letter GC 49.59% 3rd letter GC 93.15%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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