Clostridium perfringens str. 13 [gbbct]: 2723 CDS's (858710 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 36.9( 31694)  UCU 15.9( 13640)  UAU 33.5( 28731)  UGU  8.9(  7621)
UUC  8.9(  7609)  UCC  2.2(  1913)  UAC  6.5(  5617)  UGC  2.3(  1970)
UUA 61.7( 52949)  UCA 20.0( 17153)  UAA  2.4(  2030)  UGA  0.1(    99)
UUG  3.8(  3293)  UCG  0.4(   318)  UAG  0.7(   594)  UGG  6.9(  5942)

CUU 19.0( 16338)  CCU 11.8( 10096)  CAU 10.4(  8938)  CGU  1.1(   965)
CUC  0.5(   392)  CCC  0.5(   467)  CAC  2.5(  2106)  CGC  0.1(    81)
CUA  7.9(  6774)  CCA 14.5( 12439)  CAA 16.9( 14533)  CGA  0.2(   176)
CUG  0.5(   411)  CCG  0.4(   329)  CAG  2.7(  2320)  CGG  0.0(    24)

AUU 31.7( 27201)  ACU 23.2( 19937)  AAU 52.6( 45193)  AGU 18.1( 15518)
AUC  4.3(  3707)  ACC  2.8(  2392)  AAC 11.1(  9562)  AGC  5.3(  4582)
AUA 59.4( 50993)  ACA 19.3( 16549)  AAA 64.7( 55519)  AGA 28.6( 24593)
AUG 24.7( 21180)  ACG  0.7(   622)  AAG 28.0( 24085)  AGG  3.2(  2717)

GUU 34.1( 29291)  GCU 29.2( 25103)  GAU 48.1( 41293)  GGU 18.7( 16087)
GUC  1.4(  1163)  GCC  4.1(  3495)  GAC  7.1(  6063)  GGC  3.4(  2937)
GUA 26.2( 22487)  GCA 19.9( 17052)  GAA 62.6( 53772)  GGA 38.8( 33343)
GUG  3.7(  3180)  GCG  1.1(   972)  GAG 18.5( 15917)  GGG  5.4(  4643)

Coding GC 29.41% 1st letter GC 41.13% 2nd letter GC 30.72% 3rd letter GC 16.37%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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