Streptomyces violaceoruber [gbbct]: 170 CDS's (41109 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number]) 
UUU  0.9(    38)  UCU  1.1(    47)  UAU  1.3(    53)  UGU  1.3(    54)
UUC 22.5(   926)  UCC 16.9(   695)  UAC 18.0(   740)  UGC  9.4(   388)
UUA  0.2(     7)  UCA  2.0(    82)  UAA  0.0(     2)  UGA  3.4(   138)
UUG  4.3(   177)  UCG 12.3(   507)  UAG  0.7(    30)  UGG 18.0(   739)

CUU  3.5(   142)  CCU  3.7(   154)  CAU  2.8(   117)  CGU  8.0(   327)
CUC 35.6(  1465)  CCC 25.3(  1042)  CAC 23.1(   949)  CGC 41.5(  1707)
CUA  1.1(    44)  CCA  3.4(   139)  CAA  3.0(   122)  CGA  4.8(   197)
CUG 51.5(  2116)  CCG 34.4(  1413)  CAG 29.1(  1196)  CGG 29.5(  1213)

AUU  1.3(    54)  ACU  2.6(   106)  AAU  1.1(    45)  AGU  2.2(    92)
AUC 27.9(  1148)  ACC 38.1(  1568)  AAC 15.8(   650)  AGC 14.6(   602)
AUA  0.9(    39)  ACA  3.2(   133)  AAA  1.9(    79)  AGA  0.8(    34)
AUG 15.3(   627)  ACG 18.9(   777)  AAG 20.9(   859)  AGG  4.9(   202)

GUU  2.6(   107)  GCU  7.7(   317)  GAU  5.8(   240)  GGU  9.1(   374)
GUC 40.9(  1681)  GCC 75.5(  3103)  GAC 55.9(  2297)  GGC 48.2(  1980)
GUA  3.0(   125)  GCA  9.8(   402)  GAA 12.9(   530)  GGA  7.7(   316)
GUG 28.9(  1186)  GCG 46.2(  1901)  GAG 46.5(  1913)  GGG 16.0(   656)
Coding GC 70.81% 1st letter GC 71.69% 2nd letter GC 52.07% 3rd letter GC 88.67%
Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM
CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS (format)
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