Methanopyrus kandleri AV19 [gbbct]: 1687 CDS's (502811 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU  2.4(  1182)  UCU  2.9(  1434)  UAU  3.1(  1569)  UGU  4.7(  2375)
UUC 26.3( 13218)  UCC 13.7(  6891)  UAC 25.0( 12564)  UGC  8.4(  4234)
UUA  5.3(  2650)  UCA  3.6(  1786)  UAA  0.8(   387)  UGA  2.0(   986)
UUG 11.3(  5706)  UCG 14.2(  7161)  UAG  0.6(   321)  UGG 12.3(  6209)

CUU  5.6(  2825)  CCU  5.5(  2787)  CAU  3.9(  1951)  CGU 11.2(  5631)
CUC 35.0( 17616)  CCC 18.1(  9087)  CAC 15.4(  7726)  CGC 16.2(  8128)
CUA  9.1(  4566)  CCA  4.9(  2460)  CAA  3.2(  1627)  CGA 10.6(  5326)
CUG 35.3( 17761)  CCG 25.9( 13045)  CAG 10.8(  5430)  CGG 22.4( 11265)

AUU  4.7(  2357)  ACU  4.3(  2172)  AAU  2.5(  1270)  AGU  3.7(  1865)
AUC 33.9( 17058)  ACC 18.4(  9272)  AAC 16.6(  8333)  AGC  8.0(  4024)
AUA  9.5(  4772)  ACA  3.6(  1811)  AAA  9.3(  4690)  AGA  5.9(  2976)
AUG 16.6(  8338)  ACG 19.4(  9773)  AAG 30.8( 15469)  AGG 16.9(  8496)

GUU  9.9(  4997)  GCU  9.2(  4622)  GAU 16.1(  8110)  GGU 21.9( 11033)
GUC 37.7( 18970)  GCC 34.3( 17223)  GAC 41.7( 20947)  GGC 19.3(  9713)
GUA 14.4(  7228)  GCA  6.4(  3199)  GAA 25.8( 12979)  GGA 17.7(  8883)
GUG 43.2( 21712)  GCG 33.3( 16763)  GAG 73.8( 37126)  GGG 21.3( 10726)

Coding GC 61.20% 1st letter GC 65.92% 2nd letter GC 42.03% 3rd letter GC 75.64%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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