Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis [gbbct]: 91 CDS's (28088 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number]) 
UUU  3.2(    91)  UCU  1.5(    41)  UAU  4.2(   117)  UGU  0.8(    23)
UUC 22.3(   627)  UCC 14.0(   393)  UAC 19.9(   559)  UGC  5.6(   156)
UUA  0.6(    17)  UCA  1.5(    41)  UAA  0.4(    12)  UGA  2.3(    64)
UUG 12.6(   353)  UCG 19.2(   539)  UAG  0.5(    15)  UGG 12.8(   359)

CUU  4.9(   138)  CCU  2.9(    81)  CAU  4.3(   120)  CGU  5.7(   160)
CUC 18.3(   514)  CCC 20.6(   578)  CAC 16.6(   467)  CGC 39.4(  1106)
CUA  1.2(    33)  CCA  4.1(   115)  CAA  9.3(   262)  CGA  7.9(   222)
CUG 54.4(  1528)  CCG 31.2(   877)  CAG 27.2(   763)  CGG 19.5(   547)

AUU  4.7(   131)  ACU  3.9(   109)  AAU  3.3(    92)  AGU  2.8(    78)
AUC 36.8(  1035)  ACC 37.6(  1057)  AAC 25.0(   703)  AGC 17.3(   487)
AUA  1.2(    33)  ACA  2.3(    65)  AAA  6.4(   181)  AGA  0.6(    17)
AUG 17.9(   503)  ACG 15.6(   438)  AAG 21.0(   590)  AGG  1.8(    50)

GUU  5.5(   155)  GCU 10.7(   300)  GAU 11.9(   334)  GGU 12.4(   348)
GUC 32.3(   907)  GCC 72.5(  2037)  GAC 47.5(  1334)  GGC 53.5(  1502)
GUA  2.9(    82)  GCA  9.1(   255)  GAA 13.7(   385)  GGA  8.5(   240)
GUG 34.4(   966)  GCG 51.0(  1432)  GAG 30.8(   864)  GGG 16.4(   460)
Coding GC 67.69% 1st letter GC 68.04% 2nd letter GC 50.47% 3rd letter GC 84.54%
Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM
CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS (format)
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