Streptococcus pneumoniae [gbbct]: 5396 CDS's (1850682 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 33.9( 62731)  UCU 17.8( 32879)  UAU 30.4( 56264)  UGU  4.0(  7343)
UUC 12.0( 22282)  UCC  5.2(  9574)  UAC 13.4( 24848)  UGC  1.3(  2360)
UUA 23.5( 43444)  UCA 14.8( 27302)  UAA  1.7(  3183)  UGA  0.5(   879)
UUG 26.5( 49010)  UCG  4.3(  7950)  UAG  0.7(  1334)  UGG  9.5( 17651)

CUU 17.9( 33101)  CCU 11.5( 21212)  CAU 12.0( 22276)  CGU 16.3( 30243)
CUC  9.8( 18126)  CCC  2.7(  5063)  CAC  5.3(  9740)  CGC  6.1( 11343)
CUA 11.9( 21953)  CCA 14.7( 27176)  CAA 24.5( 45388)  CGA  5.1(  9526)
CUG  8.4( 15577)  CCG  3.5(  6539)  CAG 13.3( 24593)  CGG  2.1(  3978)

AUU 41.5( 76724)  ACU 18.7( 34644)  AAU 36.0( 66707)  AGU 15.9( 29344)
AUC 21.2( 39144)  ACC 12.3( 22831)  AAC 13.6( 25238)  AGC  7.5( 13826)
AUA 11.0( 20311)  ACA 20.3( 37542)  AAA 46.7( 86451)  AGA  8.3( 15312)
AUG 23.7( 43880)  ACG  6.8( 12613)  AAG 25.8( 47836)  AGG  2.3(  4202)

GUU 28.4( 52556)  GCU 28.1( 52036)  GAU 39.7( 73439)  GGU 24.8( 45863)
GUC 13.9( 25734)  GCC 13.1( 24302)  GAC 14.8( 27352)  GGC  8.6( 15837)
GUA 15.8( 29244)  GCA 18.8( 34753)  GAA 47.5( 87905)  GGA 21.3( 39409)
GUG 11.7( 21722)  GCG  7.6( 13994)  GAG 20.3( 37615)  GGG  9.4( 17448)

Coding GC 38.97% 1st letter GC 48.90% 2nd letter GC 34.31% 3rd letter GC 33.69%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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