Prochlorococcus marinus subsp. marinus str. CCMP1375 [gbbct]: 1882 CDS's (518638 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 30.5( 15798)  UCU 22.5( 11673)  UAU 19.1(  9904)  UGU  7.7(  3971)
UUC 10.1(  5224)  UCC  5.0(  2584)  UAC  5.3(  2739)  UGC  4.5(  2337)
UUA 39.5( 20482)  UCA 20.1( 10435)  UAA  2.1(  1085)  UGA  0.9(   450)
UUG 18.8(  9734)  UCG  3.1(  1631)  UAG  0.7(   347)  UGG 14.6(  7549)

CUU 30.6( 15863)  CCU 20.3( 10503)  CAU 14.3(  7433)  CGU  7.9(  4099)
CUC  6.0(  3109)  CCC  3.5(  1806)  CAC  3.8(  1945)  CGC  3.8(  1946)
CUA 15.6(  8093)  CCA 16.7(  8663)  CAA 28.5( 14764)  CGA  6.5(  3372)
CUG  4.9(  2552)  CCG  1.9(  1001)  CAG  8.1(  4181)  CGG  1.3(   661)

AUU 40.7( 21100)  ACU 20.2( 10471)  AAU 39.1( 20256)  AGU 17.4(  9048)
AUC 10.6(  5487)  ACC  5.4(  2787)  AAC 10.5(  5462)  AGC  8.7(  4512)
AUA 26.6( 13814)  ACA 18.3(  9517)  AAA 47.5( 24661)  AGA 22.4( 11627)
AUG 18.5(  9588)  ACG  2.9(  1487)  AAG 18.2(  9457)  AGG  7.3(  3771)

GUU 27.3( 14150)  GCU 28.0( 14511)  GAU 39.0( 20220)  GGU 21.5( 11155)
GUC  7.0(  3616)  GCC  7.3(  3811)  GAC 10.2(  5305)  GGC 11.2(  5798)
GUA 17.1(  8863)  GCA 28.9( 15007)  GAA 47.4( 24563)  GGA 26.2( 13592)
GUG  5.8(  3032)  GCG  4.5(  2352)  GAG 16.7(  8679)  GGG  9.7(  5005)

Coding GC 37.04% 1st letter GC 48.14% 2nd letter GC 38.01% 3rd letter GC 24.97%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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