Pseudomonas putida [gbbct]: 6891 CDS's (2266762 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU  7.3( 16643)  UCU  2.7(  6008)  UAU  7.2( 16352)  UGU  2.1(  4657)
UUC 28.2( 63984)  UCC  8.7( 19764)  UAC 18.3( 41515)  UGC  8.6( 19420)
UUA  1.5(  3409)  UCA  3.0(  6902)  UAA  0.7(  1525)  UGA  2.0(  4562)
UUG 16.4( 37276)  UCG 13.9( 31597)  UAG  0.4(   804)  UGG 14.4( 32681)

CUU  7.3( 16535)  CCU  6.0( 13687)  CAU  8.1( 18365)  CGU 12.7( 28781)
CUC 14.9( 33870)  CCC 11.4( 25776)  CAC 15.5( 35229)  CGC 36.0( 81497)
CUA  2.7(  6183)  CCA  7.1( 16042)  CAA 10.9( 24676)  CGA  3.4(  7651)
CUG 71.6(162266)  CCG 24.3( 55081)  CAG 35.1( 79469)  CGG 10.3( 23257)

AUU  9.7( 22031)  ACU  4.7( 10676)  AAU  6.7( 15079)  AGU  5.2( 11881)
AUC 34.4( 77875)  ACC 31.0( 70177)  AAC 23.3( 52817)  AGC 23.1( 52465)
AUA  2.1(  4785)  ACA  3.6(  8205)  AAA  9.9( 22530)  AGA  1.2(  2645)
AUG 23.1( 52389)  ACG  8.9( 20190)  AAG 24.5( 55631)  AGG  2.3(  5286)

GUU  7.5( 16932)  GCU 12.1( 27420)  GAU 16.6( 37515)  GGU 16.4( 37240)
GUC 21.4( 48528)  GCC 56.7(128572)  GAC 36.5( 82685)  GGC 48.9(110770)
GUA  7.5( 16955)  GCA 13.7( 30985)  GAA 27.1( 61508)  GGA  3.3(  7395)
GUG 36.2( 82121)  GCG 28.3( 64235)  GAG 29.6( 67176)  GGG 11.7( 26599)

Coding GC 61.88% 1st letter GC 65.07% 2nd letter GC 43.77% 3rd letter GC 76.81%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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