Treponema pallidum [gbbct]: 33 CDS's (17316 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 26.8(   464)  UCU 16.1(   278)  UAU 28.0(   485)  UGU 10.2(   176)
UUC 18.7(   324)  UCC 11.7(   202)  UAC 14.7(   255)  UGC  2.8(    48)
UUA  7.6(   131)  UCA  5.5(    95)  UAA  0.1(     1)  UGA  0.1(     2)
UUG 17.7(   306)  UCG  8.3(   144)  UAG  1.7(    30)  UGG 23.2(   402)

CUU  9.8(   169)  CCU  8.4(   145)  CAU  7.5(   130)  CGU 16.1(   278)
CUC 16.3(   282)  CCC  7.9(   136)  CAC 10.2(   176)  CGC  8.5(   148)
CUA  4.3(    75)  CCA  7.8(   135)  CAA  9.8(   170)  CGA  3.9(    67)
CUG 22.9(   397)  CCG 15.3(   265)  CAG 21.4(   370)  CGG 11.7(   202)

AUU 23.2(   402)  ACU 11.1(   193)  AAU 17.3(   300)  AGU 10.9(   188)
AUC 10.6(   183)  ACC 19.8(   342)  AAC 20.0(   346)  AGC 12.9(   224)
AUA  6.2(   108)  ACA  5.9(   102)  AAA 17.8(   309)  AGA  2.5(    43)
AUG 13.5(   234)  ACG 22.1(   382)  AAG 48.3(   836)  AGG  3.6(    63)

GUU 16.3(   282)  GCU 16.8(   291)  GAU 27.6(   478)  GGU 22.3(   386)
GUC 12.6(   218)  GCC 28.6(   496)  GAC 19.3(   335)  GGC 24.2(   419)
GUA 14.8(   257)  GCA 26.4(   458)  GAA 16.7(   290)  GGA 22.8(   395)
GUG 36.1(   625)  GCG 23.8(   412)  GAG 39.0(   676)  GGG 32.1(   555)

Coding GC 52.79% 1st letter GC 56.12% 2nd letter GC 44.31% 3rd letter GC 57.94%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS (format)
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