Porcine circovirus 1 [gbvrl]: 50 CDS's (12965 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 29.6(   384)  UCU  8.6(   112)  UAU 27.4(   355)  UGU  8.1(   105)
UUC 20.7(   269)  UCC 18.3(   237)  UAC 24.1(   312)  UGC  6.2(    81)
UUA  3.5(    46)  UCA  4.1(    53)  UAA  1.7(    22)  UGA  2.2(    28)
UUG 22.0(   285)  UCG  1.9(    24)  UAG  0.0(     0)  UGG 28.8(   373)

CUU 16.5(   214)  CCU 18.0(   233)  CAU  7.4(    96)  CGU  8.6(   112)
CUC 16.4(   212)  CCC 30.5(   396)  CAC 18.4(   239)  CGC 17.7(   229)
CUA  8.5(   110)  CCA 18.3(   237)  CAA 16.2(   210)  CGA  4.1(    53)
CUG 12.6(   164)  CCG  6.7(    87)  CAG 27.9(   362)  CGG  9.6(   124)

AUU 13.3(   172)  ACU 24.1(   312)  AAU 33.9(   439)  AGU  7.6(    99)
AUC 15.8(   205)  ACC 28.0(   363)  AAC 21.2(   275)  AGC 15.5(   201)
AUA 11.3(   147)  ACA  8.2(   106)  AAA 29.5(   383)  AGA 27.1(   351)
AUG  5.8(    75)  ACG  8.9(   115)  AAG 28.6(   371)  AGG 14.3(   186)

GUU 16.0(   207)  GCU 21.1(   274)  GAU 16.2(   210)  GGU 13.3(   172)
GUC  5.7(    74)  GCC 19.9(   258)  GAC 16.5(   214)  GGC 18.1(   235)
GUA 17.9(   232)  GCA  5.9(    77)  GAA 29.4(   381)  GGA 17.8(   231)
GUG 16.3(   211)  GCG  5.7(    74)  GAG 28.0(   363)  GGG 14.5(   188)

Coding GC 48.87% 1st letter GC 49.97% 2nd letter GC 44.17% 3rd letter GC 52.46%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS (format)
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