Helicobacter pylori [gbbct]: 1724 CDS's (700694 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 36.3( 25435)  UCU 17.1( 12015)  UAU 24.6( 17216)  UGU  3.7(  2568)
UUC 13.5(  9490)  UCC  5.9(  4162)  UAC 11.4(  7982)  UGC  5.5(  3839)
UUA 31.1( 21818)  UCA  9.7(  6811)  UAA  1.4(   988)  UGA  0.6(   447)
UUG 24.5( 17140)  UCG  2.8(  1981)  UAG  0.4(   289)  UGG  6.4(  4463)

CUU 15.6( 10944)  CCU 14.6( 10223)  CAU 10.8(  7583)  CGU  3.6(  2551)
CUC 10.4(  7302)  CCC  5.9(  4120)  CAC  5.5(  3843)  CGC  4.7(  3316)
CUA  9.9(  6957)  CCA  5.2(  3658)  CAA 36.7( 25705)  CGA  3.3(  2298)
CUG  3.5(  2466)  CCG  2.1(  1461)  CAG  5.6(  3958)  CGG  0.8(   531)

AUU 30.1( 21066)  ACU 17.2( 12071)  AAU 49.9( 34948)  AGU 12.2(  8519)
AUC 23.3( 16301)  ACC 13.5(  9438)  AAC 30.7( 21496)  AGC 23.4( 16421)
AUA 11.5(  8054)  ACA 12.7(  8874)  AAA 70.4( 49324)  AGA 12.5(  8736)
AUG 20.7( 14499)  ACG  7.6(  5308)  AAG 22.7( 15894)  AGG  8.1(  5653)

GUU 16.6( 11605)  GCU 31.7( 22242)  GAU 39.1( 27400)  GGU 15.2( 10637)
GUC  7.8(  5436)  GCC 12.2(  8579)  GAC 14.2(  9944)  GGC 18.6( 13028)
GUA  8.7(  6071)  GCA 13.0(  9144)  GAA 45.9( 32181)  GGA 10.4(  7259)
GUG 20.7( 14525)  GCG 14.1(  9853)  GAG 17.1( 11964)  GGG 15.2( 10664)

Coding GC 38.23% 1st letter GC 43.88% 2nd letter GC 32.95% 3rd letter GC 37.87%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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