Pichia pastoris [gbpln]: 137 CDS's (81301 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU F 0.54 24.1 ( 1963) UCU S 0.29 24.4 ( 1983) UAU Y 0.47 16.0 ( 1300) UGU C 0.64 7.7 ( 626)
UUC F 0.46 20.6 ( 1675) UCC S 0.20 16.5 ( 1344) UAC Y 0.53 18.1 ( 1473) UGC C 0.36 4.4 ( 356)
UUA L 0.16 15.6 ( 1265) UCA S 0.18 15.2 ( 1234) UAA * 0.72 0.8 ( 69) UGA * 0.28 0.3 ( 27)
UUG L 0.33 31.5 ( 2562) UCG S 0.09 7.4 ( 598) UAG Q 0.01 0.5 ( 40) UGG W 1.00 10.3 ( 834)
CUU L 0.16 15.9 ( 1289) CCU P 0.35 15.8 ( 1282) CAU H 0.57 11.8 ( 960) CGU R 0.17 6.9 ( 564)
CUC L 0.08 7.6 ( 620) CCC P 0.15 6.8 ( 553) CAC H 0.43 9.1 ( 737) CGC R 0.05 2.2 ( 175)
CUA L 0.11 10.7 ( 873) CCA P 0.42 18.9 ( 1540) CAA Q 0.60 25.4 ( 2069) CGA R 0.10 4.2 ( 340)
CUG L 0.16 14.9 ( 1215) CCG P 0.09 3.9 ( 320) CAG Q 0.39 16.3 ( 1323) CGG R 0.05 1.9 ( 158)
AUU I 0.50 31.1 ( 2532) ACU T 0.40 22.4 ( 1820) AAU N 0.48 25.1 ( 2038) AGU S 0.15 12.5 ( 1020)
AUC I 0.31 19.4 ( 1580) ACC T 0.26 14.5 ( 1175) AAC N 0.52 26.7 ( 2168) AGC S 0.09 7.6 ( 621)
AUA I 0.18 11.1 ( 906) ACA T 0.24 13.8 ( 1118) AAA K 0.47 29.9 ( 2433) AGA R 0.48 20.1 ( 1634)
AUG M 1.00 18.7 ( 1517) ACG T 0.11 6.0 ( 491) AAG K 0.53 33.8 ( 2748) AGG R 0.16 6.6 ( 539)
GUU V 0.42 26.9 ( 2188) GCU A 0.45 28.9 ( 2351) GAU D 0.58 35.7 ( 2899) GGU G 0.44 25.5 ( 2075)
GUC V 0.23 14.9 ( 1210) GCC A 0.26 16.6 ( 1348) GAC D 0.42 25.9 ( 2103) GGC G 0.14 8.1 ( 655)
GUA V 0.15 9.9 ( 804) GCA A 0.23 15.1 ( 1228) GAA E 0.56 37.4 ( 3043) GGA G 0.33 19.1 ( 1550)
GUG V 0.19 12.3 ( 998) GCG A 0.06 3.9 ( 314) GAG E 0.44 29.0 ( 2360) GGG G 0.10 5.8 ( 468)
Coding GC 42.73%
1st letter GC 48.72%
2nd letter GC 37.32%
3rd letter GC 42.16%
Genetic code 15: Blepharisma Nuclear Code
List of codon usage for each CDS
(format)
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