# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -H -O./tmp/as00106.fasta.huge -Q ../query/FLJ00106.ptfa ./tmplib.10216 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 FLJ00106, 379 aa vs ./tmplib.10216 library 2210615 residues in 2457 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4845+/-0.00662; mu= 7.1407+/- 0.443 mean_var=294.1798+/-66.852, 0's: 0 Z-trim: 4 B-trim: 4 in 1/39 Lambda= 0.074777 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2457) KIAA0613 ( 734 res) hg01088b ( 734) 313 46.6 6.5e-06 KIAA0705 ( 1483 res) hg03359s1 (1483) 225 37.5 0.0069 KIAA1634 ( 874 res) fh21781(revised) ( 874) 161 30.3 0.62 KIAA1202 ( 1502 res) fg03353 (1502) 161 30.6 0.83 KIAA0807 ( 1329 res) hk04449(revised) (1329) 158 30.2 0.97 KIAA0561 ( 1308 res) hh01676 (1308) 157 30.1 1 KIAA0973 ( 1583 res) hj06871 (1583) 157 30.2 1.2 KIAA1757 ( 1409 res) fh19225(revised) (1409) 151 29.5 1.7 KIAA1719 ( 1050 res) pf00330s1 (1050) 147 28.9 1.9 KIAA0303 ( 2137 res) hg00009 (2137) 142 28.8 4.2 KIAA0147 ( 1630 res) ha01022s1 (1630) 138 28.2 4.9 KIAA1522 ( 1044 res) fh14706(revised) (1044) 133 27.4 5.5 KIAA1339 ( 409 res) fj00071 ( 409) 124 25.8 6.4 KIAA1668 ( 791 res) fh11717 ( 791) 127 26.6 7.4 FLJ00084 ( 641 res) as00084 ( 641) 125 26.2 7.6 KIAA1862 ( 1070 res) aj00563 (1070) 124 26.4 11 KIAA1858 ( 2469 res) ae00147 (2469) 130 27.6 11 KIAA0164 ( 929 res) ha02373 ( 929) 122 26.1 12 KIAA0905 ( 1229 res) hk10341 (1229) 124 26.5 12 KIAA0149 ( 830 res) ha01221 ( 830) 120 25.8 13 KIAA1509 ( 1365 res) fh14721 (1365) 122 26.4 15 KIAA1193 ( 544 res) fg00739 ( 544) 114 24.9 16 KIAA0356 ( 1058 res) hh00006s1 (1058) 117 25.7 18 KIAA1526 ( 963 res) fj04743(revised) ( 963) 114 25.3 22 KIAA1986 ( 334 res) pg00636 ( 334) 106 23.8 22 KIAA1343 ( 520 res) fj00420 ( 520) 109 24.4 22 KIAA1814 ( 1285 res) ph00952 (1285) 115 25.6 24 KIAA1874 ( 579 res) hk07257s1 ( 579) 109 24.4 24 KIAA1575 ( 1010 res) fj01374s1 (1010) 113 25.2 24 KIAA0200 ( 1042 res) ha02508 (1042) 113 25.2 24 KIAA1444 ( 416 res) fg03469a ( 416) 106 23.9 25 FLJ00192 ( 1437 res) sj02564 (1437) 115 25.7 25 KIAA0290 ( 906 res) ha06644 ( 906) 111 24.9 26 KIAA1015 ( 841 res) hk03609(revised) ( 841) 110 24.8 27 KIAA0751 ( 1200 res) hk04424 (1200) 112 25.2 29 KIAA0488 ( 523 res) af14633 ( 523) 105 23.9 30 KIAA0985 ( 697 res) hj08038 ( 697) 106 24.2 33 KIAA1782 ( 545 res) aj00273 ( 545) 104 23.9 33 FLJ00201 ( 705 res) sj04110 ( 705) 105 24.1 36 KIAA0473 ( 937 res) hh00220 ( 937) 107 24.5 36 KIAA0900 ( 503 res) hk09606s1 ( 503) 102 23.6 37 KIAA1139 ( 1124 res) hk00330 (1124) 108 24.7 37 KIAA1232 ( 520 res) fh08445 ( 520) 102 23.6 38 KIAA0465 ( 4433 res) hg01123s2 (4433) 118 26.7 38 FLJ00066 ( 162 res) as00066 ( 162) 93 21.9 38 KIAA1439 ( 561 res) hg01641b ( 561) 101 23.5 42 KIAA1039 ( 444 res) fh02337 ( 444) 99 23.2 43 KIAA1217 ( 1339 res) fh03001s1 (1339) 107 24.7 44 KIAA1250 ( 1777 res) pf01137 (1777) 109 25.1 44 KIAA0442 ( 1266 res) hh03913 (1266) 106 24.6 46 >>KIAA0613 ( 734 res) hg01088b (734 aa) initn: 381 init1: 273 opt: 313 Z-score: 199.5 bits: 46.6 E(): 6.5e-06 Smith-Waterman score: 340; 28.986% identity (53.333% similar) in 345 aa overlap (11-310:5-347) 10 20 30 40 50 60 FLJ001 GHGLHLLVLSSSGMALTVDVAGPAPWGFRITGGRDFHTPIMVTKVAERGKAKDADLRPGD :..:. .: ..::.:::::. ::.::. :. ..... .:: ...: :: KIAA06 AAADSTSMSYSVTLTGPGPWGFRLQGGKDFNMPLTISRITPGSKAAQSQLSQGD 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 FLJ001 IIVAINGESAEGMLHAEAQSKIRQSPSPLRLQLDRSQATSPGQTNG---DSSLEVL---- ..:::.: ... : : :::.::... : : :..:. : .:.. .. : :. KIAA06 LVVAIDGVNTDTMTHLEAQNKIKSASYNLSLTLQKSKRPIPISTTAPPVQTPLPVIPHQK 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 FLJ001 --ATRFQGSVRTYTESQSSLRSSYSSPTS--LSPRAGSPFSPPPSSSSLT--GEAAISRS : .::. . . : . :.: ..: . : : . :: : . :::. .. . :. KIAA06 DPALDTNGSLVAPSPSPEA-RASPGTPGTPELRPTFSPAFSRPSAFSSLAEASDPGPPRA 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 FLJ001 FQSLACSPGLPAADRLSYSGRPGSRQA-------GLGRAGDSAVLVLPPSPGPRSSRPSM :: : : :. .. ::: : :: : .. . . :.. .. KIAA06 SLRAKTSPE-GARDLLGPKALPGSSQPRQYNNPIGLYSAETLREMAQMYQMSLRGKASGV 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 FLJ001 DSEGGSL-----LLDEDSEVFKML---QENREGRA---APR----QSSSFRLLQEAL--- :::: .: : :.. . :.. : .: : : :: :::.: . KIAA06 GLPGGSLPIKDLAVDSASPVYQAVIKSQNKPEDEADEWARRSSNLQSRSFRILAQMTGTE 240 250 260 270 280 290 270 280 290 300 310 FLJ001 -------EAEERGGTPAFLPSSLSPQSSLPASRALATPPKLHTCEKCSTSIANQAVRIQE :: .:..:: . :.. : : : :: . : .:. : KIAA06 FMQDPDEEALRRSSTPIEHAPVCTSQATTPLLPASAQPPAAASPSAASPPLATAAAHTAI 300 310 320 330 340 350 320 330 340 350 360 370 FLJ001 GRYRHPGCYTCADCGLNLKMRGHFWEDACAMEGMRLSLEALEGMVEGAKRRDRRKTRRPI KIAA06 ASASTTAPASSPADSPRPQASSYSPAVAASSAPATHTSYSEGPAAPAPKPRVVTTASIRP 360 370 380 390 400 410 >>KIAA0705 ( 1483 res) hg03359s1 (1483 aa) initn: 333 init1: 100 opt: 225 Z-score: 145.2 bits: 37.5 E(): 0.0069 Smith-Waterman score: 227; 25.914% identity (52.492% similar) in 301 aa overlap (16-293:1174-1459) 10 20 30 40 FLJ001 GHGLHLLVLSSSGMALTVDVA-GPAPWGFRITGGRDFHTPIMVTK .:::. : .:: : :::... ..: . 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KIAA07 HDVRKPKELSACGQ---KKQRL---GEQRERSASPQRAARPRLEEAPGGQGRPEAGRPAS 1320 1330 1340 1350 1360 1370 230 240 250 260 FLJ001 DSEGGSLLLDEDSEVFKMLQENREGRAAPRQSSSFRLLQE------------------AL .... .: . ... . :. ::: ... .: .. :: KIAA07 EARAPGLAAADAADAARA-----GGKEAPRAAAGSELCRREGPGAAPAFAGPGGGGSGAL 1380 1390 1400 1410 1420 270 280 290 300 310 320 FLJ001 EAEERGGTPAFLPSSLSPQSSLPASRALATPPKLHTCEKCSTSIANQAVRIQEGRYRHPG ::: :.:. : . : .. :: .: ..: KIAA07 EAEGRAGARAGPRPGPRPPGGAPARKAAVAPGPWKVPGSDKLPSVLKPGASAASR 1430 1440 1450 1460 1470 1480 330 340 350 360 370 FLJ001 CYTCADCGLNLKMRGHFWEDACAMEGMRLSLEALEGMVEGAKRRDRRKTRRPIQPSW >>KIAA1634 ( 874 res) fh21781(revised) (874 aa) initn: 154 init1: 84 opt: 161 Z-score: 110.1 bits: 30.3 E(): 0.62 Smith-Waterman score: 161; 32.222% identity (63.333% similar) in 90 aa overlap (22-110:776-865) 10 20 30 40 50 FLJ001 GHGLHLLVLSSSGMALTVDVAGPAPWGFRITGGRDFHTPIMVTKVAERGKA :: .:: . ::.... ... ..:: : : KIAA16 HLAQPDTAVISVVGSRHNQNLGCYPVELERGPRGFGFSLRGGKEYNMGLFILRLAEDGPA 750 760 770 780 790 800 60 70 80 90 100 110 FLJ001 -KDADLRPGDIIVAINGESAEGMLHAEAQSKIRQSPSPLRLQLDRSQATSPGQTNGDSSL ::. .. :: :: :::: ..:. :..: :. . . . : : . . : . . :.: KIAA16 IKDGRIHVGDQIVEINGEPTQGITHTRAIELIQAGGNKVLLLLRPGTGLIPDHGLAPSGL 810 820 830 840 850 860 120 130 140 150 160 170 FLJ001 EVLATRFQGSVRTYTESQSSLRSSYSSPTSLSPRAGSPFSPPPSSSSLTGEAAISRSFQS KIAA16 CSYVKPEQH 870 >>KIAA1202 ( 1502 res) fg03353 (1502 aa) initn: 169 init1: 112 opt: 161 Z-score: 107.8 bits: 30.6 E(): 0.83 Smith-Waterman score: 170; 25.220% identity (48.094% similar) in 341 aa overlap (18-323:17-346) 10 20 30 40 50 FLJ001 GHGLHLLVLSSSGMALTVDVAGPAPWGFRITGGRDFHTPIMVTKVAERGKAK-DADLRPG :.. : ::::: . :: . :. :.:. . ::: . .: : KIAA12 AQPRMENRPGSFQYVPVQLQGGAPWGFTLKGGLEHCEPLTVSKIEDGGKAALSQKMRTG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 FLJ001 DIIVAINGESAEGMLHAEAQSKIRQSPSPLRLQLDRSQA--TSPGQTNGDSSLE---VLA : .: ::: : . :: :. : :.: . : .: . : . . . :: : KIAA12 DELVNINGTPLYGS-RQEALILIKGSFRILKLIVRRRNAPVSRPHSWHVAKLLEGCPEAA 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 FLJ001 TRFQGSVRTYTESQSSLRSSYSSPTSLSPRAGSPFSPPPSSSSLTGEAAISRSFQSLACS : .. .... : : .. . .. : : .:::. . .. . :. : KIAA12 TTMHFPSEAFSLSWHSGCNTSDVCVQWCPL--SRHCSTEKSSSIGSMESLEQPGQATYES 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 FLJ001 PGLPAADRLSYSGRPGSRQA--GLGRAGDSAVLVLP--PS--------PGPR---SSRPS :: . . . : .. .. . . :.: :. . : :. ::: :.::. KIAA12 HLLPIDQNMYPNQRDSAYSSFSASSNASDCALSLRPEEPASTDCIMQGPGPTKAPSGRPN 180 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 FLJ001 M-DSEGGSLL-----LDEDSEVFKMLQENREGRAA-----PRQSSSFRLLQEALEAEERG . .. ::: : .:.. . ::. .. : : : : .: .:. . KIAA12 VAETSGGSRRTNGGHLTPSSQMSSRPQEGYQSGPAKAVRGPPQPPVRRDSLQASRAQLLN 240 250 260 270 280 290 270 280 290 300 310 320 FLJ001 GTPAFLPSSLSPQSSLPASRALATPPKL---HTCEKCSTSIANQAVRIQEGRYRHPGCYT : . : :: .. :. : : . . : : .:.. .:: : .: KIAA12 GEQRRASEPVVP---LPQKEKLSLEPVLPARNPNRFCCLSGHDQVT--SEG---HQNCEF 300 310 320 330 340 330 340 350 360 370 FLJ001 CADCGLNLKMRGHFWEDACAMEGMRLSLEALEGMVEGAKRRDRRKTRRPIQPSW KIAA12 SQPPESSQQGSEHLLMQASTKAVGSPKACDRASSVDSNPLNEASAELAKASFGRPPHLIG 350 360 370 380 390 400 >>KIAA0807 ( 1329 res) hk04449(revised) (1329 aa) initn: 202 init1: 118 opt: 158 Z-score: 106.6 bits: 30.2 E(): 0.97 Smith-Waterman score: 198; 27.338% identity (52.158% similar) in 278 aa overlap (32-297:657-910) 10 20 30 40 50 60 FLJ001 HGLHLLVLSSSGMALTVDVAGPAPWGFRITGGRDFHT-PIMVTKVAERGKAKDADLRPGD : : .: :: .: . : :..: :: :: KIAA08 PALGSMRPPIIIHRAGKKYGFTLRAIRVYMGDSDVYTVHHMVWHVEDGGPASEAGLRQGD 630 640 650 660 670 680 70 80 90 100 110 120 FLJ001 IIVAINGESAEGMLHAEAQSKIRQSPSPLRLQLDRSQATSPGQTNGDSSLEVLATRFQGS .:. .::: ..:..:.:. : .: . . . .:.: . ..:..: .: .:: KIAA08 LITHVNGEPVHGLVHTEVVELILKSGNKVAI------STTPLE---NTSIKVGPAR-KGS 690 700 710 720 730 130 140 150 160 170 FLJ001 VRTYTESQSSLRSSYSSPTSLSPRAGSPFSPPPSSSSLTGEA----AISRSFQSLACSPG .. .: . : .. . : . .: : ...:: . ...::..: .:: KIAA08 YKAKMARRS--KRSRGKDGQESRKRSSLFRKITKQASLLHTSRSLSSLNRSLSSGESGPG 740 750 760 770 780 790 180 190 200 210 220 230 FLJ001 LPAADRLSYSGRPGSRQAGLGRAGDSAVLVL----PPSPGPRSSRPSMDSEGGSLLLDED :. :.: : : : :. .:: . : .: :: :: . .: . KIAA08 SPTH---SHSLSPRSPTQGY-RVTPDAVHSVGGNSSQSSSPSSSVPSSPAGSGHT---RP 800 810 820 830 840 240 250 260 270 280 FLJ001 SEVFKMLQENREGRAAPRQSSSFRLLQEALEAEERGGTPAFLPSSLSPQSS---LPASRA : . . . .. .::..:. . : . ::. : . ::: : : . : KIAA08 SSLHGLAPKLQRQYRSPRRKSAGSIPLSPL-----AHTPSPPPPTASPQRSPSPLSGHVA 850 860 870 880 890 900 290 300 310 320 330 340 FLJ001 LATPPKLHTCEKCSTSIANQAVRIQEGRYRHPGCYTCADCGLNLKMRGHFWEDACAMEGM : : ::: KIAA08 QAFPTKLHLSPPLGRQLSRPKSAEPPRSPLLKRVQSAEKLAAALAASEKKLATSRKHSLD 910 920 930 940 950 960 >>KIAA0561 ( 1308 res) hh01676 (1308 aa) initn: 241 init1: 109 opt: 157 Z-score: 106.1 bits: 30.1 E(): 1 Smith-Waterman score: 175; 25.333% identity (50.000% similar) in 300 aa overlap (32-321:971-1243) 10 20 30 40 50 60 FLJ001 HGLHLLVLSSSGMALTVDVAGPAPWGFRITGGRDFHTPIMVTKVAERGK-AKDADLRPGD : : .: :. .: :. :..: :: :: KIAA05 PVCGSLRPPIVIHSSGKKYGFSLRAIRVYMGDSDVYTVHHVVWSVEDGSPAQEAGLRAGD 950 960 970 980 990 1000 70 80 90 100 110 120 FLJ001 IIVAINGESAEGMLHAEAQSKIRQSPSPLRLQLDRSQATSPGQTNGDSSLEVLATRFQGS .:. :::::. :..: .. . .: . . : :. : ..:..: .: KIAA05 LITHINGESVLGLVHMDVVELLLKSGNKISL---RTTALE------NTSIKVGPAR---- 1010 1020 1030 1040 130 140 150 160 170 FLJ001 VRTYTESQSSLRSSYSSPTSLSPRAGSPFSPPPSSSSLTGEAAISRSF-----QSLACSP .. .... . ::. : . : : :. ...:. :::: .::. : KIAA05 -KNVAKGRMARRSKRSRRRETQDRRKSLFKKISKQTSVL---HTSRSFSSGLHHSLSSSE 1050 1060 1070 1080 1090 1100 180 190 200 210 220 230 FLJ001 GLPAADRLSYSGRPGS--RQAGLGRAGDSAVLVLPPSPGPRSSRPSMDSEGGSLLLDEDS .::.. : : : . :. . .:... ::: .: :: :. . .: . : KIAA05 SLPGSPTHSLSPSPTTPCRSPAPDVPADTTAS--PPSASPSSSSPASPAAAGHT---RPS 1110 1120 1130 1140 1150 240 250 260 270 280 290 FLJ001 EVFKMLQENREGRAAPRQSSSFRLLQEALEAEERGGTPAFLPSSLSPQSSLPASR-ALAT . . . : :: ... : .. . : : :: : ::. : : KIAA05 SLHGL--AAKLG--PPRPKTGRRKSTSSIPPSPLACPPISAPPPRSP-SPLPGHPPAPAR 1160 1170 1180 1190 1200 1210 300 310 320 330 340 350 FLJ001 PPKLHTCEKCSTSIANQAVRIQEGRY-RHPGCYTCADCGLNLKMRGHFWEDACAMEGMRL :.:. .. . ... . . :: : : KIAA05 SPRLRRGQSADKLGTGERLDGEAGRRTRGPEAELVVMRRLHLSERRDSFKKQEAVQEVSF 1220 1230 1240 1250 1260 1270 >>KIAA0973 ( 1583 res) hj06871 (1583 aa) initn: 141 init1: 78 opt: 157 Z-score: 105.2 bits: 30.2 E(): 1.2 Smith-Waterman score: 163; 26.259% identity (50.000% similar) in 278 aa overlap (41-270:1012-1286) 20 30 40 50 60 70 FLJ001 SSGMALTVDVAGPAPWGFRITGGRDFHTPIMVTKVAERGKAKDADLRPGDIIVAINGESA .: .: : : :..: : ::.:. .::: . 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KIAA03 LPGSPTHSLSPRSPTPSYRSTPDFPSGTNS----SQSSSPSSSAPNSPAGSGHIRPSTLH 820 830 840 850 860 240 250 260 270 280 290 FLJ001 EVFKML--QENREGRAAPRQSSSFRLLQEALEAEERGGTPAFLPSSLSPQSSLPASRALA . : :. : :: . . : .. . .: :: : .: .. : : KIAA03 GLAPKLGGQRYRSGRRKSAGNIPLSPLARTPSPTPQPTSPQRSPSPLLGHSLGNSKIAQA 870 880 890 900 910 920 300 310 320 330 340 350 FLJ001 TPPKLHTCEKCSTSIANQAVRIQEGRYRHPGCYTCADCGLNLKMRGHFWEDACAMEGMRL : :.:. .:. . :: . . . : . :. . : . . . KIAA03 FPSKMHS----PPTIVRHIVRPKSA--EPPRSPLLKRVQSEEKLSPSYGSDKKHLCSRKH 930 940 950 960 970 980 360 370 FLJ001 SLEALEGMVEGAKRRDRRKTRRPIQPSW :::. . :. :.. . . :.: KIAA03 SLEVTQEEVQ----REQSQREAPLQSLDENVCDVPPLSRARPVEQGCLKRPVSRKVGRQE 990 1000 1010 1020 1030 379 residues in 1 query sequences 2210615 residues in 2457 library sequences Tcomplib [34.26] (2 proc) start: Fri Feb 27 10:34:51 2009 done: Fri Feb 27 10:34:51 2009 Total Scan time: 0.510 Total Display time: 0.130 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]