P-1	光受容体型GAFドメインの多様性と分布
岡本　忍、大森正之	
東京大学大学院総合文化研究科

P-2	枯草菌諸代謝制御の統合的解明；ilv-leuオペロンの多重制御系の解析を中心に
藤田泰太郎、東條繁郎、里村武範、吉田健一	
福山大学生命工学部生物工学科

P-3	Anabaena sp. PCC 7120におけるdps遺伝子群の発現解析
1豊島正和、2得平茂樹、1佐藤直樹	
1埼玉大学理学部分子生物学科、2東京大学大学院総合文化研究科	

P-4	最新ゲノム情報に基づくシアノバクテリアの系統とプラスチドの起源
佐藤直樹	
埼玉大学理学部分子生物学科	

P-5	ゲノム中の246生物種の立体構造データベースFAMSBASEとDNAマイクロアレイデータとの融合
岩舘満雄、加納和彦、竹田-志鷹真由子、梅山秀明
北里大学薬学部	

P-6	単細胞性原始紅藻Cyanidioschyzon merolaeのオルガネラ局在型DNAポリメラーゼの同定
森山崇　宮島一徳　黒岩常祥　佐藤直樹
埼玉大・理

P-7	Bacillus subtilisにおけるσ因子欠損株の発現プロファイルとプロモーター配列による
レギュロンの同定	
藤井信之、秋冨穣、駒寿浩、小林和夫、小笠原直毅、金谷重彦	
奈良先端科学技術大学院大学　情報科学研究科　情報生命科学　比較ゲノム学講座

P-8	生産プロセスにおいて酵母細胞が受ける環境ストレスに対する遺伝子の網羅的発現解析
平沢　敬1、永久圭介2、古澤　力2、片倉啓雄1、清水　浩2、塩谷捨明1	
1大阪大学大学院工学研究科応用生物工学専攻、2大阪大学大学院情報科学研究科バイオ情報工学専攻

P-9	微生物ゲノムシークエンシングプロジェクト
山下敦士1, 2、大島健志朗2, 3、藤　英博1、藤岡　満2, 3、岡田英治2, 3、中澤麻子2、古谷恵子2、
山下恭江2、吉野智絵2、有田ゆう子2, 3、鈴木章代2, 3、柴　忠義2、服部
正平1, 4	
1北里大・北里生命研、2北里大・理、3日立計測器サービス、4理研・ゲノム科学総研セ

P-10	大腸菌の代謝はスモールワールドではない
有田正規	
東京大学大学院新領域創成科学研究科情報生命科学専攻	

P-11	アグロバクテリウム形質転換（AtMT）法を用いた植物病原糸状菌の遺伝子
機能解析実験系の確立
辻　元人*、藤井　聡*、藤原直樹*、白石友紀**、久保康之*	
*京都府立大学大学院農学研究科、**岡山大学農学部	

P-12	シアノバクテリアAnabaena sp. PCC 7120における低温応答遺伝子の
マイクロアレイ解析
得平茂樹12、大森正之2、佐藤直樹1	
1埼玉大・理・分子生物、2東大・院・総合文化	

P-13	糸状性ラン藻 Anabaena sp. PCC 7120におけるPAS domainの
網羅的解析の進捗状況
成川礼、岡本忍、大森正之、池内昌彦
東京大学大学院総合文化研究科

P-14	新しい微生物ゲノムアノテーションシステムの開発：遺伝子同定から
コンティグの整列までの自動化
西　達也(1)、池村淑道(2)、金谷重彦(3)	
(1)ジナリス、(2) 国立遺伝研・進化遺伝、(3) 奈良先端大・情報科学	

P-15	Thermus thermophilus HB8のゲノム情報の蓄積とシミュレーションを指向した
Webベースシステムの開発	
福崎昭伸（理研GSC）、小西史一（理研GSC）、木村周平（理研GSC）、川崎琢治（富士総研）、
仲　隆（九産大・情報科学）、  長嶋剛史（理研GSC）、井手　香（理研GSC）、畠山眞里子（理研GSC）
、倉光成紀（阪大・理学）、小長谷明彦（理研GSC）
理化学研究所GSC
	
P-16	ラン藻におけるNaCl誘導性cAMPシグナリングを介した遺伝子発現解析
今清水正彦、吉村英尚、加藤浩、大森正之	
東京大学総合文化研究科	

P-17	DNAマイクロアレイデータを用いたリン酸代謝関連遺伝子の制御機構の解析
小林圭太、嶋田有希子、上橋慶吾、牟田　滋、田代康介、久原　哲	
九州大学大学院 生物資源環境科学府　遺伝子資源工学専攻	

P-18	大腸菌2成分制御系のシステマチックな解析
杉浦雅仁1、山本兼由2、大島 拓3、内海龍太郎2、森 浩禎3、水野 猛1、饗場浩文1
1名大院・生命農学、2近畿大院・応用生命、3奈良先端大・遺伝子教育研究センター

P-19	枯草菌転写データベース DBTBS の拡張とデータ解析
蒔田由布子1,2、中尾光輝1、小笠原直毅3、中井謙太1 	
1,東京大学医科学研究所　2,名古屋大学　3,奈良先端科学技術大学院大学	

P-20	T4類縁ファージにおけるゲノムの共通性と多様性
有坂文雄1)、鈴木麻美絵1)、坂本盛宇2)、西川建2)
東工大・院・生命理工、2)国立遺伝研大量研

P-21	Anabaena DNAマイクロアレイと異種ラン藻を用いた乾燥応答遺伝子群のスクリーニング
吉村英尚、加藤浩、大森正之	
東京大学総合文化研究科	

P-22	陸生ラン藻の乾燥応答遺伝子の発現解析
加藤　浩1)、Ravi Kumar Asthana2)、大森　正之3)	
1)三重大学　生命科学研究支援センター、2)Banaras Hindu University、3)東京大学大学院総合文化研究科

P-23	ゲノム配列中のORF位置情報にもとづくDNA修復関連タンパク質の予測
由良　敬、河野秀俊、郷　信広	
日本原子力研究所・量子生命情報解析グループ	　

P-24	プロバイオティクス乳酸菌Lactobacillus reuteriのヒト腸管生存性に関与する
遺伝子群の機能解析および比較ゲノム
森田英利1), 政岡俊夫1), 堀川洋1), 大島健志郎2), 鈴木武人1), 茅根士郎1), 和田恭則1), 
福岡秀雄1), 有嶋和義1), 木内明男1), 坂田亮一1), 紫野正雄1), 内藤博之1), 斉藤康秀1),
 西田利穂1), 印牧信行1), 滝沢達也1), 加藤行男1), 村上賢1), 福山正文3), 岸川正剛3), 
久松伸3), 柴忠義2), 吉村哲彦4), 服部正平5)	
1麻布大獣, 2北里大理, 3麻布大健康環境, 4生物ラジカル研究所, 5北里生命科学研究所	

P-25	LC-MS ショットガン法を用いた大腸菌のプロテオーム解析
礒辺俊明、山内芳雄、新川高志、田岡万悟
東京都立大学大学院理学研究科

P-26	糸状性ラン藻Anabaena sp. PCC 7120におけるcAMP受容体タンパク質の解析
鈴木崇之1)、吉村英尚1)、久堀　徹2)、大森正之1)
1)東京大学大学院総合文化研究科　2)東京工業大学資源化学研究所

P-27	Detemination of The Whole Genome Sequence of Thermus thermophilus HB8
Masanari KITAGAWA1, Ryuta KOMATSU1, Yuki MARUYAMA1, Kazue OGIWARA1, Tomohisa KATOU1,  
 Hirosi TANOUE1, Kiyozo ASADA1, Ikunoshin KATO1, Ryoji MASUI2, Ken KUROKAWA3, 
Teruo   YASUNAGA3, Noriko NAKAGAWA2,4, Takehiko SHIBATA4, Yorinao INOUE4, 
Shigeyuki YOKOYAMA4,5, and Seiki KURAMITSU2,4,5	
1:DragonGenomics Cent.,TAKARABIO Inc., 2:Grad. Sch. Sci., Osaka Univ., 
3:Genome Infomation Res. Cent., Osaka Univ., 4:RIKEN Harima Inst., 
5:RIKEN Genomic Sciences Center

P-28	数学的視点からのDNA情報
金子浩幸、掘越弘毅
海洋科学技術センター

P-29	枯草菌の機能未知HTH制御因子のレギュロン解析
吉田健一　三輪泰彦*　藤田泰太郎	
福山大学・生命工学部・生物工学科、*福山大学・生命工学部・海洋生物工学科	

P-30	プロテオミクスの新しいツールとしてのRFHR二次元電気泳動法〜固定化pH勾配法
（O'Farrell法）との比較〜
和田　明1、2  吉田秀司1  上田雅美1  和田千恵子2  渡辺貞一2	
1大阪医科大学・物理  2　BIT lab	

P-31	フィトクロム様GAFドメインをもつシアノバクテリアに特異的な一群の新規光受容体
吉原静恵、片山光徳、池内昌彦	
東京大学・総合文化研究科	

P-32	Affimetryx タイリングアレーを用いた酵母ゲノムの動態解析
白髭克彦	
理化学研究所、ゲノム科学総合研究センター	

P-33	好熱性G. kaustophilus HTA426株のゲノムから見たBacillusゲノムの多様性と共通性
高見英人、高木善弘、池甲珠、西真郎、島村繁、鈴木洋子、松井里美、内山郁夫＊	
海洋科学技術センター・ゲノム解析研究グループ  ＊岡崎国立共同研究機構・基礎生物学研究所	

P-34	重炭酸イオンによる腸管出血性大腸菌O157:H7の病原性遺伝子発現制御機構の解析
安倍裕順, 安藤弘樹, 田代康介, 久原哲, 林哲也, 杉本央, 戸邉亨	
大阪大学大学院医学系研究科感染因子	

P-35	腸管出血性大腸菌ゲノムの比較解析
小椋義俊1,2、黒川顕3、大西真2、中山啓介2、寺  島淳4、渡辺治雄4、林哲也1,2	
宮崎大・フロンティア1、宮崎大・医・微生物2、阪大・遺伝情報3、感染研・細菌第一4	

P-36	嫌気性球菌 Finegoldia magna ATCC29328株の全ゲノム解析
	
後藤隆次1、戸堂耕造1、2、清水 徹3、平川英樹4、山下 敦士5、大島健志朗5、6、久原 哲4、
服部正平5、7、宮本和明1、秋本 茂1	1
和歌山医大・微生物、2和歌山医大・歯科口腔外科、3金沢大院・医・細菌感染制御、
4九大院・  生物資源環境科学・遺伝子資源工学、5北里大・北里生命研、
6日立計測器サービス、7理研・ゲノム科学総研セ	

P-37	アナロガスなタンパク質の電荷分布と構造の比較
今井賢一郎　美宅成樹	
名古屋大学大学院工学研究科応用物理学専攻

P-38	Synechocystis sp. PCC 6803のフィコビリソームのロッドコアリンカー
CpcG1,G2の機能解析
近藤久益子1、耿暁星2、片山光徳2、池内昌彦1,2	 
1東大院・理・生物, 2東大院・総合文化・生命環境　	

P-39	酵母ゲノムにおけるミトコンドリア膜タンパク質の予測
辻敏之  美宅成樹
名古屋大学・院工・応用物理	

P-40	Bacteroides fragilisにおけるDNA逆位による外膜タンパク質遺伝子の発現調節
中山治之、桑原知巳、大西克成	
徳島大学大学院医学研究科分子細菌学分野	

P-41	ラン藻PCC6803のタンパク質間相互作用に関するプロテオーム研究	
東谷篤志1・半澤栄子1・東谷なほ子1・中澤昌高1・藤野貴奈1・谷口寿章2・眞野成康3・後藤順一3　　
1)	東北大学大学院生命科学研究科・2)理化学研究所・播磨・3)東北大大学院生命科学研究科	

P-42	ノニルフェノール分解性Sphingomonas属細菌における分解特性及び、
分解関連遺伝子の解析 
生長陽子、齊藤美有紀、笠原康裕、久留主泰朗、太田寛行	
茨城大学・農学部

P-43	環境汚染物質分解性Sphingomonas属細菌の宿主-ベクター系の開発
	
齊藤美有紀、生長陽子、笠原康裕、太田寛行、久留主泰朗	
茨城大学・農学部	

P-44	ツェツェバエの二次共生菌Sodalis glossinidiusのゲノム解析
藤 英博、山下敦士、大島健志朗、Serap Aksoy *、服部正平	
北里大・北里生命研、* Yale大	

P-45	単細胞性ラン藻Gloeobacter violaceusのゲノム構造解析
金子貴一、中村保一、佐藤修正、田畑哲之	
かずさDNA研究所	

P-46	ISを介したO157株のゲノム多様性解析
大岡唯祐1、小椋義俊1,2、林　哲也1,2	
宮崎大・医・微生物１，宮崎大・フロンティア２

P-47	ゲノムワイドデータの統合による信頼性の高いPPIネットワークの構築
中村征良1,2, 木村曜1,3, 斎藤輪太郎1, 荒武1,4, 伊藤文1,4, Md. Arifuzzaman 5,6, 前田真希4,  
 大島拓4,6, 和田千恵子4,7, 森浩禎1,4,6, 冨田勝 1,3     	
1.慶大・先端生命研, 2.同・政策メディア・バイオインフォマティクスプログラム,   
3.同・環境情報, 4.CREST, 5.NEDO, 6.奈良先端科学技術大学院大学遺伝子教育研究センター, 
7.京都大学ウイルス研究所  	

P-48	ゲノム解析技術の最近の進展と今後
大島健志朗、山下敦士、藤英博、服部正平＊	
北里大学北里生命科学研究所	

P-49	Bacteroidesのゲノム解析
桑原知巳
徳島大学大学院医学研究科・分子細菌学分野	
P-50	予測構造とモチーフを利用したタンパク質配列間の弱い相同性の検出
石部大介(1)、植原克典(1)、郷信広(1,2)、川端猛(1)	
(1) 奈良先端科学技術大学院大学情報科学研究科,   (2) 日本原子力研究所	

P-51	大腸菌ゲノムでのCADをめざして；"KO Collection"からの出発
	
馬場知哉(1)、荒武(1)、山本奈津子(2)、長谷川美紀(1)、高井幸(1)、和田千恵子(4)、冨田勝(1)、 
Barry L. Wanner(3)、森浩禎(1,2)	
(1)	慶大・先端生命研、(2)奈良先端大・遺伝子教育、(3) Purdue Univ. USA、(4)京都大・生命科学

P-52	大規模欠失株を用いた大腸菌染色体の機能解析
橋本昌征、市村俊治、加藤潤一	
都立大・院理	　

P-53	大腸菌タンパク質間相互作用ネットワークのマイニング
続木恒平1,7,中村征良1,6,斎藤輪太郎1,木村曜1,7,武田朋子1,7,久間大輔1,7,小林雄輔1,7,
 藤森茂雄1,6,荒武1,2,伊藤文1,2,Md. Arifuzzaman3,4,前田真希2,大島拓2,4, 和田千恵子2,5, 
森浩禎2,4, 冨田勝1,6,7	
1 Institute for Advanced Biosciences, Keio University 2 CREST JST 3 NEDO 
4 Research and  Education Center for Genetic Information, Nara Institute of Science and Technology 
5   Institute for Virus Research, Kyoto University 6 Bioinformatics Program, 
Graduate School of Media and Governance, Keio University 
7 Faculty of Environmental Information, Keio University
	
P-54	生物多様性とゲノム機能研究への新規な情報学的手法；自己組織化マップ
(Self-Organizing Map: SOM).	
阿部貴志（1, 2）、金谷重彦（3）、上月登喜男、中川智（2）、木ノ内誠 (4)、小坂洋子、池村淑道 （1）	
1, 遺伝研, 2, ザナジェン, 3, 奈良先端大, 4, 山形大・工	

P-55	麹菌ゲノム解析
佐野元昭1、田中敏広2、五十嵐理恵2、澤野寿彦2、熊谷俊高3、楠本憲一4、有馬寿英5、秋田修5、
阿部敬悦6、柏木豊4、北本勝ひこ7、小林哲夫8、五味勝也6、竹内道雄9、堀内裕之7、穴澤秀治10、
小出芳直11、小森隆12、小山泰二13、田中昭光14、秦洋二15、峰時俊貴16、Jiujiang Yu17、
小笠原直毅18、久原哲19、菊池久2、浅井潔7、町田雅之3
1金沢工大、2製品評価技術基盤機構、3産総研、4食総研、5酒類総研、6東北大、7東大、8名大、
9農  工大、10協和発酵、11天野エンザイム、12インテックW&G、13キッコーマン、14ヒゲタ醤油、
15月桂  冠、16大関、17SRRC USA、18奈良先端大、19九大	

P-56	セパシア菌群細菌ATCC17616株のゲノム解析
大坪嘉行(1)，藤下彰代(1)，小松春伸(1), 源河浩之(1)， 澤田宏之(2)， 永田裕二 (1), 津田雅孝(1)	
(1)	東北大・院生命科学，(2)独立行政法人農業環境技術研究所	

P-57	系統的一塩基置換実験から得られた結合自由エネルギー変化を利用した
SYCRP1結合部位の探索
尾曲克己1、吉村英尚1、高野光則1、大森正之1、皿井明倫2、陶山明1	
1東大・院総文・生命、 2九工大・情報システム	

P-58	嘔吐型セレウス菌のゲノム解析ーセレウスグループ細菌の成立
鳥居啓三1、武野　彰1、清水　徹2、大島健史郎3、平川英樹4、籐　英博3、山下淳史3、長谷川忠男  1
、林　哲也5、久原　哲4、服部正平3、太田美智男1	
1：名古屋大学大学院医学系研究科分子病原細菌学  2：金沢大学大学院医学系研究科感染制御学 
 3：北里大学北里生命科学研究所ゲノム情報学研究室  4：九州大学大学院システム生命科学府
生命情報科学講座  5：宮崎大学フロンティア科学実験総合センター

P-59	オリエンチア・ツツガムシのゲノム解析
中山恵介1、大西真1、黒川顕2、小川倫洋2、山下敦士3、福原正博4、浦上　弘4、
多村　憲4、服部  正平3、林哲也1	
1宮崎大・医・微生物、2阪大・遺伝情報、3北里大・理、4新潟薬大・微生物	

P-60	ウェルシュ菌におけるリーディング鎖、ラギング鎖上の遺伝子分布の
違いに関する研究
平川英樹 1)、沖田卓矢 1)、Stanislav Dusko Ehlich 2)、大谷　郁 3)、小笠原直毅 4)、
清  水　徹 3)、久原　哲 1)	
1)	九大院・システム生命科学府、2)Genetique Microbienne, 
Institut National de la Recherche  Agronomique、3)金沢大院・医・細菌感染制御、
4)奈良先端大・情報科学研究科	

P-61	表面アミノ酸分布を用いたタンパク質間相互作用サイトの予測法の開発
	
福原直志、川端　猛、郷　信広	
奈良先端科学技術大学院大学　情報科学研究科　情報生命科学専攻	

P-62	2次元電気泳動法による深海微生物Shewanella violacea DSS12株蛋白
プロファイルの検討 
廣藤孝男1、佐藤寛2、加藤千明2、仲宗根薫1	
近畿大工学部1、海洋科学技術センター海洋生態環境研究部2	深海微生物

P-63	酵母の物理的および化学的ストレスによる酵母の遺伝子発現のクラスタリング
百瀬祐子 岩橋　均 岡　修一	
独立法人産業技術総合研究所	

P-64	病原性真菌Candida albicans及びC. glabrataにおけるゲノム解析	
知花博治1)，中山浩伸2)，岡　奈緒1)，長沢奈央子1)，三上　襄1) 	
1)	千葉大学真菌医学研究センター，2)　鈴鹿高等専門学校	

P-65	出芽酵母分断染色体によるゲノム構成改変
片瀬　満、生嶋茂仁、原島　俊、金子嘉信	
大阪大学大学院工学研究科応用生物工学専攻	

P-66	塩基配列からの微生物系統分類の予測
阿部貴志（1，2）、川瀬和哉（1）、橋本一哉（1）、木ノ内誠（3）、金谷重彦（4）、
池村淑道  （2）、上月登喜男（1）、中川智（1）    	
（1）	株式会社ザナジェン、（2）遺伝研、（3）山形大学、（4）奈良先端大学院大学	

P-67	根粒菌ゲノムの多様性・可塑性と共生能決定の分子基盤解明に向けて
佐伯和彦＊，安部孝紀＊，羽生真樹＊，大森博文＊，内海俊樹＊＊，熊田裕子＊＊，鈴木章弘＊＊，
阿部美紀子＊＊	
＊	大阪大学大学院理学研究科，＊＊鹿児島大学理学部生命化学科	

P-68	バクテリアtRNAIleを修飾するライシジン合成酵素（TilS）の配列多様性と
基質認識特異性の関連
相馬亜希子1、池内与志穂2、金正悟1、大手 友武3、加藤 潤一3、鈴木勉2、関根靖彦1
1立教大・理、2東大・新領域・先端生命、3東京都立大・理・生物	

P-69	Serratia marcescensのゲノム解析
小川倫洋1、後藤直正2、山下敦士3、黒川顕1、安永照雄1、林哲也4、服部正平31 大阪大学遺伝情報実験センター、
2 京都薬科大学微生物学教室、3 北里大学生命科学研究所、4 宮崎大学フロンティア科学実験総合センター	

P-70	深海由来好冷好圧性細菌Shewanella violacea DSS12株のゲノム解析
青野英司(1), 馬場知哉(2), 仲宗根薫(3), 荒　武(2), 大島　拓(1), 為我井秀行(4), 加藤千明(5), 森　浩禎(1, 2) 	
1 奈良先端大・遺伝子教育センター, 2 慶大・先端生命研, 3 近畿大・工, 4 日本大・文理, 
5海洋科技セ・海洋生態環境研究部 	

P-71	ドラフト配列におけるコンティグ整列化手法	
上月登喜男、妹尾彰宏、宮澤達也、山本 佑、中川 智	
株式会社ザナジェン	

P-72	シアノバクテリアにおけるフラビン結合センサータンパク質の解析
岡島公司　成川　礼　片山光徳　池内昌彦	
東京大学・院・総合文化	

P-73	シアノバクテリアの光化学系II遺伝子の比較	
岩井雅子、片山光徳、加藤　浩、池内昌彦	
東京大学大学院・総合文化・生命・池内研究室	

P-74	Synechocystis sp. PCC 6803のフィトクロム様光受容体が受容する
光波長特定の試み
片山光徳、耿　暁星、池内昌彦	
東京大学 大学院総合文化研究科 広域科学専攻 生命環境科学系	

P-75	マクロアレイによる根粒菌のゲノム進化の解析
南澤　究1)、板倉　学1)、佐伯和彦2）、大森博文2）、横山　正3）、金子貴一4)、田畑哲之4)、
大和田 琢二5)、田島茂行6)、内海俊樹7)
1)東北大学生命科学研究科、2)大坂大学理学研究科、3)東京農工大学農学部、4)かずさDNA研究所、
5)帯広畜産大学生物資源科学、6)香川大学農学部、7)鹿児島大学理学部

P-76	単細胞紅藻Cyanidioschyzon merolaeの新たな培養系の確立と
核ゲノムの形質転換
蓑田　歩1、坂上　玲2、田中　寛1
1東大・分生研、2東薬大・生命

P-77	原始紅藻Cyanidioschyzon merolaeにおける窒素欠乏応答機構の解析
坂上　玲1、蓑田　歩2、田中　寛2
1東薬大・生命、2東大・分生研