FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0681.ptfa, 826 aa vs ./tmplib.26680 library 1768191 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1748+/-0.00561; mu= 12.6121+/- 0.375 mean_var=145.3369+/-33.499, 0's: 0 Z-trim: 8 B-trim: 2 in 1/35 Lambda= 0.1064 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1798 ( 761 res) mpm09365 ( 761) 1684 270 5.7e-73 mFLJ00162 ( 718 res) mej01253 ( 718) 700 119 1.6e-27 mKIAA0835 ( 1129 res) mfj01048 (1129) 194 42 0.00051 mKIAA0535 ( 1049 res) mbg03667 (1049) 192 41 0.0006 mKIAA1106 ( 1211 res) mbg00011 (1211) 188 41 0.001 >>mKIAA1798 ( 761 res) mpm09365 (761 aa) initn: 1987 init1: 1602 opt: 1684 Z-score: 1402.4 bits: 270.3 E(): 5.7e-73 Smith-Waterman score: 1918; 42.989% identity (51.181% ungapped) in 756 aa overlap (184-822:3-754) 160 170 180 190 200 210 mKIAA0 HPDVHQDRQDITSLEPPVDASSCKCQACGPQQSSGLDVGSSGDRCSQPFQKRSVIVE--- : ..: . :.: ::: . . . mKIAA1 CCQYGNGDECLSGGKYCSQNCARYAKDKDQKD 10 20 30 220 230 240 250 260 mKIAA0 --NSGCTIASELLKPMKKRKHK-----EYQSPSEESEPEAVKQGEG---KDAEREPTPST ..: : : .:.: : . .. .:: . : .. .: . ..: mKIAA1 ERDGGEDNDEEDPKCSRKKKPKLSLKADSKDDGEERDDEMENKQDGRILRGSQRARRKRR 40 50 60 70 80 90 270 280 290 300 310 320 mKIAA0 PENEEWSRSQLVSSEKKDGWSWESYLEEQKAVTAPVSLFQDSQAVTHNKNGFKLGMKLEG .. . : . . : : : :::::.:::..:..::.. :. .::::::.:::::: mKIAA1 GDSAVLK--QGLPPKGKKTWCWASYLEEEKAVAVPTKLFKEHQSFPYNKNGFKVGMKLEG 100 110 120 130 140 150 330 340 350 360 370 380 mKIAA0 IDPQHPSMYFILTVAEVCGYRLRLHFDGYSECHDFWVNANSPDIHPAGWFEKTGHKLQLP .::.: .:: .::::::::::..:::::::.:.::::::.. ::::.:: :::::::. : mKIAA1 VDPDHQAMYCVLTVAEVCGYRIKLHFDGYSDCYDFWVNADALDIHPVGWCEKTGHKLRPP 160 170 180 190 200 210 390 400 410 420 430 440 mKIAA0 KGYKEEEFSWSQYLRSTKAQAAPKHLFVSQSHSTPPVGFQVGMKLEAVDRMNPSLVCVAS ::::::::.:..::.. ::::::: :: .:. .. : ::.:::::::.:. .::..:::. mKIAA1 KGYKEEEFNWQSYLKTCKAQAAPKSLFENQNITVIPSGFRVGMKLEAADKKSPSVICVAT 220 230 240 250 260 270 450 460 470 480 490 500 mKIAA0 VTDVVDSRFLVHFDDWGDTYDYWCDPSSPYIHPVGWCQKQGKPLTPPQDYPDPDSFCWEK :::.::.:::::::.: ..:::::. .::.:::::::... . : : : : :.: mKIAA1 VTDMVDNRFLVHFDNWDESYDYWCESNSPHIHPVGWCKEHRRTLITPPGYSHVKHFSWDK 280 290 300 310 320 330 510 520 530 540 550 560 mKIAA0 YLEETGTSAVPNWAFKVRPPHSFLVNMKLEAVDRRNPALIRVASVEDVEDHRIKLHFDGW :::::.. .: ::::.:::.: .:::::::.::: .::::.: :..:::::.::::: mKIAA1 YLEETNSLPAPARAFKVKPPHGFQKKMKLEAVDKRNPLFIRVATVADTDDHRIKVHFDGW 340 350 360 370 380 390 570 580 590 600 610 mKIAA0 SHNYDFWIDADHPDIHPAGWCSKTGHPLEPPLRPRESSSVSP-GGCPPLSHRSPPHTKTS : ::.::::: :::::.::::::::::. :: : : : :::: :. :. : : : mKIAA1 SSCYDYWIDADSPDIHPVGWCSKTGHPLQAPLSPAELMEPSETGGCPTLGCRGVGHFKKS 400 410 420 430 440 450 620 630 640 650 mKIAA0 KY--NFHHRKCPT-----------P---GCDGSGHVTGKFTAHHCL-----SGCP----- .: . .:: : . : : .: .: . . :. : mKIAA1 RYLGTQSGANCPYSEINLSKERIFPDRLSGDTSPPTTPSFPRSKRMDTRESSSSPETREK 460 470 480 490 500 510 660 670 mKIAA0 ----LAEKNQSRLKAELSDSETA-------------------------------ARK--- . : .... . :.. : : :.: mKIAA1 HANNFKEDSEKKKENEVKTSAEAKVVREEPTPSVQQSQPPQQVQQVQHAQPPQQAQKAPQ 520 530 540 550 560 570 680 690 700 710 mKIAA0 --------------KNPSNLSPRKKPR-------HQGRIGRPPKYRKIPEEDLQALPPSV . :.. .:.. :. :.. .. :. . :.. . :. mKIAA1 AQQAQQAQQAQQAPQAPQTPQPQQAPQVQQAQQAPQAQQAQQPQQAQQPQQAPPVQQPQQ 580 590 600 610 620 630 720 730 740 750 mKIAA0 VHQS------------------LFMSTLPTHADRPLSVCWEQHCKLLPGVAGISASTVSK :.:. .:.: : :: :::. :::: :::: :: ::: mKIAA1 VQQAQPTQQQAQTQQQAQRRSAVFLSFKPPIPCLPLR--WEQQSKLLPTVAGIPASRVSK 640 650 660 670 680 760 770 780 790 800 810 mKIAA0 WTIEEVFGFVQTLTGSEDQARLFKDEMIDGEAFLLLTQADIVKIMSVKLGPALKIYNAIL :. .:: :.:.: : :.....::::.::::::::.::.:::::::.::::::::.:.:: mKIAA1 WSTDEVSEFIQSLPGCEEHGKVFKDEQIDGEAFLLMTQTDIVKIMSIKLGPALKIFNSIL 690 700 710 720 730 740 820 mKIAA0 MFKNTDDVFK ::: .. mKIAA1 MFKAAEKNSHNEL 750 760 >>mFLJ00162 ( 718 res) mej01253 (718 aa) initn: 778 init1: 329 opt: 700 Z-score: 586.5 bits: 119.3 E(): 1.6e-27 Smith-Waterman score: 700; 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