FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mFLJ00227.ptfa, 590 aa vs ./tmplib.26680 library 1768427 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.5272+/-0.0061; mu= 3.7166+/- 0.406 mean_var=176.0582+/-41.166, 0's: 0 Z-trim: 14 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0967 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1597 ( 407 res) mnh09216 ( 407) 1119 168 1.5e-42 mFLJ00307 ( 516 res) mtg01156 ( 516) 468 77 3.7e-15 mKIAA4194 ( 320 res) mbg12940 ( 320) 293 53 5.8e-08 mKIAA0080 ( 353 res) mbh01670 ( 353) 269 49 6.4e-07 mKIAA4186 ( 899 res) mfj00029 ( 899) 251 47 7.1e-06 mKIAA0985 ( 684 res) mbp05185 ( 684) 245 46 1e-05 mKIAA1342 ( 499 res) mid23032 ( 499) 226 43 5.2e-05 >>mKIAA1597 ( 407 res) mnh09216 (407 aa) initn: 790 init1: 652 opt: 1119 Z-score: 856.5 bits: 167.9 E(): 1.5e-42 Smith-Waterman score: 1122; 45.758% identity (48.370% ungapped) in 389 aa overlap (218-589:20-404) 190 200 210 220 230 240 mFLJ00 KASEGQEEEPQDQECELEAPGEGGVQVAEADPELDPEQKAEQESQPTPA--QSKATSKIL : ... .: .. :. .:: :... .. mKIAA1 LPEELVRSAEDVSTVPSLPDNQFSHPDKLKRMSKSVPAFLQDESDDRET 10 20 30 40 250 260 270 280 290 mFLJ00 ENGEEAPGL------GPSLDRMLSSSSSVSSLNSSTLSGSLMSL-SGEAEAGTVQVRGSV ... :. .:: :::::...::.:. :::.::. ::. :...:.::: mKIAA1 DTASESSYQLRRYKKSPSSLTNLSSSSGMTSLSSA--SGSVMSVYSGDF--GNLEVKGSV 50 60 70 80 90 100 300 310 320 330 340 350 mFLJ00 LFSLRYEPGTSELRVQVIQCQGLAAA--RRRRSDPYVKSYLLPD--KQSKRKTSVKKRNL :.: : . .::.: : ::. :::: ...:::::::.::::: :..:.:: : :..: mKIAA1 QFALDYVESLKELHVFVAQCKDLAAADVKKQRSDPYVKTYLLPDKGKMGKKKTLVVKKTL 110 120 130 140 150 160 360 370 380 390 400 410 mFLJ00 NPIFNETLRHSVQQADLPGRVLSLSVWHRESLGRNIFLGEVEVPLDTWNWDSEAT----W ::..:: ::..... : . :.::::::... :: ::::::. :.::.:::. . : mKIAA1 NPVYNEILRYKIERQFLKTQKLNLSVWHRDTFKRNSFLGEVELDLETWDWDSKQNKQLKW 170 180 190 200 210 220 420 430 440 450 460 470 mFLJ00 LPLQPRVPPSPDELPSRGLLSLSLKYVPAGSEGGGQPQSGELHFWVKEAQSLVPLRPGSL ::. .. : : .:: ..:.:.::: : : : .::.:.:::: .: :: . : mKIAA1 YPLKRKTAPVALETENRGEMKLALQYVPEPSPGKKLPTTGEVHIWVKECLDLPLLRGSHL 230 240 250 260 270 280 480 490 500 510 520 530 mFLJ00 DTYIQCSVLPDDSRASRQRTRVVRRSLSPVFNHTMVYDGFGPADLRQACAELSLWDHGAL .....:..::: :: :::.::.: .. .:::::::::::: : :: .::.::..::: : mKIAA1 NSFVKCTILPDTSRKSRQKTRAVGKTTNPVFNHTMVYDGFRPEDLMEACVELTVWDHYKL 290 300 310 320 330 340 540 550 560 570 580 590 mFLJ00 ASRQLGGTRLSLGTGSSYGLQVPWMDSTPEEKQLWQTLLERPCEWVDGLLPLRTNLVPRA ... ::: :...:::.::: .: ::::: :: ::. ... : ::.. :::: :. . mKIAA1 TNQFLGGLRIGFGTGKSYGTEVDWMDSTSEEVALWEKMVNSPNTWVEATLPLRMLLIAKL 350 360 370 380 390 400 mKIAA1 SK >>mFLJ00307 ( 516 res) mtg01156 (516 aa) initn: 430 init1: 199 opt: 468 Z-score: 364.5 bits: 77.2 E(): 3.7e-15 Smith-Waterman score: 480; 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