# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mtk02208.fasta.nr -Q ../query/mKIAA0266.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA0266, 770 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7912815 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9861+/-0.000195; mu= 9.5935+/- 0.011 mean_var=108.4098+/-20.969, 0's: 36 Z-trim: 65 B-trim: 360 in 1/66 Lambda= 0.123180 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|68566172|sp|Q640M1.1|UT14A_MOUSE RecName: Full= ( 767) 4966 893.7 0 gi|74147816|dbj|BAE22282.1| unnamed protein produc ( 767) 4950 890.9 0 gi|36956732|gb|AAQ87011.1| Jsd-like X-linked prote ( 767) 4907 883.3 0 gi|71681097|gb|AAH99799.1| UTP14, U3 small nucleol ( 765) 4348 783.9 0 gi|148697125|gb|EDL29072.1| UTP14, U3 small nucleo ( 597) 3895 703.3 6.9e-200 gi|68566226|sp|Q9BVJ6.1|UT14A_HUMAN RecName: Full= ( 771) 3811 688.5 2.6e-195 gi|194228268|ref|XP_001491784.2| PREDICTED: UTP14, ( 773) 3777 682.5 1.7e-193 gi|74008946|ref|XP_549249.2| PREDICTED: similar to ( 772) 3760 679.4 1.4e-192 gi|114649774|ref|XP_509792.2| PREDICTED: UTP14, U3 ( 766) 3726 673.4 9.1e-191 gi|58477523|gb|AAH89407.1| UTP14C protein [Homo sa ( 766) 3725 673.2 1e-190 gi|68566167|sp|Q5TAP6.1|UT14C_HUMAN RecName: Full= ( 766) 3725 673.2 1e-190 gi|115305104|gb|AAI22537.1| UTP14, U3 small nucleo ( 766) 3723 672.9 1.3e-190 gi|109120818|ref|XP_001106440.1| PREDICTED: simila ( 770) 3718 672.0 2.5e-190 gi|122140391|sp|Q3T0Q8.1|UT14A_BOVIN RecName: Full ( 770) 3577 646.9 8.6e-183 gi|151554805|gb|AAI47905.1| UTP14A protein [Bos ta ( 770) 3497 632.7 1.6e-178 gi|194385960|dbj|BAG65355.1| unnamed protein produ ( 717) 3458 625.7 1.9e-176 gi|149060095|gb|EDM10911.1| rCG53178 [Rattus norve ( 596) 3406 616.4 1e-173 gi|109132237|ref|XP_001091813.1| PREDICTED: simila ( 841) 3374 610.9 6.6e-172 gi|38328457|gb|AAH62165.1| Utp14a protein [Mus mus ( 479) 3018 547.4 4.8e-153 gi|194391304|dbj|BAG60770.1| unnamed protein produ ( 719) 3004 545.1 3.7e-152 gi|114690138|ref|XP_529149.2| PREDICTED: UTP14, U3 ( 603) 2957 536.6 1.1e-149 gi|149567541|ref|XP_001513805.1| PREDICTED: simila ( 806) 2767 503.0 1.9e-139 gi|67971576|dbj|BAE02130.1| unnamed protein produc ( 564) 2719 494.3 5.4e-137 gi|126342348|ref|XP_001373835.1| PREDICTED: simila ( 844) 2693 489.8 1.8e-135 gi|56789221|gb|AAH88326.1| Utp14a protein [Rattus ( 444) 2458 447.8 4.2e-123 gi|123232998|emb|CAM15686.1| novel protein similar ( 785) 2067 378.6 5.2e-102 gi|36956697|gb|AAQ87009.1| juvenile spermatogonial ( 780) 1963 360.1 1.9e-96 gi|68566179|sp|Q6EJB6.2|UT14B_MOUSE RecName: Full= ( 756) 1958 359.2 3.5e-96 gi|75992943|ref|NP_001001981.2| UTP14, U3 small nu ( 780) 1958 359.2 3.5e-96 gi|74141089|dbj|BAE22106.1| unnamed protein produc ( 283) 1790 329.0 1.6e-87 gi|46250218|gb|AAH68815.1| LOC398529 protein [Xeno ( 765) 1700 313.3 2.2e-82 gi|27696885|gb|AAH43791.1| LOC398529 protein [Xeno ( 470) 1676 308.9 3e-81 gi|51703858|gb|AAH80963.1| UTP14, U3 small nucleol ( 769) 1623 299.7 2.9e-78 gi|57208319|emb|CAI42909.1| UTP14, U3 small nucleo ( 320) 1553 286.9 8.5e-75 gi|210081343|gb|EEA30277.1| hypothetical protein B ( 718) 1517 280.8 1.3e-72 gi|118089318|ref|XP_420142.2| PREDICTED: similar t ( 394) 1258 234.5 6e-59 gi|12849273|dbj|BAB28277.1| unnamed protein produc ( 194) 1141 213.5 6.4e-53 gi|36956711|gb|AAQ87010.1| juvenile spermatogonial ( 285) 1133 212.2 2.3e-52 gi|26337947|dbj|BAC32659.1| unnamed protein produc ( 245) 1058 198.8 2.1e-48 gi|115762621|ref|XP_790749.2| PREDICTED: similar t ( 680) 1045 196.9 2.2e-47 gi|199428860|emb|CAR65353.1| DEHA2A02882p [Debaryo ( 892) 883 168.2 1.3e-38 gi|50405659|ref|XP_456468.1| hypothetical protein ( 892) 880 167.7 1.8e-38 gi|62204285|gb|AAH92741.1| LOC553498 protein [Dani ( 260) 847 161.3 4.3e-37 gi|49900604|gb|AAH76128.1| LOC553498 protein [Dani ( 239) 840 160.1 9.5e-37 gi|92097668|gb|AAI15113.1| LOC553498 protein [Dani ( 240) 837 159.5 1.4e-36 gi|190581406|gb|EDV21483.1| hypothetical protein T ( 670) 842 160.8 1.6e-36 gi|49526409|emb|CAG60033.1| unnamed protein produc ( 878) 837 160.0 3.6e-36 gi|156113032|gb|EDO14638.1| hypothetical protein K ( 883) 827 158.3 1.2e-35 gi|49648656|emb|CAG80976.1| YALI0D13464p [Yarrowia ( 970) 826 158.1 1.5e-35 gi|44982257|gb|AAS51566.1| ADL353Cp [Ashbya gossyp ( 865) 811 155.4 8.7e-35 >>gi|68566172|sp|Q640M1.1|UT14A_MOUSE RecName: Full=U3 s (767 aa) initn: 4966 init1: 4966 opt: 4966 Z-score: 4772.1 bits: 893.7 E(): 0 Smith-Waterman score: 4966; 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