FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1347.ptfa, 915 aa vs ./tmplib.26680 library 1768102 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0700+/-0.00395; mu= 12.9830+/- 0.264 mean_var=75.9428+/-17.507, 0's: 0 Z-trim: 11 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1472 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0703 ( 810 res) mbp06179 ( 810) 3708 798 0 mKIAA4195 ( 1061 res) mbg00956 (1061) 725 164 6.8e-41 mKIAA0778 ( 1022 res) mph00577 (1022) 512 119 2.7e-27 mKIAA4139 ( 1059 res) mfj21022 (1059) 504 117 9.1e-27 mKIAA1825 ( 1100 res) mfj34163 (1100) 189 51 1.3e-06 mKIAA0611 ( 1093 res) mbh02036 (1093) 138 40 0.0023 mKIAA0715 ( 889 res) mbp06183 ( 889) 134 39 0.0036 >>mKIAA0703 ( 810 res) mbp06179 (810 aa) initn: 1920 init1: 1920 opt: 3708 Z-score: 4251.1 bits: 797.7 E(): 0 Smith-Waterman score: 3708; 67.980% identity (68.401% ungapped) in 812 aa overlap (56-864:1-810) 30 40 50 60 70 80 mKIAA1 LAVSEVAGLLQADLQNGLNKSEVSHRRAFHGWNEFDISEDEPLWKKYISQFKNPLIMLLL ::::: .. ::.::::..::.::::.::: mKIAA0 GWNEFVTDNAEPVWKKYLDQFRNPLILLLL 10 20 30 90 100 110 120 130 140 mKIAA1 ASAVISILMRQFDDAVSITVAIVIVVTVAFVQEYRSEKSLEELSKLVPPECHCVREGKLE .:.:.:.: ....:::::..:..:::::.:.::::::::::::.:::::::.:.:.:::. mKIAA0 GSSVVSVLTKEYEDAVSIALAVLIVVTVGFIQEYRSEKSLEELTKLVPPECNCLRDGKLR 40 50 60 70 80 90 150 160 170 180 190 200 mKIAA1 HTLARDLVPGDTVCLSVGDRVPADLRLFEAVDLSVDESSLTGETAPCSKVTAPQPAANGD : ::::::::: : ::.:::.:::.:: :..:: :::::.:::. ::.:. .: : .:: mKIAA0 HMLARDLVPGDIVSLSMGDRIPADIRLTEVTDLLVDESSFTGEVEPCGKTDSPL-ADGGD 100 110 120 130 140 210 220 230 240 250 260 mKIAA1 LASRSNIAFMGTLVRCGKAKGIVIGTGENSEFGEVFKMMQAEEAPKTPLQKSMDLLGKQL :.. ::..::::::.:::..:.::::::.:.::::::::.:::.:::::::::: ::::: mKIAA0 LSTLSNVVFMGTLVQCGKGQGVVIGTGEQSQFGEVFKMMRAEETPKTPLQKSMDKLGKQL 150 160 170 180 190 200 270 280 290 300 310 320 mKIAA1 SFYSFGIIGIIMLVGWLLGKDILEMFTISVSLAVAAIPEGLPIVVTVTLALGVMRMVKKR ...::::::..:::::. :: .: :::..:::::::::::::::: :::.:::.::.::: mKIAA0 TIFSFGIIGLLMLVGWVQGKPFLSMFTVGVSLAVAAIPEGLPIVVMVTLVLGVLRMAKKR 210 220 230 240 250 260 330 340 350 360 370 380 mKIAA1 AIVKKLPIVETLGCCNVICSDKTGTLTKNEMTVTHILTSDGLHAEVTGVGYNQFGEVIV- .:::::::::::::::::::::::::: ::::.:...::::.::::.::::. : : . mKIAA0 VIVKKLPIVETLGCCNVICSDKTGTLTANEMTATQLVTSDGFHAEVSGVGYSGEGTVCLL 270 280 290 300 310 320 390 400 410 420 430 440 mKIAA1 -DGDVVHGFYNPAVSRIVEAGCVCNDAVIRNNTLMGKPTEGALIALAMKMGLDGLQQDYI . .:..:: : .:...:::::: :.::::.:..::.::::::..:::::.: .....:. mKIAA0 PSKEVIKGFDNVSVGKLVEAGCVANNAVIRKNAVMGQPTEGALVVLAMKMNLGSIKDSYV 330 340 350 360 370 380 450 460 470 480 490 500 mKIAA1 RKAEYPFSSEQKWMAVKCVHRTQQDRPEICFMKGAYEQVIKYCTTYNSKGQTLALTQQQR :: : :::::::::::.: ... : .: :::::.:.::..:. ::. : : :: ::. mKIAA0 RKKEIPFSSEQKWMAVRCGPKSE-DGEDIYFMKGAFEEVIHHCSMYNNGGIPLPLTPQQK 390 400 410 420 430 440 510 520 530 540 550 560 mKIAA1 DLYQQEKARMGSAGLRVLALASGPELGQLTFLGLVGIIDPPRTGVKEAVTTLIASGVSIK . :::. .::: ::::::::::::::.::::::::::::::.:::::: .: ::::.: mKIAA0 SYCQQEEKKMGSLGLRVLALASGPELGRLTFLGLVGIIDPPRAGVKEAVQVLSESGVSVK 450 460 470 480 490 500 570 580 590 600 610 620 mKIAA1 MITGDSQETAIAIASRLGLYSKTSQSVSGEEVDTMEVQHLSQIVPKVAVFYRASPRHKMK :.:::. :::.::. .:: .. ...:::::. : :. : .:.::.:.::.::.: mKIAA0 MVTGDALETALAIGRTIGLCNEKLKAMSGEEVEGTEQGALAARVRQVSVFFRTSPKHKVK 510 520 530 540 550 560 630 640 650 660 670 680 mKIAA1 IIKSLQKNGAVVAMTGDGVNDAVALKAADIGVAMGQTGTDVCKEAADMILVDDDFQTIMS :::.::..::.::::::::::.::::.::::.::::::::: ::::.::::::::..::: mKIAA0 IIKALQESGAIVAMTGDGVNDSVALKSADIGIAMGQTGTDVSKEAANMILVDDDFSAIMS 570 580 590 600 610 620 690 700 710 720 730 740 mKIAA1 AIEEGKGIYNNIKNFVRFQLSTSIAALTLISLATLMNFPNPLNAMQILWINIIMDGPPAQ :.::::::. :::::::::::::::::.::.:.:. :.:.:::::::::.:::::::::: mKIAA0 AVEEGKGIFYNIKNFVRFQLSTSIAALSLITLSTVCNLPSPLNAMQILWVNIIMDGPPAQ 630 640 650 660 670 680 750 760 770 780 790 800 mKIAA1 SLGVEPVDKDVIRKPPRNWKDSILTKNLILKILVSSIIIVCGTLFVFWRELRDN-VITPR ::::::::.:..:.:::. :.::.. :::..:.:. .:. ::::.::::. : . ::: mKIAA0 SLGVEPVDRDALRRPPRSVGDTILNRALILRVLMSAAVIIGGTLFIFWREIPANGTSTPR 690 700 710 720 730 740 810 820 830 840 850 860 mKIAA1 DTTMTFTCFVFFDMFNALSSRSQTKSVFEIGLCSNKMFCYAVLGSIMGQLLVIYFPPLQK :::.::::::::.::::: ::::: .::::. :.:: :.::::..::: ::: ::::: mKIAA0 TTTMAFTCFVFFDLFNALSCRSQTKLIFEIGFFRNRMFLYSVLGSLLGQLAVIYAPPLQK 750 760 770 780 790 800 870 880 890 900 910 mKIAA1 VFQTESLSILDLLFLLGLTSSVCIVSEIIKKVERSREKVQKNAGSASSSFLEV :: mKIAA0 VF 810 >>mKIAA4195 ( 1061 res) mbg00956 (1061 aa) initn: 1413 init1: 376 opt: 725 Z-score: 826.5 bits: 164.4 E(): 6.8e-41 Smith-Waterman score: 1596; 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