FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mFLJ00164.ptfa, 1012 aa vs ./tmplib.26680 library 1768005 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.3604+/-0.0043; mu= 20.3093+/- 0.288 mean_var=85.9218+/-19.288, 0's: 0 Z-trim: 2 B-trim: 6 in 1/35 Lambda= 0.1384 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1985 ( 947 res) msh05001 ( 947) 1828 376 1.8e-104 >>mKIAA1985 ( 947 res) msh05001 (947 aa) initn: 1583 init1: 974 opt: 1828 Z-score: 1967.9 bits: 375.6 E(): 1.8e-104 Smith-Waterman score: 1828; 38.264% identity (39.755% ungapped) in 933 aa overlap (51-962:1-919) 30 40 50 60 70 80 mFLJ00 SSVPRCLACPGVWAGTWPLASLESAIFLSEEERSFFRSEGHFSDEDARRLLSRTSGTDVC :::: . : : . .: . ::. mKIAA1 EERSSLWSPGSERKAECSGFLCSLAHTDIT 10 20 30 90 100 110 120 130 140 mFLJ00 TTCSLDWLEEAEGEQLEQREMSLPHLNPEPHGTLQMVKNILEKCKACPDHPEAPVSWSLG . :. .: .. : . . . : : .. . . .. . .: : mKIAA1 SIYRLSEFEAIQNLQNDLSASQPEGFREARSGGTWMERQTIGSRRSSGSGDSSPEEDELI 40 50 60 70 80 90 150 160 170 180 190 mFLJ00 GVSRRASSL----DLEEPRFCLDP----EDDWTDPEPLDSLLQVLNAPGYGAHFRSLYDI ..: . : ::..:.. .: :.: : : . .: :. :: ::.::::. mKIAA1 SASSDSYHLPEPEDLDDPELFMDLSTSLEED--DVEHFAPILAFLDHEGYTDHFKSLYDF 100 110 120 130 140 200 210 220 230 240 250 mFLJ00 SLPWLSTALYGFDDEEELAERLAQARGVAKKVDLSMALARLCLLLGRLCARKLKLSQARV :. .:....:.:..:.::. : .: :: .. : ::::.::::: :: ::::::: mKIAA1 SFSFLTSSFYSFSEEDELVAYLETSRKWAKMSHMTWAHARLCFLLGRLSIRKTKLSQARV 150 160 170 180 190 200 260 270 280 290 300 310 mFLJ00 YFEEALGALEGSFGDLSLVAAVYSSLTTVYLKQKNAEKCVQVAPKAAALLLGTPGHSCNA :::::. .:.:.: :::::::.: .:...::.:. .: . ::.::: : : .. mKIAA1 YFEEAIRVLDGAFEDLSLVAALYINLAAIYLRQRLRHKGPTLLEKAGALLACLPDHEFST 210 220 230 240 250 260 320 330 340 350 360 370 mFLJ00 DAEL--LKYALRRVICGLSPQAEARACFLLARHYTHLKQPEEALPYLERLLRLNRDAGSP :: . :.::. : : :::.::: : : . ::..:. ::: :. : : mKIAA1 KNELDVVTYVLRQGIVVGSGLLEARSCFLAIRLLLSLGRHEEVVPFAERLQLLS---GHP 270 280 290 300 310 320 380 390 400 410 420 mFLJ00 QASWPEDCYLLLADIYGRKCLPHLALSCLRVSSLWTRCSLPGSLRSVDLVLQN------V :: : .:...: .: :::::.. .. . . .. :. .. ::::: : mKIAA1 PAS--EATATMLSSLYDKKYLPHLAVASVQKRGPQSARGMSLSIWQAYLVLQNATKILGV 330 340 350 360 370 380 430 440 450 460 470 480 mFLJ00 PGPNSQRRAGHSLPSQIAYYLRQALASLAPGTGQALRGPLYASLAQLYSHHQQYSQAIAF :. : . .. . :. ::::::. . : .. : :...: .::. . .. . mKIAA1 PSSNWCEVSALACPT-----LRQALAACEEQSDQDIQRTLCLILSKMYLQHQSPDGSVHY 390 400 410 420 430 490 500 510 520 530 540 mFLJ00 MSQAAEADTAAGVHPVVDRLVALAWLHMLCGNSLVAMDILK---CISDAAVANKDQECVM .::: : . . . . ::: ..: .. :..::. : : . :. :. mKIAA1 LSQAHVLGKLLGEEEAFESSLCLAWAYLLGRQTEKALEILEPLLC-SLRETECVTQRGVV 440 450 460 470 480 490 550 560 570 580 590 600 mFLJ00 MNMVAMALKRMGRTRQAAEGYFRALHMAYAQGHLQSQAVVLANFGALCLQAGARSLAQHY :....:.. ::: .::..:.::: : .:....::: .::.: : :.. .. :. : mKIAA1 HNLLGLAFEDEGRTSRAAKSYLRALIRAREMGNIRNQAVSMANLGHLTLKSCMQQSARGY 500 510 520 530 540 550 610 620 630 640 650 mFLJ00 LREAVGLFSQVP-SGVCGRDFTQVLLWLGQLCTR-RALPQQAKCYYEWAFLVAVETDHLE : .:: :.:.. : ...:::::::: . . : .. :: : :.: ... .:: mKIAA1 LLQAVRLYSELQASKETDMELVQVLLWLGQASVSGHQLVHSRLCY-EMALLFGLRHQHLS 560 570 580 590 600 610 660 670 680 690 700 710 mFLJ00 SQLQAVQKLCLFYSKVMPNEVRCVIYHEFQLALARKTANKVLEGQLLEAISQLYLSLGTE ::::....:: :::.: :: :. ::: ::::.. .. .::::::...::: .:.: mKIAA1 SQLQVTKSLCHFYSSVSPNPDACITYHEHWLALAQQLRDREMEGQLLESLGQLYRNLNTS 620 630 640 650 660 670 720 730 740 750 760 770 mFLJ00 RAYKSALDYTKRSLGIFIDLQQKEKEARAWLQAGKIYYILRQNELVDLYIQVAQNAALYT :. . .: :.:: ::.:: ...: :.::: ::...:.....:::.::.: : ..:: . mKIAA1 RSLRRSLACIKESLRIFVDLGERDKAAEAWLGAGRLHYLMQEDELVELYLQEAIQTALRS 680 690 700 710 720 730 780 790 800 810 820 830 mFLJ00 GDPKLGLELFEAAGDIFFNGTWEREKAVSFYRDRALPLAVTVGDQEVELRLCNKLVALLS .:.:.:.:.: :::.::::: .:..:: .:: :.::: . ..:::. :::. : mKIAA1 EEPSLALKLYEEAGDVFFNGTRHRHRAVEYYRAGAVPLARRMKALRTELRIFNKLTELQI 740 750 760 770 780 790 840 850 860 870 880 890 mFLJ00 ALEAPQEGLEFAHEALALSITLGDRLNERVAYHRLATLHHRLGHGELAEHFFLKALSLCS .::. ...:::: : ::. ::. .: ::.:::::.. :. :.:: .::.:::: mKIAA1 SLEGYEKALEFATLAARLSVLTGDQKQELVAFHRLATVYFSLNMYEMAEDCYLKTLSLCP 800 810 820 830 840 850 900 910 920 930 940 950 mFLJ00 SPLEFDEETLYYVKVYLVLGDIIFYDLKDPFDAAGYYQLALAAAVDLGHKKAQLKIYTRL :. .:.:::.::: :: . ::.::: ::. :. ::::::: .: .. : : .:: mKIAA1 PWLQSPKEALYYAKVYCRLGRLTFYQLKDAHDATEYFLLALAAAVLMGDEELQNTIKNRL 860 870 880 890 900 910 960 970 980 990 1000 1010 mFLJ00 ATIYHHFLVDREMSLFFYQKARTFASELNLRRTNLVPQRFCGRAPWLAPGHPS .: mKIAA1 DSICQSPLWHSNPFGCSSERARWLSGGSLAL 920 930 940 1012 residues in 1 query sequences 1768005 residues in 2168 library sequences Scomplib [34t11] start: Mon Mar 27 10:07:39 2006 done: Mon Mar 27 10:07:40 2006 Scan time: 1.020 Display time: 0.090 Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]