FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1739.ptfa, 755 aa vs ./tmplib.26680 library 1768262 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6781+/-0.00616; mu= 9.4138+/- 0.409 mean_var=189.2304+/-45.529, 0's: 0 Z-trim: 11 B-trim: 134 in 1/35 Lambda= 0.0932 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4225 ( 868 res) mfj58259 ( 868) 1569 224 5.8e-59 mKIAA1745 ( 871 res) mid29072 ( 871) 1483 212 1.8e-55 mKIAA4055 ( 794 res) mfj06069 ( 794) 988 146 1.8e-35 mKIAA0331 ( 574 res) mph02015 ( 574) 646 99 1.1e-21 mKIAA1479 ( 1009 res) mbg01940 (1009) 635 98 4.2e-21 mKIAA1869 ( 774 res) mph01643 ( 774) 601 94 8.5e-20 mKIAA1619 ( 240 res) mpg02927 ( 240) 364 61 1.6e-10 >>mKIAA4225 ( 868 res) mfj58259 (868 aa) initn: 1090 init1: 489 opt: 1569 Z-score: 1150.9 bits: 223.9 E(): 5.8e-59 Smith-Waterman score: 1569; 46.154% identity (47.866% ungapped) in 559 aa overlap (17-566:100-647) 10 20 30 40 mKIAA1 RLWSCKERSLGRLQLRRKLNVPRKGRA-QTECFNFIRFLQPYNSSH .: . .::.. ::::.:.:: ::: .:. mKIAA4 YVGAREAVFAVNALNISEKQHEVYWKVSEDKKSKCAEKGKSKQTECLNYIRVLQPLSSTS 70 80 90 100 110 120 50 60 70 80 90 100 mKIAA1 LYVCGTYAFQPKCTYINMLTFTLDRAEFEDGKGKCPYDPAKGHTGLLVDGELYSATLNNF :::::: :::: : ..:. .: . .. :::::.::.:::...:...: :::::.: :: mKIAA4 LYVCGTNAFQPTCDHLNLTSFKF-LGKSEDGKGRCPFDPAHSYTSVMVGGELYSGTSYNF 130 140 150 160 170 180 110 120 130 140 150 160 mKIAA1 LGTEPVILRYMGTHHSIKTEYLAFWLNEPHFVGSAFVPESVGSFTGDDDKIYFFFSERAV ::.::.: : ..: ..::: ::::: :: . . .: . :.:::.::::.: .: mKIAA4 LGSEPIISRN-SSHSPLRTEYAIPWLNEPSFVFADVIQKSPDGPEGEDDKVYFFFTEVSV 190 200 210 220 230 240 170 180 190 200 210 220 mKIAA1 EYDCYSEQVVARVARVCKGDMGGARTLQKKWTTFLKARLVCSAPDWKVYFNQLKAVHTLR ::. . .. :::::::::.:: ::::::::.::::::.:: :: . :: :. : .:: mKIAA4 EYEFVFKLMIPRVARVCKGDQGGLRTLQKKWTSFLKARLICSKPDSGLVFNILQDVFVLR 250 260 270 280 290 300 230 240 250 260 270 280 mKIAA1 GASWHNTTFFGVFQARWGDMDLSAVCEYQLEQIQQVF-EGPYKEYS--EQAQ-KWARYTD . . .. .:..:: . ... ::::: : : .. :: .: : . . ::.. ::.::. mKIAA4 APGLKEPVFYAVFTPQLNNVGLSAVCAYTLATVEAVFSRGKYMQSATVEQSHTKWVRYNG 310 320 330 340 350 360 290 300 310 320 330 340 mKIAA1 PVPSPRPGSCINNWHRDNGYTSSLELPDNTLNFIKKHPLMEDQVKPRLGRPLLVKKNTNF :::.::::.::.. : .:::::.:::.::.:.: ::::.:.: : .:: :.::..:. mKIAA4 PVPTPRPGACIDSEARAANYTSSLNLPDKTLQFVKDHPLMDDSVTPIDNRPKLIKKDVNY 370 380 390 400 410 420 350 360 370 380 390 400 mKIAA1 THVVADRVPGLDGATYTVLFIGTGDGWLLKAVSLGPWIHMVEELQVF-DQEPVESLVLSQ :..:.::. .:::. : :.::.: : : ::: : .:..:: :.: :.::: .:.::. mKIAA4 TQIVVDRTQALDGTFYDVMFISTDRGALHKAVILTKEVHVIEETQLFRDSEPVLTLLLSS 430 440 450 460 470 480 410 420 430 440 450 mKIAA1 SK--KVLFAGSRSQLVQLSLADCTKYRFCVDCVLARDPYCAWNVNTSRCVATTSGRSGSF .: : ..::: : .:: :: : :. : ::::::::::::. . ::. . ...: mKIAA4 KKGRKFVYAGSNSGVVQAPLAFCEKHGSCEDCVLARDPYCAWSPAIKACVTLHQEEASSR 490 500 510 520 530 540 460 470 480 490 500 510 mKIAA1 -LVQHVANLDTSKMCNQYGIKKVRSIPKNITVVSGTDLVLPCHLSSNLAHAHWTFGSQDL .: ... :::. : . :. .:. ... .:: : : .::::.. : : . .: mKIAA4 GWIQDMSG-DTSS-CLD---KSKESFNQHFFKHGGTAE-LKCFQKSNLARVVWKFQNGEL 550 560 570 580 590 600 520 530 540 550 560 570 mKIAA1 PAEQPGSFLYDTGLQALVVMAAQSRHSGPYRCYSEEQGTRLAAESYLVAVVAGSSVTLEA : .: .. . .: . :... .. :: :.: :::. .: . : :.: mKIAA4 KAASP-KYGF-VGRKHLLIFNLSDGDSGVYQCLSEER-VRNKTVSQLLAKHVLEVKMVPR 610 620 630 640 650 580 590 600 610 620 630 mKIAA1 RAPLENLGLVWLAVVALGAVCLVLLLLVLSLRRRLREELEKGAKASERTLVYPLELPKEP mKIAA4 TPPSPTSEDAQTEGSKITSKMPVASTQGSSPPTPALWATSPRAATLPPKSSSGTSCEPKM 660 670 680 690 700 710 >>mKIAA1745 ( 871 res) mid29072 (871 aa) initn: 976 init1: 410 opt: 1483 Z-score: 1088.4 bits: 212.3 E(): 1.8e-55 Smith-Waterman score: 1508; 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