FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1955.ptfa, 1073 aa vs ./tmplib.26680 library 1767944 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8209+/-0.00407; mu= 17.1494+/- 0.272 mean_var=84.6814+/-19.933, 0's: 0 Z-trim: 3 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1394 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mFLJ00327 ( 881 res) mid41093 ( 881) 1014 215 5.3e-56 mKIAA1008 ( 451 res) mpm08036 ( 451) 892 190 8.2e-49 mKIAA1769 ( 1622 res) mtg00072 (1622) 398 91 1.5e-18 >>mFLJ00327 ( 881 res) mid41093 (881 aa) initn: 879 init1: 281 opt: 1014 Z-score: 1097.7 bits: 214.6 E(): 5.3e-56 Smith-Waterman score: 1072; 30.120% identity (35.971% ungapped) in 830 aa overlap (232-956:45-844) 210 220 230 240 250 mKIAA1 VISFKNYLDNFWPDLKAAHDLCDSILQSRRERETESQETHGKE---YPEHLPLEVLEAGI ....... .::. . .. : . :. mFLJ00 PDYKLNLRSPGTPRGVSSVVGPSAVGASPGDKKSKNKSMRGKKKSIFETYMSKEDVSEGL 20 30 40 50 60 70 260 270 280 290 300 310 mKIAA1 KSGRYIQGILNVNKHRAQIEAFVRLHGASSKDSGLVSDILIHGSKARNRSIHGDVVVVEM : : :::.: .: .. . :::. : :. ::.: : ::::...::.:::.. mFLJ00 KRGTLIQGVLRINPKKFH-EAFI-----PSPDGD--RDIFIDGVVARNRALNGDLVVVKL 80 90 100 110 120 320 330 mKIAA1 LPKSEWK----------------------------------GRT-------AALGENDSD ::...:: : . : . ..::. mFLJ00 LPEDQWKAVKPESNDKEIEATYEADIPEEGCGHHPLQQSRKGWSGPDVIIEAQFDDSDSE 130 140 150 160 170 180 340 350 360 mKIAA1 DK---ASG----------ESPSE---------------PMPT---GRVVGILQKNWRDYV :. .:: .:.. :.: : :::. . : mFLJ00 DRHGNTSGLVDGVKKLSISTPDRGKEDSSTPVMKDENTPIPQDTRGLSEKSLQKSAK-VV 190 200 210 220 230 240 370 380 390 400 410 mKIAA1 VTFPSKEEVQSQG-------KNA----QKILVTPWDYRIPKIRISTQQAEALQDFRV--- . .:. . : ::. . : .: :.:.:.: . .. ::: . mFLJ00 YILEKKHSRAATGILKLLADKNSDLFKKYALFSPSDHRVPRIYVPLKDCP--QDFMTRPK 250 260 270 280 290 300 420 430 440 450 460 mKIAA1 -------VVRIDSWEATSVYPNGHFVRVLGRIGDLEGEIATILVENSISVVPFSEAQMCE . :: .:. . :.... ::. :..: : ::.: ... :: . mFLJ00 DFANTLFICRIIDWKEDCNFALGQLAKSLGQAGEIEPETEGILTEYGVDFSDFSSEVLEC 310 320 330 340 350 360 470 480 490 500 510 520 mKIAA1 MPVNTPENPWKVSPKEEQERKDLRTTHLVFSIDPKGCEDVDDTLSVRTLNNGNLELGVHI .: . : : . : : .:.::: .:.:::. .:.::.:. : :..:..:.:::: mFLJ00 LPQSLP---WTIPPDEVGKRRDLRKD-CIFTIDPSTARDLDDALACRRLTDGTFEVGVHI 370 380 390 400 410 530 540 550 560 570 580 mKIAA1 ADVTHFVAPNSYIDVEARTRATTYYLADRRYDMLPSILSADLCSLLGGVDRYAVSVMWEL :::..:: .: .: : :::. ::... ::: .: .:::: .:. . ::.:.: mFLJ00 ADVSYFVPEGSSLDKVAAERATSVYLVQKVVPMLPRLLCEELCSLNPMTDKLTFSVIWKL 420 430 440 450 460 470 590 600 610 620 630 640 mKIAA1 DKTSYEIKKVWYGRTIIRSAYKLFYEAAQELLDGNFSIVDDIPELKALDKQSQQAKLEEL . .: . :.::::::: :: :. :: .... .. ::: . : : . ..::. mFLJ00 TPEG-KILEEWFGRTIIRSCTKLSYDHAQSMIENP---TEKIPE-EELPPISPEHSVEEV 480 490 500 510 520 530 650 660 670 680 690 700 mKIAA1 VWAIGKLTDIARHIRAKRDRCGALELEGVEVRVQLDDKKNI-RDLIPKQPLEVHETVAEC :. .: .::...: .: :::.:. ... :: . .. . . . .. : : mFLJ00 HQAVLNLHSIAKQLRRQRFVDGALRLDQLKLAFTLDHETGLPQGCHIYEYRDSNKLVEEF 540 550 560 570 580 590 710 720 730 740 750 760 mKIAA1 MILANHWVAKKIWESFPHQALLRQHPPPHQEFFSELRECAKAKGFFIDTRSNKTLADSLD :.::: ::.::...::.:::::.::::. ...:.: : :. .:. : .: :: mFLJ00 MLLANMAVAHKIFRTFPEQALLRRHPPPQTKMLSDLVEFCDQMGLPMDVSSAGALNKSLT 600 610 620 630 640 650 770 780 790 800 810 820 mKIAA1 SA-NDPKDPLVNK-LLRSMATQAMSNALYFSTGSCAE-EEFHHYGLALDKYTHFTSPIRR .. .: : :. : .: .: .. :. :::: .: . :.:.::.: . :::::::::: mFLJ00 KTFGDDKYSLARKEVLTNMYSRPMQMALYFCSGMLQDQEQFRHYALNVPLYTHFTSPIRR 660 670 680 690 700 710 830 840 850 860 870 880 mKIAA1 YSDIVVHRLLMAAISKDKKMEIKENLFSNKNLEELCRHINNRNRAAQRSQKQSTELFQCM ..:..::::: ::.. ... ... . .:.. : :.: :..: :. : :: . mFLJ00 FADVIVHRLLAAALGYSEQPDVEPD-----TLQKQADHCNDRRMASKRVQELSIGLFFAV 720 730 740 750 760 890 900 910 920 930 mKIAA1 YFKDRDAETEERCIADGVIYSIRTNGVLVFIPRFGIKGAAY-----LKNKDSLVISCGPE :. .. : . .. ::. ... :.. :::.. : :.. . .. :: mFLJ00 LVKE-SGPLESEAMVMGVL----NQAFDVLVLRFGVQKRIYCNALALRSYSFQKVGKKPE 770 780 790 800 810 820 940 950 960 970 980 990 mKIAA1 GSSEWKPGSLQRSQNKIISTTAGGQSVTFHLFDHVTVRISVQASRCHSDTIRLEIVSNKP . :.: .:.. .. . : mFLJ00 LTLVWEPDDLEEEPTQQVITIFSLVDVVLQAEATALKYSAILKRPGLEKASDEEPED 830 840 850 860 870 880 >>mKIAA1008 ( 451 res) mpm08036 (451 aa) initn: 899 init1: 362 opt: 892 Z-score: 968.7 bits: 189.7 E(): 8.2e-49 Smith-Waterman score: 984; 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