FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0662.ptfa, 1038 aa vs ./tmplib.26680 library 1767979 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.1878+/-0.00812; mu= -5.8858+/- 0.538 mean_var=384.0099+/-90.129, 0's: 0 Z-trim: 4 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0654 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1111 ( 1005 res) mbg06704 (1005) 1677 173 1.8e-43 mKIAA3014 ( 1304 res) mbg08774 (1304) 598 71 9.9e-13 >>mKIAA1111 ( 1005 res) mbg06704 (1005 aa) initn: 2837 init1: 1673 opt: 1677 Z-score: 872.8 bits: 173.1 E(): 1.8e-43 Smith-Waterman score: 2823; 46.843% identity (52.872% ungapped) in 1061 aa overlap (2-1038:42-1005) 10 20 mKIAA0 KSTLKKKR---TWHKHGPGPTPDVKPVQNGS : .::.: : . : ::...:: mKIAA1 FHGSCVGVEEEKAADIDLYHCPNCEVLHGPSIMKKRRGSSKGHDNHKG-----KPLKTGS 20 30 40 50 60 30 40 50 60 70 80 mKIAA0 QLFIKELRSRTFPSAEDVVSRVPGSQLTVGYMEEHGFTEPILVPKKDGLGLAVPAPTFYV ..::.:::.::: :...:. . :::::: ..::..:. :::: ::::::...:.:.: : mKIAA1 SMFIRELRGRTFDSSDEVILKPTGSQLTVEFLEENSFSVPILVLKKDGLGMTLPSPSFTV 70 80 90 100 110 120 90 100 110 120 130 140 mKIAA0 SDVENYVGPERSVDVTDVTKQKDCKMKLKEFVDYYYSTNRKRVLNVTNLEFSDTRMSSFV :::.::: .. .:: ::..: :::::: .:: :::: .:..:::: .:::::::.:..: mKIAA1 RDVEHYVGSDKEIDVIDVARQADCKMKLGDFVKYYYSGKREKVLNVISLEFSDTRLSNLV 130 140 150 160 170 180 150 160 170 180 190 200 mKIAA0 EPPDIVKKLSWVENYWPDDALLAKPKVTKYCLICVKDSYTDFHIDSGGASAWYHVLKGEK : : ::.::::::: ::.. .. .:.: ::::. :.::::::::: ::.:.::::::::: mKIAA1 ETPRIVRKLSWVENLWPEECVFERPNVQKYCLMSVRDSYTDFHIDFGGTSVWYHVLKGEK 190 200 210 220 230 240 210 220 230 240 250 260 mKIAA0 IFYLIRPASANISLYERWRSASNHSEMFFADQVDRCYKCTVKQGQTLFIPSGWIYATLTP :::::::..::..:.: : :.::..::::.:::..::::.::::::::::.:::.:.::: mKIAA1 IFYLIRPTNANLTLFECWSSSSNQNEMFFGDQVEKCYKCSVKQGQTLFIPTGWIHAVLTP 250 260 270 280 290 300 270 280 290 300 310 320 mKIAA0 VDCLAFAGHFLHSLSVEMQMRAYEVERRLKLGSLTQFPNFETACWYMGKHLLEAFKGSHK ::::::.:.:::::..:::..:::.:.::. ..: .:::::: :::.:::.:. :.: .. mKIAA1 VDCLAFGGNFLHSLNIEMQLKAYEIEKRLSTADLFKFPNFETICWYVGKHILDIFRGLRE 310 320 330 340 350 360 330 340 350 360 370 380 mKIAA0 SGKQLPPHLVQGAKILNGAFRSWTKKQALAEHEDELPEHFRPSQLIKDLAKEIRLSENAS . .. .::.:.: :: :::.::::.:: .::::.:: : :::::::.:::: :. mKIAA1 NRRHPASYLVHGGKALNLAFRAWTKKEALPDHEDEIPETVRTVQLIKDLAREIRLVEDIF 370 380 390 400 410 420 390 400 410 420 430 440 mKIAA0 KTVRPEVNAAASSDEVCDGDREKEEPPSPVETTPPRSLLEKVSKKKTSKTVKMPKPSKIP . :.. .:. . .: :. . : ..: : .:.: ::. mKIAA1 QQ-----NVGKTSN-IFGLQR-----IFPAGSIP-------LTKPAHSTSVSM---SKLS 430 440 450 460 450 460 470 480 490 500 mKIAA0 KPPKSPKPPKTLKLKDGSKKKGKKCKESAS--PTIP-NLDLLEAHTKEALTKMEPPKKGK : :. . : :: :: :: .: :.:.. :. . .:.. ....:: : : .:.: mKIAA1 LPSKNGSKKKGLKPKDIFKKAERKGKQSSALGPAGQLSYNLMDPYSHQAL-KTGPSQKAK 470 480 490 500 510 520 510 520 530 540 550 560 mKIAA0 TPKSVLSVPNKDTVHTQNDMERLEIREQTKSKSEAKWKYKNSKPDSLLKMEEEQRLEKSP : :. ..: .. :.. : .: .:: . . :: mKIAA1 FNMSGTSLNDSDDDSADMDLDGSE------------------NPLALLMANGSTKRMKSV 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 mKIAA0 LAGNKDKFSFSFSNRKLLGSKALRPPSSPGVFGALQSFKEDKAKPVRDEYEYVSDDGELK . . :.. . .. .:.. . :.: ::.. ::: ::. mKIAA1 SKSRRAKIAKKVDSARLVAEQ---------VMG--------------DEFDLDSDD-ELQ 570 580 590 600 630 640 650 660 670 680 mKIAA0 IDEFPIRRKKSAPKRDLSFLLDKKEALLMPTSKPKLDSAVYKSDDSSD---EGSLHIDTD ::: :. ..:. .: .: .:: : . . : . : : mKIAA1 IDE-------RLGKEKANLLIRSKFPRKLPRAKPCSDPNRIREPGEVEFDIEEDYTTDED 610 620 630 640 650 690 700 710 720 730 740 mKIAA0 TKPGRNAKVKKESGSSAAGILDLLQASEEVGALEYNPNSQPPASPSTQEAIQGMLSMANL : ..:. .::.:.::::::.::..::. .: .. :::::::::::::: :::: mKIAA1 MVEGVESKLG--NGSGAGGILDLLKASRQVGGPDYAALTEAPASPSTQEAIQGMLCMANL 660 670 680 690 700 710 750 760 770 780 790 mKIAA0 QASDSC-----LQTTWGTGQAKGGSLAAHGARKIGG---GNKGTGKRLLKRTA--KNSVD :.:.: ::. : :: .... .. : ... ... ::: .:: : :: . mKIAA1 QSSSSSPATSSLQAWWTGGQERSSGSSSSGLGTVSSSPASQRTPGKRPIKRPAYWKNESE 720 730 740 750 760 770 800 810 820 830 840 mKIAA0 LED---YEEQDHLDACFKDSDYVYPSLESDEDNPVFKSRSKKRKGSDDAPYSPTARVGPS :. .::: : :::::..:.:::::::.:.:..::: ::.:.:::::.:: ::: :. mKIAA1 EEENASLDEQDSLGACFKDAEYIYPSLESDDDDPALKSRPKKKKNSDDAPWSPKARVTPT 780 790 800 810 820 830 850 860 870 880 890 900 mKIAA0 VPRQDRPVREGTRVASIETGLAAAAAKLSQQEEQKNRKKKNTKRKPA-SNTASPSISTSA .:.:::::::::::::::::::::::::.::: :: .::: :.:: ... .: . : mKIAA1 LPKQDRPVREGTRVASIETGLAAAAAKLAQQELQKAQKKKYIKKKPLLKEVEQPRPQDS- 840 850 860 870 880 890 910 920 930 940 950 960 mKIAA0 SASTGTTSASTTPASTTPASTTPASTTPASTSTASSQASQEGSSPEPPPESHSSSLADHE .: : :: :. .::: ...: : ::: :. :.:::::: mKIAA1 -----------NPIMTMPAPTV--ATTPQPDTSSSPQPP-----PEPKQEALSGSLADHE 900 910 920 930 970 980 990 1000 1010 1020 mKIAA0 YTA-AGTFSGSQAGRASQPMAPGVFLTQRRPSASSPNNTAAKGKRTKKGMATAKQRLGKI ::: ..:. .::.:.. ::::::::::::::..: .. :..::: :::.::::::::.: mKIAA1 YTARPNAFGMAQANRSTTPMAPGVFLTQRRPSVGSQSSQAGQGKRPKKGLATAKQRLGRI 940 950 960 970 980 990 1030 mKIAA0 LKIHRNGKLLL ::::::::::: mKIAA1 LKIHRNGKLLL 1000 >>mKIAA3014 ( 1304 res) mbg08774 (1304 aa) initn: 811 init1: 562 opt: 598 Z-score: 320.9 bits: 71.3 E(): 9.9e-13 Smith-Waterman score: 884; 32.937% identity (35.470% ungapped) in 504 aa overlap (20-502:22-510) 10 20 30 40 50 mKIAA0 KSTLKKKRTWHKHGPGPTPDVKPVQNGSQLFIKE-LRSRTFPSAEDVVSRVPGSQLTV ::. . . . ..: :::. . . : : . :.... mKIAA3 DSGRRLRAIDRQRYDENEDLSDVEEIVSVRGFSLEEKLRSQLYQG--DFVHAMEGKDFNY 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 mKIAA0 GYMEEHGFTEPILVPKKDGLGLAVPAPTFYVSDVENYVGPERSVDVTDVTKQKDCKMKLK :...... :.. :::::. .: : : : ::. :: .: ::: ::. :: .:... mKIAA3 EYVQREALRVPLVFRDKDGLGIKMPDPDFTVRDVKLLVGSRRLVDVMDVNTQKGTEMSMS 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 mKIAA0 EFVDYYYS--TNRKRVLNVTNLEFSDTRMSSFVEPPDIVKKLSWVENYWPD--------- .:: :: . ..: .. :: .:::: :.. .:. : .: ..::.:.::. mKIAA3 QFVRYYETPEAQRDKLYNVISLEFSHTKLEHLVKRPTVVDLVDWVDNMWPQHLKEKQTEA 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 mKIAA0 -DAL--LAKPKVTKYCLICVKDSYTDFHIDSGGASAWYHVLKGEKIFYLIRPASANISLY .:: . ::: ::::. :: .:::::: ::.:.::::..: :::.:: :. :..:: mKIAA3 TNALAEMKYPKVKKYCLMSVKGCFTDFHIDFGGTSVWYHVFRGGKIFWLIPPTLHNLALY 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 mKIAA0 ERWRSASNHSEMFFADQVDRCYKCTVKQGQTLFIPSGWIYATLTPVDCLAFAGHFLHSLS :.: ....:..:..:.:.:: . .::: :.:::::::.:. :::: :.:.:..:::.. mKIAA3 EEWVLSGKQSDIFLGDRVERCQRIELKQGYTFFIPSGWIHAVYTPVDSLVFGGNILHSFN 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 mKIAA0 VEMQMRAYEVERRLKLGSLTQFPNFETACWY-MGKHLLEAFKGSHKSGK-QLPPHLVQGA : ::.: ::.: : .. ..: . ::: . ... . . :. . . : :... mKIAA3 VPMQLRIYEIEDRTRVQPKFRYPFYYEMCWYVLERYVYCVTQRSYLTQEYQRELMLIDAP 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 mKIAA0 KILN-GAFRSWTKKQALAEHEDELPEHFRPSQLIKDLAKEIRLSENASKTVRPEVNAAAS . . .: : . . : .. :.. . . .: .: ...:.:: .: .. .: mKIAA3 RKTSVDGFSSDSWLDMEEESCEQQPQEEEEEE--EDKEEE---GDGADKTPKPPTDDPTS 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 mKIAA0 --SDEVCDGDREKEEPPSPVETTPPRSLLEKVSKKKTSKTVKMPKPSKIPKPPK-SPKPP : : : ..: .:. :.: .. .... :...:: . :: : :: mKIAA3 PTSTPPEDQDSTGKKPKAPAIRFLKRTLSNE--SEESVKSTSMPMDD--PKTPTGSPATE 420 430 440 450 460 460 470 480 490 500 510 mKIAA0 KTLKLKDGSKKKGKKCKESASPTIPNLDLLEAHTKEALTKMEPPKKGKTPKSVLSVPNKD . : .. . : : . .:. : . : . .: :. mKIAA3 VSTKWTHLTEFELKGLKA----LVEKLESLPENKKCVPEGIEDPQALLEGVKNVLKEHVD 470 480 490 500 510 520 520 530 540 550 560 570 mKIAA0 TVHTQNDMERLEIREQTKSKSEAKWKYKNSKPDSLLKMEEEQRLEKSPLAGNKDKFSFSF mKIAA3 DDPTLAITGVPVVSWPKKTAKNRVVGRPKGKLGPASAVKLAANRTTAGARRRRTRCRKCE 530 540 550 560 570 580 1038 residues in 1 query sequences 1767979 residues in 2168 library sequences Scomplib [34t11] start: Mon Mar 27 10:25:40 2006 done: Mon Mar 27 10:25:41 2006 Scan time: 1.030 Display time: 0.160 Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]