FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0209.ptfa, 1567 aa vs ./tmplib.26680 library 1767450 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8320+/-0.0049; mu= 13.0777+/- 0.328 mean_var=125.5818+/-28.903, 0's: 0 Z-trim: 6 B-trim: 2 in 1/35 Lambda= 0.1144 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0716 ( 2035 res) mbg02304 (2035) 2643 449 3.8e-126 mFLJ00346 ( 1128 res) mph03762 (1128) 228 50 2.8e-06 mKIAA1395 ( 1930 res) mpf00633 (1930) 231 51 2.8e-06 >>mKIAA0716 ( 2035 res) mbg02304 (2035 aa) initn: 2890 init1: 892 opt: 2643 Z-score: 2357.2 bits: 449.3 E(): 3.8e-126 Smith-Waterman score: 3355; 37.564% identity (40.014% ungapped) in 1552 aa overlap (4-1499:302-1814) 10 20 30 mKIAA0 GSKGFPKEIEMLNNLKVVFTDLGNKDLNRDKIF :.:: . . .:.:::...: .: :. mKIAA0 GEELEVIFSLFDSKENRPISERFFLRLNRNGLPKAPDKPERHCSLFVDLGSSELRKD-IY 280 290 300 310 320 330 40 50 60 70 80 90 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