# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mth00458.fasta.nr -Q ../query/mKIAA0912.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA0912, 1793 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7902097 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1735+/-0.000199; mu= 11.9380+/- 0.011 mean_var=125.5112+/-24.182, 0's: 37 Z-trim: 119 B-trim: 372 in 1/64 Lambda= 0.114481 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|123208273|emb|CAM19058.1| centrosomal protein 1 (1736) 11315 1881.6 0 gi|20072257|gb|AAH26366.1| Cep152 protein [Mus mus ( 727) 4829 810.0 0 gi|109468755|ref|XP_230555.4| PREDICTED: similar t (1336) 4254 715.3 8.9e-203 gi|109081038|ref|XP_001113236.1| PREDICTED: simila (1710) 3324 561.8 1.8e-156 gi|218512101|sp|O94986.3|CE152_HUMAN RecName: Full (1654) 3322 561.5 2.2e-156 gi|114656899|ref|XP_523070.2| PREDICTED: centrosom (1710) 3297 557.4 4e-155 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277.0 5.9e-71 gi|189537675|ref|XP_694227.3| PREDICTED: similar t (1560) 1574 272.7 1.7e-69 gi|51703623|gb|AAH81274.1| LOC446951 protein [Xeno (1042) 1483 257.5 4.4e-65 gi|71682211|gb|AAI00230.1| LOC446951 protein [Xeno (1663) 1479 257.1 9.6e-65 gi|149636838|ref|XP_001509619.1| PREDICTED: hypoth (1360) 1313 229.6 1.5e-56 gi|118095787|ref|XP_413819.2| PREDICTED: similar t (1769) 1243 218.1 5.5e-53 gi|47220517|emb|CAG05543.1| unnamed protein produc ( 530) 926 165.3 1.3e-37 gi|198427705|ref|XP_002122978.1| PREDICTED: simila (1326) 788 142.9 1.9e-30 gi|190585653|gb|EDV25721.1| hypothetical protein T (2002) 789 143.2 2.2e-30 gi|156225710|gb|EDO46525.1| predicted protein [Nem (2008) 779 141.5 7e-30 gi|47220518|emb|CAG05544.1| unnamed protein produc ( 845) 761 138.2 3e-29 gi|210112063|gb|EEA59848.1| hypothetical protein B (1526) 647 119.6 2.1e-23 gi|108871612|gb|EAT35837.1| conserved hypothetical (1049) 525 99.3 1.9e-17 gi|23495223|gb|AAN35553.1|AE014834_50 liver stage (1596) 509 96.9 1.6e-16 gi|115702473|ref|XP_788275.2| PREDICTED: similar t (1338) 499 95.1 4.4e-16 gi|157018839|gb|EAU77288.2| AGAP000323-PA [Anophel (1607) 485 92.9 2.5e-15 gi|56470397|gb|EAL48061.1| Viral A-type inclusion (1813) 485 92.9 2.7e-15 gi|124430075|emb|CAK94864.1| unnamed protein produ (2950) 480 92.3 6.7e-15 gi|157017429|gb|EAA08928.4| AGAP003526-PA [Anophel (1104) 468 89.9 1.3e-14 gi|73978187|ref|XP_532649.2| PREDICTED: similar to (1514) 461 88.9 3.7e-14 gi|212506338|gb|EEB10581.1| hypothetical protein P (1175) 456 88.0 5.5e-14 gi|89287594|gb|EAR85583.1| hypothetical protein TT (1955) 455 88.0 8.8e-14 gi|134068390|emb|CAM66680.1| kinesin K39, putative (2926) 453 87.9 1.5e-13 gi|109489761|ref|XP_001053321.1| PREDICTED: simila (1938) 448 86.9 2e-13 gi|109489759|ref|XP_001053536.1| PREDICTED: simila (1972) 448 86.9 2e-13 gi|109489763|ref|XP_001053402.1| PREDICTED: simila (1977) 448 86.9 2e-13 gi|109489757|ref|XP_001053471.1| PREDICTED: simila (1979) 448 86.9 2e-13 gi|124427679|emb|CAK92455.1| 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:::::::.::::::::..:::::: gi|109 KLNHSLPARRKATSDCGSQTDQAAYPAAMPNAEAL-VLAEEQAHQVQQEKELTVKEALRK 880 890 900 910 920 930 930 940 950 960 970 980 mKIAA0 PEVELELKYCEIIAQKVETAVQNARSRWIQELPMLAEYKALLRAQQQEWAKQQELAVAHR :::::::::: ::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::.::::: gi|109 SEVELELKYCESIAQKVETAVQNARSRWILELPMLAEYKALLRAQQQEWAKQQEVAVAHR 940 950 960 970 980 990 990 1000 1010 1020 1030 1040 mKIAA0 LSLALSEAKEKWKSELENMKPNVMSVKELEEKVHSLQKELELKDEEVPVIVRAEVAKART ::::::::::::::::.:::::: ::.:::::.:::::::::::::::: ::::.::::. gi|109 LSLALSEAKEKWKSELQNMKPNVASVQELEEKIHSLQKELELKDEEVPVAVRAELAKARN 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1050 1060 1070 1080 1090 1100 mKIAA0 EWNKEKQEEIHKIQEQNEEDYRQFLEDHRNKINEVLAAAKEDFVKQKAELLLQKETEFQA ::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::.:::::::::::: gi|109 EWNKEKQEEIHKIQEQNEEDYRQFLEDHRNKINEVLTAAKEDFVKQKTELLLQKETEFQA 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1110 1120 1130 1140 1150 1160 mKIAA0 CLDQSRKEWTLQEAQQTQVEIRQYEEDTLTVLAYLLKDTQLEYGGDSQDKQLLEAMSACS :::::::::::::::.::.:...:::: :::: .::.:::::: :::: :::::.::.:: gi|109 CLDQSRKEWTLQEAQRTQLEVHRYEEDILTVLDFLLRDTQLEYDGDSQGKQLLEVMSVCS 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1170 1180 1190 1200 1210 mKIAA0 SKWISVQYFEKVKACIQKALHDMLSLLTDSVASEQEKRK----------VVKSSADTV-- ::: ::::::::::::.:::.: :::: :..:::.:: . . . .:.:. gi|109 SKWTSVQYFEKVKACIHKALQDTLSLLIDNIASEREKSHHQHLTSGIHWLCQCDASTTLR 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1220 1230 1240 1250 1260 mKIAA0 ------SWTSSE---GDSAVPVPL-PDSTSVRCAQSSAWLKAEAETDKKICEIKGLRCGH : . : : .. . : : : . .: : . :. ::: :.: : ::: gi|109 YEHKQHHWKDPEQSGGLRGMSLDLTPKMTHTPSPRSPASVPPPAH-HKKIFEMKDLCCGH 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1270 1280 1290 1300 1310 1320 mKIAA0 CFQELEKEKQECQDLRRKLEKCRRHLQHLERTHRAAVEKLGEENSRVVEELIEENHDMKN ::::::::::::::::::::: :::::::::::.:.::::: gi|109 CFQELEKEKQECQDLRRKLEKSRRHLQHLERTHKATVEKLGG 1300 1310 1320 1330 1330 1340 1350 1360 1370 1380 mKIAA0 KLEALRALCRTPPRSLSAGAAESAGPSCSRQALEELRGQYIKAVRKIKRDMLRYIQESKE >>gi|109081038|ref|XP_001113236.1| PREDICTED: similar to (1710 aa) initn: 6412 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.:.:.:.::::::::::::::: :.. :::::.::: gi|109 EYQALVRAEQKKWEEQHEVSVNKRISFAVSEAKEKWKSELENMKKNILPGTELEEKIHSL 880 890 900 910 920 930 1030 1040 1050 1060 1070 1080 mKIAA0 QKELELKDEEVPVIVRAEVAKARTEWNKEKQEEIHKIQEQNEEDYRQFLEDHRNKINEVL :.:::::.:::::..:::.::::.::::::::::..::::::.::::::.:::::::::: gi|109 QRELELKNEEVPVVIRAELAKARSEWNKEKQEEIRRIQEQNEQDYRQFLDDHRNKINEVL 940 950 960 970 980 990 1090 1100 1110 1120 1130 1140 mKIAA0 AAAKEDFVKQKAELLLQKETEFQACLDQSRKEWTLQEAQQTQVEIRQYEEDTLTVLAYLL :::::::.:::.:::::::::.:.::::::.:::.:::.. :.:: ::::: ::::. :: gi|109 AAAKEDFMKQKTELLLQKETELQTCLDQSRREWTMQEAKRIQLEIYQYEEDILTVLGVLL 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1150 1160 1170 1180 1190 1200 mKIAA0 KDTQLEYGGDSQDKQLLEAMSACSSKWISVQYFEKVKACIQKALHDMLSLLTDSVASEQE .::: :. .::.:::::: ::.:::::.:::::::.:.:::::..: : ::.... . : gi|109 RDTQKEHVSDSEDKQLLEIMSTCSSKWMSVQYFEKLKGCIQKAFQDTLPLLVENADPQWE 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1210 1220 1230 1240 1250 1260 mKIAA0 KRKVVKSSADTVSWTSSEGDSAVPVPLPDSTSVRCAQSSAWLKAEAETDKK-ICEIKGLR ::.... : 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