FASTA searches a protein or DNA sequence data bank
version 3.4t11 Apr 17, 2002
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
../query/mKIAA1483.ptfa, 492 aa
vs ./tmplib.26680 library
1768525 residues in 2168 sequences
Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.0667+/-0.00669; mu= 1.6135+/- 0.445
mean_var=259.6478+/-62.236, 0's: 0 Z-trim: 27 B-trim: 5 in 1/35
Lambda= 0.0796
FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16
The best scores are: opt bits E(2168)
mKIAA4205 ( 653 res) mfj21207 ( 653) 297 47 4.8e-06
mKIAA1559 ( 504 res) mbp01052 ( 504) 269 44 3.8e-05
mKIAA1431 ( 833 res) mfj27243 ( 833) 268 44 5.7e-05
mKIAA0326 ( 885 res) mib10041 ( 885) 267 44 6.4e-05
mKIAA1611 ( 558 res) mph00982 ( 558) 263 43 6.5e-05
mKIAA1015 ( 831 res) mbh00453 ( 831) 263 43 8.4e-05
mKIAA1852 ( 736 res) mej02019 ( 736) 259 43 0.00011
mKIAA0628 ( 508 res) msj08164 ( 508) 254 42 0.00013
mKIAA1588 ( 617 res) mbp00262 ( 617) 241 41 0.0004
mKIAA1954 ( 643 res) mpj01436 ( 643) 238 40 0.00052
mKIAA1874 ( 435 res) mbg02924 ( 435) 233 39 0.0006
mKIAA1710 ( 461 res) mbg19468 ( 461) 217 38 0.0022
mKIAA4196 ( 437 res) mfj00049 ( 437) 214 37 0.0027
mKIAA4229 ( 450 res) mfj48069 ( 450) 205 36 0.0057
mKIAA0441 ( 699 res) mbp07087 ( 699) 203 36 0.0089
mKIAA4218 ( 601 res) mpm12334 ( 601) 201 36 0.0095
>>mKIAA4205 ( 653 res) mfj21207 (653 aa)
initn: 246 init1: 110 opt: 297 Z-score: 200.9 bits: 47.0 E(): 4.8e-06
Smith-Waterman score: 297; 27.803% identity (29.665% ungapped) in 223 aa overlap (230-444:432-648)
200 210 220 230 240 250
mKIAA1 LEASSSDEQPSSLTIAHVKPSIMKRNGSFPKYYACHLCGRRFTLRSSLREHLQIHTGV-P
: : :.:::. :: .::..: .:::: :
mKIAA4 SKKSYKCNECGKAFKYCSSYRKHSIIHTGEKPYKCKLCGKSFTQCASLKKHQRIHTGEKP
410 420 430 440 450 460
260 270 280 290 300 310
mKIAA1 FTAGPPGEGRGPLSLCSNAADL--GKDALEVPEAGMISDSELQHISDSPIIDGQQQSETP
. :.. . :. .. . :. . . : : .. . .. .: ..
mKIAA4 YRCEECGRSFNHYSILGQHQRIHTGEKPYKCKQCGK-SFTQCSSLQKHQVIHTGEKPYRC
470 480 490 500 510 520
320 330 340 350 360 370
mKIAA1 PPSDIADIDNLEQADQER-EVKRRKYECTICGRKFIQKSHWREHMYIHTG-KPFKCSTCD
. .: ....: .. .. :.: ::. : : : :.:. :::: ::.:: .:
mKIAA4 AECGKSFTQNSTLSQHQRIHTGEKPYKCEECGKAFTQCSSLRKHQRIHTGEKPYKCEVCG
530 540 550 560 570 580
380 390 400 410 420 430
mKIAA1 KSF-CRANQAARHVCLNQSIDTYTMVD-KQTLELCTFEEGSQMDNMLVQAN-KPYKCNLC
..: ::.. ..: .. . : : ... :: . .... .... :::::: :
mKIAA4 RAFNCRSS-FTKHKRIHTGEKPYKCKDCDKAFIHCT----NLIQHQRIHTGEKPYKCNEC
590 600 610 620 630
440 450 460 470 480 490
mKIAA1 DKTFSTPNEVVKHSCQNQNSDVFALDEGRSVLLGSGDSEVTEPDHPVLASIKKEQETVLL
:.:: ... ::
mKIAA4 GKSFSQCSNLRKHERIHT
640 650
>>mKIAA1559 ( 504 res) mbp01052 (504 aa)
initn: 535 init1: 107 opt: 269 Z-score: 184.8 bits: 43.7 E(): 3.8e-05
Smith-Waterman score: 269; 24.898% identity (26.522% ungapped) in 245 aa overlap (210-444:118-357)
180 190 200 210 220 230
mKIAA1 LSPELVSTPVPPPPPGEETNLEASSSDEQPSSLTIAHVKPSIM---KRNGSFPKYYACHL
.: ... : :.. .: . :.: :.
mKIAA1 GSGLSDDQECKHKTGLQKEPQEGYFGQLKITSEKVTYEKHSFLSEYQRVQNEEKFYECKE
90 100 110 120 130 140
240 250 260 270 280 290
mKIAA1 CGRRFTLRSSLREHLQIHTGV-PFTA---GPPGEGRGPLSLCSNAADLGKDALEVPEAGM
: . : ::.: .::.:::: :. : : . :. : . . :. : . :
mKIAA1 CRKTFIRRSTLSQHLRIHTGEKPYKCKECGQPFRQRAHL-IRHHKLHTGEKPYECKDCGK
150 160 170 180 190 200
300 310 320 330 340 350
mKIAA1 ISDSELQHISDSPIID-GQQQSETPPPSDIADIDNLEQADQEREVKRRKYECTICGRKFI
. ::.... . :.. : . . . :. .. .. ::: ::. :
mKIAA1 AF-TVLQELTQHQRLHTGEKPYECKECGKAFRVHQQLARHQRIHTGEKPYECKECGKTFR
210 220 230 240 250 260
360 370 380 390 400
mKIAA1 QKSHWREHMYIHTG-KPFKCSTCDKSFCRANQAARHVCLNQSIDTYTMVD-KQTLELCTF
: .: .:. .::. : ..:. : :.: . . : .. . :. : .....:
mKIAA1 QCTHLTRHQRLHTSEKLYECKECGKAFVCGPDLRVHQKIHFGEKPYACKDCGKSFRIC--
270 280 290 300 310 320
410 420 430 440 450 460
mKIAA1 EEGSQMDNMLVQANKPYKCNLCDKTFSTPNEVVKHSCQNQNSDVFALDEGRSVLLGSGDS
. . . . ..:::.:. : ::: ...:.:.
mKIAA1 -QQLTVHQSIHTGEKPYECKECGKTFRLRQQLVRHQRIHTHERPYECLECWKTFSSYSQL
330 340 350 360 370 380
470 480 490
mKIAA1 EVTEPDHPVLASIKKEQETVLLD
mKIAA1 ISHQSIHVGERPYECEECGKAFRLLSQLTQHQSIHTGEKPYECQECRKPFRLLSQLTQHR
390 400 410 420 430 440
>>mKIAA1431 ( 833 res) mfj27243 (833 aa)
initn: 476 init1: 102 opt: 268 Z-score: 181.7 bits: 43.8 E(): 5.7e-05
Smith-Waterman score: 291; 25.180% identity (27.344% ungapped) in 278 aa overlap (205-467:493-763)
180 190 200 210 220
mKIAA1 PLQTSLSPELVSTPVPPPPPGEETNLEASSSDEQPSSLTIAH------VKPSIMKRNGSF
. :.: . . : . .. .: .
mKIAA1 YHTGEKPFDCIDCGKAFSDHIGLNQHRRIHTGEKPYTCEVCHKSFRYGSSLTVHQRIHTG
470 480 490 500 510 520
230 240 250 260 270 280
mKIAA1 PKYYACHLCGRRFTLRSSLREHLQIHTGV-PFTAGPPGEG-RGPLSLCSN-AADLGKDAL
: : :..: . :. ..:: .: ..:.: :: :.. : . : :. :. .
mKIAA1 EKPYECEICRKAFSHHASLTQHQRVHSGEKPFKCKECGKAFRQNIHLASHWRIHTGEKPF
530 540 550 560 570 580
290 300 310 320 330 340
mKIAA1 EVPEAGMISDSELQHISDSPIIDGQQQSETPP-PSDIADIDNLEQADQEREVKRRKYECT
: : : . : . . : :.. : . ... .: : :. .. .. :::
mKIAA1 ECGECGKSFSISSQLATHQRIHTGEKPYECKVCRKAFTQKAHLAQ-HQKTHTGEKPYECK
590 600 610 620 630 640
350 360 370 380 390 400
mKIAA1 ICGRKFIQKSHWREHMYIHTG-KPFKCSTCDKSFCRANQAARHVCLNQSIDTYTMVDKQT
::. : : .: .:. .::: ::.:: : :.: .. ..: :. . : :.
mKIAA1 ECGKAFSQTTHLIQHQRVHTGEKPYKCLECGKAFGDNSSCTQHRRLHTGQRPYECVE---
650 660 670 680 690
410 420 430 440 450
mKIAA1 LELC--TFEEGSQM--DNMLVQANKPYKCNLCDKTFSTPNEVVKHSCQNQNSDVFALDEG
: ::. :.. ..:::.:. : :.:: . . :. .... . :
mKIAA1 ---CGKTFKTKSSLICHRRCHTGEKPYECSACGKAFSHRQSLSVHQRIHSGKKPYECKEC
700 710 720 730 740 750
460 470 480 490
mKIAA1 RSVLLGSGDSEVTEPDHPVLASIKKEQETVLLD
:.... :
mKIAA1 RKTFIQIGHLNQHKRVHTGERTYNYKKGRRAFRQTAHFAHHQQIHSGKSPAHHSLPSTSN
760 770 780 790 800 810
>>mKIAA0326 ( 885 res) mib10041 (885 aa)
initn: 298 init1: 94 opt: 267 Z-score: 180.7 bits: 43.8 E(): 6.4e-05
Smith-Waterman score: 292; 23.919% identity (26.934% ungapped) in 393 aa overlap (95-454:10-391)
70 80 90 100 110 120
mKIAA1 PQLIDPVRLEQGIKFLHAYPLIQEASLASQGSFSHPEQVFPLASSLYGIQIADHQLRQAT
:.:. . . . :.: .. . : .
mKIAA0 RSSLQCRDPGTFTVCSRGMEPETVLWGPDLQGPEESQ-N
10 20 30
130 140 150 160 170
mKIAA1 KMNLGPEKLGREPRPQASRMNQEPV---PETSQLSQLTSN--LAQVNRTNITPED-PLQT
. . : . ..: :: ..: . : : :. :. : . .. .:.: :
mKIAA0 EAHRGAGSGNEEESPQQESSGEEIILGDPAQSPESKDPSEMPLESPSQDASAPQDSPTPL
40 50 60 70 80 90
180 190 200 210 220
mKIAA1 SLSPELVSTPVPP------PPPGE-----ETNLEASSSDEQPSSLTIAHVKPS----IMK
. :: .::. : : :.: ::: . .. :. ... .:: ..
mKIAA0 GSSPLDHQTPMDPSAPEVVPSPSEWTKACETNWQWGTLTPWNSTPVVTASEPSLRELVQG
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270 280
mKIAA1 RNGSFPKYYACHLCGRRFTLRSSLREHLQIHTGV-PFTAGPPGEGRGPLS--LCSNAADL
: .. : : :. ::. :. :.: .: .:::: : : . :.. : . . .
mKIAA0 RPSGAEKPYICNECGKSFSQWSKLLRHQRIHTGERPNTCSECGKSFTQSSHLVQHQRTHT
160 170 180 190 200 210
290 300 310 320 330
mKIAA1 GKDALEVPEAGMI---SDSELQHISDSPIIDGQQQSE-TPPPSDIADIDNLEQADQEREV
:. . :. : :.. .:: :.. . : . ... :: . :. ..
mKIAA0 GEKPYKCPDCGKCFSWSSNLVQHQRTHT---GEKPYKCTECEKAFTQSTNLIK-HQRSHT
220 230 240 250 260 270
340 350 360 370 380 390
mKIAA1 KRRKYECTICGRKFIQKSHWREHMYIHTG-KPFKCSTCDKSFCRANQAARHVCLNQSIDT
.. :.: : : : ..: .:. ::: ::.:: : : : . .. .: .. .
mKIAA0 GEKPYKCGECRRAFYRSSDLIQHQATHTGEKPYKCPECGKRFGQNHNLLKHQKIHAGEKP
280 290 300 310 320 330
400 410 420 430 440 450
mKIAA1 YTMVDKQTLELC--TFEEGSQMDNMLVQ--ANKPYKCNLCDKTFSTPNEVVKHSCQNQNS
: .. : .: ..:.. . ..:::.: : :.:. . ..::. .
mKIAA0 YRCTE------CGKSFIQSSELTQHQRTHTGEKPYECLECGKSFGHSSTLIKHQRTHLRE
340 350 360 370 380
460 470 480 490
mKIAA1 DVFALDEGRSVLLGSGDSEVTEPDHPVLASIKKEQETVLLD
: :
mKIAA0 DPFKCPVCGKTFTLSATLLRHQRTHTGERPYKCPECGKSFSVSSNLINHQRIHRGERPYI
390 400 410 420 430 440
>>mKIAA1611 ( 558 res) mph00982 (558 aa)
initn: 372 init1: 102 opt: 263 Z-score: 180.6 bits: 43.1 E(): 6.5e-05
Smith-Waterman score: 285; 28.571% identity (32.075% ungapped) in 238 aa overlap (221-444:101-326)
200 210 220 230 240 250
mKIAA1 PPPPGEETNLEASSSDEQPSSLTIAHVKPSIMKRNGSFPKYYACHLCGRRFTLRSSLREH
. .:. . : : :. ::. :. : :. :
mKIAA1 PWTVESEAIRTRKSNGKEYIRAMFRRSYLLVHERHHTGAKPYKCNECGKVFSQNSHLKSH
80 90 100 110 120 130
260 270 280 290
mKIAA1 LQIHTGV-PFTAGPPGEG---RGPLSLCSNAADLGKDALEVPEAGMI--SDSELQ-----
.:::: :: . :.. :. :. .. : . : : . . : :
mKIAA1 RRIHTGEKPFKCNHCGKAFSVRSNLTH-HQVIHTGDKPYKCNECGKVFSQTSSLTIHRRT
140 150 160 170 180
300 310 320 330 340 350
mKIAA1 HISDSPIIDGQQQSETPPPSDIADIDNLEQADQEREVKRRKYECTICGRKFIQKSHWREH
: ...: .. . :.. : .:: . : . :.:. ::. : :.:: .:
mKIAA1 HTGEKPYRCNECGKVFSSHSNL----NTHQAIHTGE---KPYKCSECGKVFTQNSHLANH
190 200 210 220 230 240
360 370 380 390 400 410
mKIAA1 MYIHTG-KPFKCSTCDKSFCRANQAARHVCLNQSIDTYTMVDKQTLELCTFEEGSQMDNM
:::: ::.::. : :.: .. . : :.: : : . .: ..:.. .
mKIAA1 WRIHTGEKPYKCNECGKAFSVYSSLTTH----QAIHTGEKPYKCNECGKVFTQNSHLASH
250 260 270 280 290
420 430 440 450 460 470
mKIAA1 --LVQANKPYKCNLCDKTFSTPNEVVKHSCQNQNSDVFALDEGRSVLLGSGDSEVTEPDH
. ...:::::. : : :: .....:
mKIAA1 RGVHSGEKPYKCEECGKLFSQTSNLARHWRVHTGEKPYKCSECGKAFSVRSSLIAHQVIH
300 310 320 330 340 350
>>mKIAA1015 ( 831 res) mbh00453 (831 aa)
initn: 234 init1: 110 opt: 263 Z-score: 178.6 bits: 43.3 E(): 8.4e-05
Smith-Waterman score: 264; 27.203% identity (32.870% ungapped) in 261 aa overlap (223-444:400-654)
200 210 220 230 240 250
mKIAA1 PPGEETNLEASSSDEQPSSLTIAHVKPSIMKRNGSFPKYYACHLCGRRFTLRSSLREHLQ
.: . : : :..::. : . : : .: .
mKIAA1 QHRRIHTGEKPFKCGECGKSYNQRVHLTQHQRVHTGEKPYKCQVCGKAFRVSSHLVQHHS
370 380 390 400 410 420
260 270 280 290
mKIAA1 IHTGV-PFTAGPPGEGRGPLSL---------------CSN--AADLGKDALEVP---EAG
.:.: :. . :.. : : ::. . . . ..: ::
mKIAA1 VHSGERPYGCNECGKSFGRHSHLIEHLKRHFREKSQRCSDRRSKNTKLNIKQIPGLSEAD
430 440 450 460 470 480
300 310 320 330
mKIAA1 MISDSELQ--------HISDSPIIDGQQ---QSET--PPPSDIADIDNLEQADQEREVKR
. ..:.: : :::: ..:: : .: ... . .. .
mKIAA1 LELSGEVQRNACQAEGHSEGCEHQDGQQGVVMKETLGQSSSKRTDCNEFSYVHKKSSPGE
490 500 510 520 530 540
340 350 360 370 380 390
mKIAA1 RKYECTICGRKFIQKSHWREHMYIHTG-KPFKCSTCDKSFCRANQAARHVCLNQSIDTYT
: ..:. ::..:::..: .: :::: :::.: : ::. :: .: :.: ..:
mKIAA1 RPHQCNECGKSFIQSAHLIQHRRIHTGEKPFRCEECGKSY---NQ---RVHLTQHHRVHT
550 560 570 580 590 600
400 410 420 430 440 450
mKIAA1 MVDKQTLELC--TFEEGSQM-DNMLVQA-NKPYKCNLCDKTFSTPNEVVKHSCQNQNSDV
. .:: .:. :.. ... :.. ..:.::: : : :. .... :
mKIAA1 GEKPYACHLCGKAFRVRSHLVQHQSVHSRERPFKCNECGKGFGRRSHLAGHLRLHSRDKS
610 620 630 640 650 660
460 470 480 490
mKIAA1 FALDEGRSVLLGSGDSEVTEPDHPVLASIKKEQETVLLD
mKIAA1 HQCHECGEIFFQYVSLLEHQVLHVGQKSEKNGICEEAYSWNLTVIEDKKLELQEQPYQCD
670 680 690 700 710 720
>>mKIAA1852 ( 736 res) mej02019 (736 aa)
initn: 485 init1: 99 opt: 259 Z-score: 176.7 bits: 42.7 E(): 0.00011
Smith-Waterman score: 266; 27.468% identity (30.047% ungapped) in 233 aa overlap (223-444:392-615)
200 210 220 230 240 250
mKIAA1 PPGEETNLEASSSDEQPSSLTIAHVKPSIMKRNGSFPKYYACHLCGRRFTLRSSLREHLQ
.:. . : : :. ::. :. : : : .
mKIAA1 QHKKTHPGEKPYECDKCGKVFRNRSALTKHERTHTGVKPYECNKCGKAFSWNSHLIVHTR
370 380 390 400 410 420
260 270 280 290 300
mKIAA1 IHTGV-PFTAGPPGEGRGPLS--LCSNAADLGKDALEVPEAGMISDSELQH-ISDSPIID
:::: :.. . :.. . : . . . :. .: : : : : .: :. .
mKIAA1 IHTGEKPYVCNECGKSFNWNSHLIGHQRTHTGEKPFECTECGK-SFSWSSHLIAHMRMHT
430 440 450 460 470 480
310 320 330 340 350 360
mKIAA1 GQQQSETPP-PSDIADIDNLEQADQEREVKRRKYECTICGRKFIQKSHWREHMYIHTG-K
:.. . . . : . : . .. . . :.:: ::..: .:: :. ::: :
mKIAA1 GEKPFKCDECEKAFRDYSALSKHERTHS-GAKPYKCTECGKSFSWSSHLIAHQRTHTGEK
490 500 510 520 530
370 380 390 400 410 420
mKIAA1 PFKCSTCDKSFCRANQAARHVCLNQSIDTYTMVDKQTLELCTFEEGSQMDNMLVQ-----
:..:. : :.: . . ..: ....: : .. . : ::: ... .
mKIAA1 PYNCQECGKAFRERSALTKHEIIHSGIKPYEC--NKCGKSC-----SQMAHLVRHQRTHT
540 550 560 570 580 590
430 440 450 460 470 480
mKIAA1 ANKPYKCNLCDKTFSTPNEVVKHSCQNQNSDVFALDEGRSVLLGSGDSEVTEPDHPVLAS
..:::.:: : :.:: ..: :
mKIAA1 GEKPYECNKCGKSFSQSCHLVAHRRIHTGEKPYKCNQCERSFNCSSHLIAHRRTHTGEKP
600 610 620 630 640 650
>>mKIAA0628 ( 508 res) msj08164 (508 aa)
initn: 500 init1: 122 opt: 254 Z-score: 175.4 bits: 42.0 E(): 0.00013
Smith-Waterman score: 288; 28.750% identity (30.942% ungapped) in 240 aa overlap (234-463:158-390)
210 220 230 240 250 260
mKIAA1 SSDEQPSSLTIAHVKPSIMKRNGSFPKYYACHLCGRRFTLRSSLREHLQIHTGV-PFTAG
::.::. :. .::::: ..::: :: .
mKIAA0 YKCDHCGKGFSQTSLLTEHQRVHTGDRLCVCHVCGKDFVHYASLREHQHVHTGEKPFKCA
130 140 150 160 170 180
270 280 290 300 310
mKIAA1 PPGEGRGPLS--LCSNAADLGKDALEVPEAGM-ISDSELQHISDSPIIDGQQQSETPP--
:.. : : . . . .: : : .:.: : : . : :.. :
mKIAA0 QCGKAFCHSSDLLRHQRVHTRERPFECKECGKGFSQSSLL-IRHQRIHTGERPYECNECG
190 200 210 220 230 240
320 330 340 350 360 370
mKIAA1 PSDIADIDNLEQADQEREVKRRKYECTICGRKFIQKSHWREHMYIHTG-KPFKCSTCDKS
: : . . ... . . ::: .::: ::. : ..: ::. :::: .::.:. : :.
mKIAA0 KSFIRSSSLIRHYQIHTEVK--QYECRDCGKAFRHRSDLIEHQRIHTGERPFECQECGKA
250 260 270 280 290 300
380 390 400 410 420 430
mKIAA1 FCRANQAARHVCLNQSIDTYTMVD--KQTLELCTFEEGSQMDNMLVQANKPYKCNLCDKT
: :... .: .. . :. . :. . .: . ... . ..: :.:: : :.
mKIAA0 FIRSSKLIQHQRIHTGERPYVCNECGKRFSQTSNFTQHQRIHS----GEKLYECNECGKA
310 320 330 340 350 360
440 450 460 470 480 490
mKIAA1 FSTPNEVVKHSCQNQNSDVFALDE-GRSVLLGSGDSEVTEPDHPVLASIKKEQETVLLD
: . ...:. . . :. : :.. :
mKIAA0 FFLSSYLIRHQKIHTGERVYECKECGKAFLQKAHLTEHQKIHTGDRPFECKDCGKAFIQS
370 380 390 400 410 420
>>mKIAA1588 ( 617 res) mbp00262 (617 aa)
initn: 376 init1: 103 opt: 241 Z-score: 166.4 bits: 40.6 E(): 0.0004
Smith-Waterman score: 243; 28.261% identity (32.178% ungapped) in 230 aa overlap (230-444:231-447)
200 210 220 230 240 250
mKIAA1 LEASSSDEQPSSLTIAHVKPSIMKRNGSFPKYYACHLCGRRFTLRSSLREHLQIHTGV-P
:.. :: : . :: .:: .: .:::: :
mKIAA1 PTGKRPYHHHSCGVKNRIHLTQHMSMNDGRKWHKCHQCQKAFTTSASLTRHHRIHTGEKP
210 220 230 240 250 260
260 270 280 290 300 310
mKIAA1 FTAGPPGEG-RGPLSLCSNAADLGKDALEVPEAGMISDSELQHISDSPIIDGQQQSETPP
. . :.. : .: :.. : : : .. .. .: : . .: :
mKIAA1 YECSSCGKAFNDPSALRSHTRTHLK---EKPFDCSQCSNAFRTLSALKIHMRVHTGERPY
270 280 290 300 310
320 330 340 350 360 370
mKIAA1 PSDIADIDNLEQ----ADQEREVKRRKYECTICGRKFIQKSHWREHMYIHTG-KPFKCST
: .. : .. .. .: ::: ::. : . :: .::. ::: ::..:.
mKIAA1 KCDECGKAYGRSCHLIAHKRTHTGERPYECQDCGKAFQHPSHLKEHVRNHTGEKPYECTQ
320 330 340 350 360 370
380 390 400 410 420
mKIAA1 CDKSFCRANQAARHVCLNQSIDTYTMVDKQTLELCTFEEGSQMDNMLVQ--------ANK
: :.: .. : ::.: : : : : :......: . ..:
mKIAA1 CGKAFRWKSNFNLH-------KKNHMVEK-TYE-CK-ECGKSFSDLLSRRKHMRIHIVKK
380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
mKIAA1 PYKCNLCDKTFSTPNEVVKHSCQNQNSDVFALDEGRSVLLGSGDSEVTEPDHPVLASIKK
: .:. : ::: . . . :
mKIAA1 PVECHQCGKTFRNQSILKTHMNSHTGERPYGCDLCGKAFSASSNLTAHRKIHTQERHYEC
430 440 450 460 470 480
>>mKIAA1954 ( 643 res) mpj01436 (643 aa)
initn: 463 init1: 114 opt: 238 Z-score: 164.3 bits: 40.3 E(): 0.00052
Smith-Waterman score: 303; 21.995% identity (24.872% ungapped) in 441 aa overlap (45-473:48-449)
20 30 40 50 60 70
mKIAA1 LFFRLQLSQRLLFPHGSLLSFSECVRLKPTDIQPDIFSYLLHLMYTGKMAPQLIDPVRLE
:.. . ...:. : : . :..: .::
mKIAA1 QESVTFKDVAVNFTQEEWHHVGPAQRSLYRDVMLENYNHLVSLGYQVS-KPEVI--FKLE
20 30 40 50 60 70
80 90 100 110 120 130
mKIAA1 QGIKFLHAYPLIQEASLASQGSFSHPEQVFPLASSLYGIQIADHQLRQA--TKMNLGP-E
:: . : :.: . : : .. : .: ... :: .. ..:
mKIAA1 QGEE-----PWISEKEI--QRPFCPDWKTRPESSRSPQQGVSEVFLRTNVLSHTTIGDIW
80 90 100 110 120
140 150 160 170 180 190
mKIAA1 KLGREPRPQASRMNQEPVPETSQLSQLTSNLAQVNRTNITPEDPLQTSLSPEL-VSTPVP
... . . ...: . : :.:. ...:. ....... .. :.:.: :.: .:. .
mKIAA1 NVAIQGHQESGRRHLGP--EASSQKKITTLEKKIEQNKVGEDSSLSTDLVPQLDISSSIR
130 140 150 160 170 180
200 210 220 230 240
mKIAA1 PPP-PGEETNLEASSSDEQPSSLTIAHVKPSIMKRNGSFPKYYACHLCGRRFTLRSSLRE
: .::: .: :.. .:. :: : : : . : :::: .
mKIAA1 PSDCKTFGNNLEHNSELVTQSNI-LAKKKP------------YKCDKCRKSFIHRSSLNK
190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
mKIAA1 HLQIHTGVPFTAGPPGEGRGPLSLCSNAADLGKDALEVPEAGMISDSELQHISDSPIIDG
: .:: : :.. : .: . :: :: : . ... . : ...:. .
mKIAA1 HEKIHKGDPYSNGTD-QGAQSGRKHHECADCGKTFLWRTQ---LTEHQRIHTGEKPFECN
240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
mKIAA1 QQQSETPPPSDIADIDNLEQADQEREVKRRKYECTICGRKFIQKSHWREHMYIHTG-KPF
. :.... .: . .. . :.:..::. : ..: .:. :::: ::.
mKIAA1 VCGKAFRHSSSLGQHENAHTGE-------KPYQCSLCGKAFQRSSSLVQHQRIHTGEKPY
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
mKIAA1 KCSTCDKSFCRANQAARHVCLNQSIDTYTMVD-KQTLELCTFEEGSQMDNMLVQANKPYK
.:. : .:: .... ..: ... . . ... :. . . ..::..
mKIAA1 RCNLCGRSFRHSTSLTQHEVTHSGEKPFQCKECGKAFSRCSSLVQHERTHT---GEKPFE
350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
mKIAA1 CNLCDKTFSTPNEVVKH-----SCQNQNSDVFALDEGRSVLLGSGDSEVTEPDHPVLASI
:..: ..:. . :: . .:. :.: .. : .:.. .::
mKIAA1 CSICGRAFGQSPSLYKHMRIHKRSKPYQSNNFSLAFVPNTPLPQGEGLLTEVKSYHCNDC
400 410 420 430 440 450
490
mKIAA1 KKEQETVLLD
mKIAA1 GKDFGHITDFSEHQRLHAGENSYGSEQTLLGQQSLSHPREKPYQCNVCGKAFKRSTSFIE
460 470 480 490 500 510
492 residues in 1 query sequences
1768525 residues in 2168 library sequences
Scomplib [34t11]
start: Mon Mar 27 10:46:20 2006 done: Mon Mar 27 10:46:21 2006
Scan time: 0.730 Display time: 0.170
Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]