FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0870.ptfa, 1280 aa vs ./tmplib.26680 library 1767737 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.3817+/-0.00466; mu= 21.9052+/- 0.312 mean_var=98.0330+/-22.373, 0's: 0 Z-trim: 9 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1295 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1766 ( 618 res) mfj69272 ( 618) 316 70 1.3e-12 mKIAA1091 ( 1217 res) mbg00289 (1217) 288 65 7.4e-11 mKIAA3020 ( 1884 res) mbg15810 (1884) 268 62 1.3e-09 mKIAA1608 ( 845 res) mkg10115 ( 845) 244 57 1.8e-08 mKIAA0358 ( 1581 res) mbg05815 (1581) 241 57 3.8e-08 mKIAA1277 ( 1074 res) mph01932 (1074) 210 51 1.7e-06 >>mKIAA1766 ( 618 res) mfj69272 (618 aa) initn: 185 init1: 148 opt: 316 Z-score: 318.6 bits: 70.1 E(): 1.3e-12 Smith-Waterman score: 328; 22.093% identity (25.277% ungapped) in 516 aa overlap (101-576:57-547) 80 90 100 110 120 mKIAA0 GQVPGASCALGKGRRRSFRKKREKPRMEPWKSHPGDSKG------P--DSEDVTIPGGVD : ::.. : : : .:. .: :.. mKIAA1 AATGTRFPGAAAAVMARLADYFIVVGYDHEKPGPGEGLGKIIQRFPQQDWDDTPFPQGIE 30 40 50 60 70 80 130 140 150 160 170 180 mKIAA0 LLALPQLCFSGCVCVASEPKEDYIHFLVLTDVCGNRTYGVVAQYYRPLHDEYCFYNGKSH :. : : .. : :. . .::::. ..: : .:. : . . :.. mKIAA1 LF-----CQPGGWHLSRERKQPTFFVVVLTDIDSDRHYCSCLTFYEA---EINLQGTKKE 90 100 110 120 130 190 200 210 220 230 mKIAA0 W-EPSVIS-----ARCFVPFAVCVVSRFPYYNSLKDCLSCLLTHLKLCKDFEVDNHIKDF : .: :. :.: .. .:::. : . .. ::. . : . ... : .. mKIAA1 EIEGEEVSGLIQPAEVFAPKSLVLVSRLDYPEIFRACLGLIYTVYVDSMSVSLESLIANL 140 150 160 170 180 190 240 250 260 270 280 290 mKIAA0 AARLSLIPSPPPGPLHLIFNMKPLQVVFPSRADPESPIVDLDLHLPLLCFRPEKVLQILT : :.:. . . .. :.. : :.. .. : . . ..::... mKIAA1 CA--CLVPAAGGSQKLFSLGAGDRQLIQTPLHDSL-PVTGTSVALLFQQLGIQNVLNLFC 200 210 220 230 240 250 300 310 320 330 340 350 mKIAA0 CILTEQRIVFFSSDWALLTLMAECFVAYLHPLQWQHTFVPILSGQMLDFVMAPTSFLMGC .:::..... :... :. . . . . ::.... ..::: .:.:. . .:: :..: mKIAA1 AVLTENKVLLHSASFQRLSDACRALESLMFPLKYSYPYIPILPAQLLEVLSSPTPFIIGV 260 270 280 290 300 310 360 370 380 390 400 410 mKIAA0 HLDHFEEVRKEADGLVLIDIDHGSVTCSKSSDDNIDIPDVPL-LLAQTFIQRVQSLQLHP : .:.. : ... :.: :.. . : . ..: :: :: : . :: ::: mKIAA1 HSIFKTDVHELLD-VIIADLDGGTIKIPEC----IHLSSLPEPLLHQT--QSALSLILHP 320 330 340 350 360 420 430 440 450 460 mKIAA0 DLHLAHLSASTDLNEGRARRRAWQQT--LNCKIQHITLQLLVGIFREVKN-----HLNYE ::..: . : : ... :. ... . :.:.. .:. .. ... : mKIAA1 DLEVADHAFPPP-------RTALSHSKMLDKEVRAVFLRLFAQLFQGYRSCLQLIRIHAE 370 380 390 400 410 420 470 480 490 500 510 520 mKIAA0 HRV-FNSEEFLKTRAAGDQQFYKQVLDTYMFHSFLKAR-----LNGRMDAFARMDLDTQS . :.. :: :. ...: .::. . : .:.. : .: .. .... . mKIAA1 PVIHFHKTAFLGQRGLVENDFLTKVLNGMAFAGFVSERGPPYRACDLFDELVAFEVERIK 430 440 450 460 470 480 530 540 550 560 570 mKIAA0 EEDRIDRMLISPRRPTVEK----------MASRKAS-PLHITHRRM-VVSMPNLQDISLP :.. .:. : .:. :: .:. : . .: :. .. .:.... . mKIAA1 VEEKNPLKMIKHIRELAEQLFKNENPNPHMAFQKVPRPTEGSHLRVHILPFPKINEARVQ 490 500 510 520 530 540 580 590 600 610 620 630 mKIAA0 ELPPRNSSLRIMDTSNCRSSSPVLKVTPKSTYMFKIPDIHFPLESQCVQAYYTDFVTLLS :: .: mKIAA1 ELIQENLAKNQNAPPATRIEKKCVVPAGPPVGMYVHVCMHPCVHVCVPLCVRVCVLVCVC 550 560 570 580 590 600 >>mKIAA1091 ( 1217 res) mbg00289 (1217 aa) initn: 311 init1: 219 opt: 288 Z-score: 287.3 bits: 65.3 E(): 7.4e-11 Smith-Waterman score: 298; 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