FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mFLJ00348.ptfa, 1089 aa vs ./tmplib.26680 library 1767928 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.5601+/-0.00372; mu= 17.9566+/- 0.249 mean_var=85.5458+/-20.210, 0's: 0 Z-trim: 6 B-trim: 25 in 1/35 Lambda= 0.1387 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1986 ( 767 res) mph02350 ( 767) 357 82 3.1e-16 mKIAA1835 ( 646 res) mph00586 ( 646) 243 59 2e-09 mFLJ00240 ( 769 res) mbg05043 ( 769) 222 55 4.2e-08 mFLJ00359 ( 1108 res) msp04321 (1108) 158 43 0.00038 mKIAA0014 ( 453 res) msh04335 ( 453) 137 38 0.0039 >>mKIAA1986 ( 767 res) mph02350 (767 aa) initn: 504 init1: 196 opt: 357 Z-score: 383.8 bits: 82.3 E(): 3.1e-16 Smith-Waterman score: 372; 28.052% identity (29.589% ungapped) in 385 aa overlap (572-949:114-485) 550 560 570 580 590 600 mFLJ00 SGLLSPRVNTLLAGSLLSQGEHQSYRDQVAEVLQGFLHP-DAAVCARAINVLYCLSELRH ....: ..: : :. ..: .: :. mKIAA1 AEAESPTGTSPPADGRLKAAAKRVTFPSDEDIVSGAVEPKDPWRHAQNVTVDEVISAYRQ 90 100 110 120 130 140 610 620 630 640 650 mFLJ00 T--ELAC-SVEEAMRSGTLAGMTSPSHRTALAYLLQMSDICSPEADFSLCLS-QHVLQSL . .: : .. . .:. : .:. .: .. :. . . :.. : . ..:.. : mKIAA1 ACQKLNCRQIPKLLRQ--LQEFTDLEQR------INCLDLKGEKLDYKTCEALEEVFKRL 150 160 170 180 190 660 670 680 690 700 710 mFLJ00 LPQLLYCQSLRLDNNQFQDPVMELLGSVLSGKDCRIRKISLAENQIGNKGAKALARSLLV ... .. :: .: . :. . .. .::. .. ::..: .: :. . mKIAA1 QFKVVDLEQTNLD----EDGASALFDMIEYYESATHLNISFNKH-IGTRGWQAAAHMMRK 200 210 220 230 240 250 720 730 740 750 760 770 mFLJ00 NRSLITLDLRSNSIGPPGAKALADALKINRTLTSLSLQSNVIKDDGVMCVAEALVSNQTI . : :: :.. . .: .: ::.: .:. : :.. .. .: .: :: :... mKIAA1 TSCLQYLDARNTPLLDHSAPFVARALRIRSSLAVLHLENASLSGRPLMLLATALKMNMNL 260 270 280 290 300 310 780 790 800 810 820 830 mFLJ00 SMLQLQKN-LIGLIGAQQMADALKQNRSLKALMFSSNTIGDRGAIALAEALKVN-QILEN : : : : :: . :... :: : ::. : . .: . : : . :.:: . . : . mKIAA1 RELYLADNKLNGLQDSAQLGNLLKFNCSLQILDLRNNHVLDSGLAYICEGLKEQRKGLVT 320 330 340 350 360 370 840 850 860 870 880 890 mFLJ00 LDLQSNSISDMGVTVLMRALCSNQTLSSLNLRENSISPEGAQALTQALCRNNTLKHLDLT : : .:... :.. : :: .:.: .::: .: :. ::.. : ..: : .. .: :. mKIAA1 LVLWNNQLTHTGMAFLGMALPHTQSLETLNLGHNPIGNEGVRNLKNGLISNRSVLRLGLA 380 390 400 410 420 430 900 910 920 930 940 950 mFLJ00 ANLLHDRGAQAIAVAVGENHSLTHLHLQWNFIQAGAARALGQALQLNRTLTTLDLQENAI .. : .:: :.: ..:. : .: :. : :..:. ::. ::..:..: :::. mKIAA1 STKLTCEGAVAVAEFIAESPRLLRLDLRENEIKTGGLMALSLALKVNHSLLRLDLDREPK 440 450 460 470 480 490 960 970 980 990 1000 1010 mFLJ00 GDEGASSVAGALKVNTTLIALYLQVASIGSQGAQALGEALTVNRTLEILDLRGNDVGAAG mKIAA1 KEPVKSFIETQKALLAEIQNGCKRNFVLVREREEKQQLQLSASMPEITITAPQPLEESGE 500 510 520 530 540 550 >>mKIAA1835 ( 646 res) mph00586 (646 aa) initn: 356 init1: 177 opt: 243 Z-score: 261.4 bits: 59.4 E(): 2e-09 Smith-Waterman score: 301; 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