# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mtg02633.fasta.nr -Q ../query/mKIAA1881.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA1881, 1017 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7913803 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5237+/-0.000191; mu= 6.1253+/- 0.011 mean_var=104.7360+/-20.885, 0's: 26 Z-trim: 71 B-trim: 557 in 3/63 Lambda= 0.125322 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|157041252|ref|NP_065593.2| plasma membrane asso (1403) 5371 982.7 0 gi|148691770|gb|EDL23717.1| plasma membrane associ (1403) 5368 982.2 0 gi|73987118|ref|XP_854446.1| PREDICTED: similar to (1339) 2416 448.4 1.1e-122 gi|109122987|ref|XP_001082322.1| PREDICTED: simila (1337) 2413 447.9 1.6e-122 gi|119589620|gb|EAW69214.1| hCG1646516 [Homo sapie (1346) 2365 439.2 6.6e-120 gi|194668812|ref|XP_588231.3| PREDICTED: similar t (1364) 2311 429.4 5.8e-117 gi|126323216|ref|XP_001374778.1| 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