FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mFLJ00175.ptfa, 2118 aa vs ./tmplib.26680 library 1766899 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.3581+/-0.00647; mu= 8.6592+/- 0.430 mean_var=205.1441+/-50.123, 0's: 0 Z-trim: 6 B-trim: 136 in 1/35 Lambda= 0.0895 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 43, opt: 31, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1207 ( 2078 res) mib01074 (2078) 6869 902 0 >>mKIAA1207 ( 2078 res) mib01074 (2078 aa) initn: 5989 init1: 1285 opt: 6869 Z-score: 4800.5 bits: 901.9 E(): 0 Smith-Waterman score: 7955; 55.556% identity (58.986% ungapped) in 2115 aa overlap (14-2090:2-2031) 10 20 30 40 50 mFLJ00 LSPKLLLPLRPTRLGCG-----AMLCCLLARASNLPNVKKDRRSDPVASLIFRGVKKRTK ::: ::: .. :.:.:..: . ::..:.::. ::.:: mKIAA1 LLGCDLLSPRAMLRVIVESATNIPKTKFGK-PDPIVSVIFKDEKKKTK 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 mFLJ00 VIKNSVNPVWNEGFEWDLKGIPLDQSSELLVVVKDHETMGRNRFLGEAKIPLQEVLATPS . : .:::::: .:.::.:::::.:: :..:::: ::.:.:...: : . :..... . mKIAA1 KVDNELNPVWNEILEFDLRGIPLDSSSSLVIVVKDFETIGQNKLIGTATVSLKDLIGDQN 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 mFLJ00 LSASFN-APLLDAKQQPTGASLVLQVSYTPPPGAVPLFPPPASLAPSPTLPDMDLVPGGG : .. . ::. : : :::.. : ..:::: :: :. :. ::: : mKIAA1 RSLPYKQTSLLNEKGQDTGATIDLVIGYTPPS------------APHPNDPSGTSVPGMG 110 120 130 140 150 180 190 200 210 220 230 mFLJ00 QSRAETWSLLSDSTMDTRYSGKKWPVPTDTGGEEDTEDQGLTGDEAEPFLDQSAAVGPGG ::. :::: :: . .: . . ::: mKIAA1 --------------------------------EEEEEDQG---DEDR--VD-GIVRGPG- 160 170 240 250 260 270 280 290 mFLJ00 PTTPRKPPSHPPPHYPGAKRKRSSAPPRKLLSDKPQDFQIRVQVIEGRQLPGVNIKPVVK : : :: . :.: .. :..::.:::::::::.::::::: : ::.:::: mKIAA1 P----KGPSGTVSEAQLARRITKGKSSRRMLSNKPQDFQIRVRVIEGRQLCGNNIRPVVK 180 190 200 210 220 230 300 310 320 330 340 350 mFLJ00 VTAAGQTKRTRIQKGNSPLFNETLFFNVFDSPLELFDEPIFITVVDSRSLRTDALLGEFR : :::.::::..::.:.:.: .:.:: .: ::.:: : : : .:.:::.: :.:::. mKIAA1 VHICGQTHRTRIKRGNNPFFDELFFYNVHITPSELMDEIISIRVYNSHSLRADCLMGEFK 240 250 260 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FPLTRGSQPAGELLAAFELIQREKPAIHHIPGFEMHETSRILDETEDTDLPYPPPQREAN :. :.. :..:.. ::: :.: . ..:: : :: : mKIAA1 HPVMNGDKACGDVLVTAELILRNK---------------------DGSNLPILPSQRAPN 1250 1260 1270 1280 1360 1370 1380 1390 1400 1410 mFLJ00 IYMVPQNIKPALQRTAIEILAWGLRNMKSYQMASISSPSLVVECGGQTVQSCVIRNLRKN .:::::.:.:..: ::::::::::::::.:::::..::::::::::. :.: ::..:.:. mKIAA1 LYMVPQGIRPVVQLTAIEILAWGLRNMKNYQMASVTSPSLVVECGGERVESVVIKSLKKT 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1420 1430 1440 1450 1460 1470 mFLJ00 PNFDVCTLFMEVMLPREDLYCPPIVVKVIDNRQFGRRPVVGQCTIRSLENFLCDPYSA-E ::: .:::.:.::.:.:: ::.:.::::.:::::.:::::::: :. : ::::.. : mKIAA1 PNFPSSVLFMKVFLPKEELYMPPLVIKVIDHRQFGRKPVVGQCTIDHLDRFRCDPYAGKE 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1480 1490 1500 1510 1520 mFLJ00 SPSPQGGPDDVSLLS--PGEDVLIDIDDKEPLIPV----QEEEFIDWWSKFFASVGEREK . :: .::.: : ..:.:.:.: .::. .:::..::::::.:: ::.:: mKIAA1 DIVPQL---KASLMSAPPCREVVIEIEDTKPLLASKLSEKEEEIVDWWSKFYASSGEHEK 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1530 1540 1550 1560 1570 1580 mFLJ00 CGSYLEKDFDTLKVYDTQLENVEAFGGLSDFCNTFKLYRGRTQEETDDPSVIGEFKGLFK ::.:..: .. ::.:: .::.: : ::.:: .:::::::.. .:..::::.::::: :. mKIAA1 CGQYIQKGYSKLKIYDCELEDVADFEGLTDFSDTFKLYRGKS-DENEDPSVVGEFKGSFR 1470 1480 1490 1500 1510 1520 1590 1600 1610 1620 1630 1640 mFLJ00 IYPLPEDPAIPMPPRQFHQLAAQGPQECLVRIYIVRAFGLQPKDPNGKCDPYIKISIGKK :::::.::..: :::::..: . :::: ::::::... :::.: :: :::::::..::: mKIAA1 IYPLPDDPSVPAPPRQFRELPDSVPQECTVRIYIVQGLQLQPQDNNGLCDPYIKITLGKK 1530 1540 1550 1560 1570 1580 1650 1660 1670 1680 1690 1700 mFLJ00 SVSDQDNYIPCTLEPVFGKMFELTCTLPLEKDLKITLYDYDLLSKDEKIGETVIDLENRL . :.:.::: ::.::::.:.::.: :: ::::::..:::: ...:::.:::.::::::. mKIAA1 VIEDRDHYIPNTLNPVFGRMYELSCYLPQEKDLKISVYDYDTFTRDEKVGETTIDLENRF 1590 1600 1610 1620 1630 1640 1710 1720 1730 1740 1750 1760 mFLJ00 LSKFGARCGLPQTYCVSGPNQWRDQLRPSQLLHLFCQQHRIKAPVYRTD--RVTFQDKDY ::.::..::.:. ::::: : :::::::.:::. . . . :: : :. . .:: mKIAA1 LSRFGSHCGIPEQYCVSGVNTWRDQLRPTQLLQNVARFKGFPPPVLSEDGSRIRYGGRDY 1650 1660 1670 1680 1690 1700 1770 1780 1790 1800 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