FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA4246.ptfa, 602 aa vs ./tmplib.26680 library 1768415 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8227+/-0.00618; mu= 11.1971+/- 0.411 mean_var=228.1941+/-53.203, 0's: 0 Z-trim: 7 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0849 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mFLJ00316 ( 641 res) mph01644 ( 641) 1988 257 3.8e-69 mKIAA4245 ( 606 res) mfj00189 ( 606) 1697 221 2e-58 >>mFLJ00316 ( 641 res) mph01644 (641 aa) initn: 2020 init1: 1084 opt: 1988 Z-score: 1333.7 bits: 256.9 E(): 3.8e-69 Smith-Waterman score: 1988; 52.069% identity (52.159% ungapped) in 580 aa overlap (14-592:4-583) 10 20 30 40 50 60 mKIAA4 RISLQRQKETTLDMASEIHMSEPMCLIENTEAQLVINQEALRILSAITQPVVVVAIVGLY ::: .: :.::.:: . .: .:..:. :: :::::::::::::: mFLJ00 LVTMASGPNMEAPVCLVENENEELRVNSKAINILERITQPVVVVAIVGLY 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 mKIAA4 RTGKSYLMNKLAGKRTGFSLGSTVQSHTKGIWMWCVPHPKKAGQTLVLLDTEGLEDVEKG :::::::::.:::. ::.::.::.:.::::::::::::.: :::::::::: ::::: mFLJ00 RTGKSYLMNRLAGQNHGFNLGTTVRSETKGIWMWCVPHPSKPKFTLVLLDTEGLGDVEKG 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 mKIAA4 DNQNDCWIFALAVLLSSTFIYNSIGTINQQAMDQLHYVTELTDLIKSKSSPDQSGIDDSA : .:: :::::::::::::.:::..:::.::..:::::::::. :..::. . .::: mFLJ00 DPKNDSWIFALAVLLSSTFVYNSMSTINHQALEQLHYVTELTERIRAKSTSRSEEVDDSD 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 mKIAA4 NFVGFFPTFVWTLRDFSLELEVNGKPVTSDEYLEHSLTLKKGADKKTKSFNEPRLCIRKF .::.::: :.::.::: :::...:. .:.:::::..: : : . :... : :: :::.: mFLJ00 EFVSFFPDFIWTVRDFVLELKLEGRVITADEYLENALKLIPGMSIKAQKANLPRECIRHF 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 mKIAA4 FPKRKCFIFDRPAQRKQL-SKLETLREEELCGEFVEQVAEFTSYILSYSSVKTLCGGIIV ::.::::.::::.. :.: ..: . :..: : : :: :::.: :..::: ::.: mFLJ00 FPRRKCFVFDRPTKDKELLVHVEEMPEDQLDHSFQVQSKEFCSYIFSNSKAKTLKEGIVV 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 mKIAA4 NGPRLKSLVQTYVGAISNGSLPCMESAVLTLAQIENSAAVQKAITHYEEQMNQKIQMPTE :: :: .:: ::: ::..:..::.:.:: :::: ::: ::::: :: ::: :....::. mFLJ00 NGNRLATLVTTYVDAINSGDVPCLENAVTTLAQRENSIAVQKAADHYSEQMAQRMRLPTD 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 mKIAA4 TLQELLDLHRPIESEAIEVFLKNSFKDVDQKFQTELGNLLVAKRDAFIKKNMDVSSARCS :::::: .: :.::: ::...:::: .:.:: .: . :.. :...: .: ..:. mFLJ00 TLQELLTVHTACEKEAIAVFMEHSFKDENQQFQKNLVVTIEEKKEDFLRQNEAASLSHCQ 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 mKIAA4 DLLEDIFGPLEEEVKLGTFSKPGGYYLFLQMRQELEKKYNQAPGKGLQAEAMLKNYFDSK :. . :.: .. :.:: :::. :.:. :...:. :...: ::..:. .:.....:. mFLJ00 AELDKLSESLRESISRGVFSVPGGHRLYLEARKKVEQDYERVPRKGVKANHVLQSFLQSQ 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 mKIAA4 ADVVETLLQTDQSLTEAAKEVEEERTKAEAAEAANRELEKKQKEFELMMQQKEKSYQEHV .. ....:.:..::.. : .: ::.. :::: .. :..::::.. .:. .:.::.:.: mFLJ00 ISIEDSIMQSDKALTDGQKAMEAERAQKEAAEKEQELLRQKQKELQQVMEAQERSYKENV 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 mKIAA4 KKLTEKMKDEQKQLLAEQENIIAAKLREQEKFLKEGFENESKKLIREIDTLKQNKSSGKC .: :::. :.:..: ::: . ::. :. .:.:::. . . . ::. :... mFLJ00 AQLHEKMETERKNILREQEVKLEHKLKIQKDMLNEGFKRKCEAMDLEISQLQKEIQLNKE 540 550 560 570 580 590 600 mKIAA4 TIL mFLJ00 KNSSLGAKILDGFGDVLISVVPGSGKYFGLGLKILSSQMNQTQNSDKVRKL 600 610 620 630 640 >>mKIAA4245 ( 606 res) mfj00189 (606 aa) initn: 1766 init1: 820 opt: 1697 Z-score: 1141.3 bits: 221.2 E(): 2e-58 Smith-Waterman score: 1697; 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