# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/msj08164.fasta.nr -Q ../query/mKIAA0628.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA0628, 508 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7892842 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9572+/-0.000186; mu= 10.7744+/- 0.010 mean_var=73.8060+/-14.151, 0's: 39 Z-trim: 240 B-trim: 121 in 1/66 Lambda= 0.149289 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|12859226|dbj|BAB31578.1| unnamed protein produc ( 499) 3537 771.6 0 gi|18256858|gb|AAH21834.1| Zinc finger protein 623 ( 499) 3523 768.6 0 gi|149066158|gb|EDM16031.1| rCG60016 [Rattus norve ( 499) 3266 713.3 3.9e-203 gi|18202139|sp|O75123.1|ZN623_HUMAN RecName: Full= ( 536) 2948 644.8 1.7e-182 gi|126722743|ref|NP_001075949.1| zinc finger prote ( 496) 2876 629.3 7.5e-178 gi|114622134|ref|XP_520001.2| PREDICTED: zinc fing ( 496) 2875 629.0 8.7e-178 gi|109087687|ref|XP_001086662.1| PREDICTED: zinc f ( 677) 2814 616.0 9.9e-174 gi|119906214|ref|XP_592731.3| PREDICTED: similar t ( 494) 2710 593.5 4.3e-167 gi|194378208|dbj|BAG57854.1| unnamed protein produ ( 474) 2643 579.1 9.3e-163 gi|133777656|gb|AAI12900.1| ZNF623 protein [Homo s ( 403) 2503 548.8 9.8e-154 gi|126330150|ref|XP_001380148.1| PREDICTED: simila ( 578) 1737 384.0 5.9e-104 gi|126330058|ref|XP_001379290.1| PREDICTED: simila (1486) 1741 385.2 6.5e-104 gi|126344492|ref|XP_001375706.1| PREDICTED: hypoth ( 524) 1734 383.3 8.6e-104 gi|109124478|ref|XP_001104516.1| PREDICTED: simila (1233) 1732 383.2 2.2e-103 gi|149722053|ref|XP_001494018.1| PREDICTED: zinc f ( 688) 1729 382.3 2.2e-103 gi|126322950|ref|XP_001369114.1| PREDICTED: simila ( 696) 1729 382.3 2.2e-103 gi|126345328|ref|XP_001371649.1| PREDICTED: hypoth ( 559) 1725 381.4 3.5e-103 gi|114676858|ref|XP_512615.2| PREDICTED: zinc fing (1120) 1728 382.3 3.7e-103 gi|114676856|ref|XP_001163591.1| PREDICTED: zinc f (1238) 1728 382.3 4e-103 gi|71153480|sp|Q8TAQ5.1|ZN420_HUMAN RecName: Full= ( 688) 1725 381.5 4e-103 gi|109125704|ref|XP_001113891.1| PREDICTED: simila ( 868) 1725 381.6 4.8e-103 gi|73947917|ref|XP_541480.2| PREDICTED: similar to ( 532) 1721 380.5 6.1e-103 gi|126330054|ref|XP_001379270.1| PREDICTED: simila ( 761) 1722 380.9 6.8e-103 gi|205831220|sp|A2VDQ7.1|ZN420_BOVIN RecName: Full ( 687) 1716 379.5 1.5e-102 gi|90079633|dbj|BAE89496.1| unnamed protein produc ( 470) 1714 379.0 1.6e-102 gi|73947821|ref|XP_867681.1| PREDICTED: similar to ( 812) 1714 379.2 2.4e-102 gi|126344718|ref|XP_001381592.1| PREDICTED: simila ( 563) 1712 378.6 2.4e-102 gi|73947819|ref|XP_541675.2| PREDICTED: similar to ( 977) 1714 379.2 2.7e-102 gi|73948425|ref|XP_541659.2| PREDICTED: similar to (1259) 1713 379.1 3.8e-102 gi|33417243|gb|AAH55817.1| Zfp420 protein [Mus mus ( 578) 1709 378.0 3.9e-102 gi|26337635|dbj|BAC32503.1| unnamed protein produc ( 578) 1704 376.9 8.1e-102 gi|126330148|ref|XP_001380123.1| PREDICTED: simila ( 782) 1702 376.6 1.4e-101 gi|109461612|ref|XP_001078762.1| PREDICTED: simila (1321) 1702 376.8 2e-101 gi|109458488|ref|XP_574414.2| PREDICTED: similar t (1396) 1702 376.8 2.1e-101 gi|126339331|ref|XP_001365944.1| PREDICTED: simila (1653) 1699 376.2 3.7e-101 gi|126329733|ref|XP_001372099.1| PREDICTED: simila ( 762) 1688 373.5 1.1e-100 gi|126342468|ref|XP_001377073.1| PREDICTED: simila (1093) 1689 373.9 1.2e-100 gi|126328845|ref|XP_001374290.1| PREDICTED: simila (1010) 1686 373.2 1.8e-100 gi|194214608|ref|XP_001497204.2| PREDICTED: simila ( 686) 1684 372.6 1.8e-100 gi|126324559|ref|XP_001368136.1| PREDICTED: simila ( 762) 1683 372.5 2.3e-100 gi|126323114|ref|XP_001373326.1| PREDICTED: simila ( 554) 1681 371.9 2.4e-100 gi|109124519|ref|XP_001113115.1| PREDICTED: zinc f ( 985) 1681 372.1 3.7e-100 gi|126323913|ref|XP_001377951.1| PREDICTED: simila ( 931) 1678 371.5 5.6e-100 gi|194215233|ref|XP_001495195.2| PREDICTED: simila ( 653) 1675 370.7 6.8e-100 gi|90079507|dbj|BAE89433.1| unnamed protein produc ( 638) 1674 370.5 7.7e-100 gi|126342482|ref|XP_001377265.1| PREDICTED: simila ( 864) 1674 370.6 9.7e-100 gi|109126269|ref|XP_001095983.1| PREDICTED: simila ( 658) 1672 370.0 1.1e-99 gi|126343997|ref|XP_001368486.1| PREDICTED: simila (1027) 1673 370.4 1.3e-99 gi|126314668|ref|XP_001374905.1| PREDICTED: simila ( 779) 1671 369.9 1.4e-99 gi|122132254|sp|Q08DG8.1|ZN135_BOVIN RecName: Full ( 657) 1668 369.2 1.9e-99 >>gi|12859226|dbj|BAB31578.1| unnamed protein product [M (499 aa) initn: 3537 init1: 3537 opt: 3537 Z-score: 4118.7 bits: 771.6 E(): 0 Smith-Waterman score: 3537; 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