# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/msh08255.fasta.nr -Q ../query/mFLJ00251.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mFLJ00251, 1029 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7920538 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1655+/-0.000185; mu= 14.4311+/- 0.010 mean_var=75.7780+/-14.696, 0's: 26 Z-trim: 31 B-trim: 62 in 1/65 Lambda= 0.147334 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|47847492|dbj|BAD21418.1| mFLJ00251 protein [Mus (1029) 7001 1498.3 0 gi|73988731|ref|XP_853685.1| PREDICTED: hypothetic (1078) 4000 860.4 0 gi|149257904|ref|XP_988314.2| PREDICTED: similar t (2320) 3481 750.4 2.5e-213 gi|149257642|ref|XP_913886.3| PREDICTED: dynein he (3180) 3481 750.5 3.2e-213 gi|119907313|ref|XP_874520.2| PREDICTED: similar t (1052) 3461 745.8 2.6e-212 gi|109462612|ref|XP_001075408.1| PREDICTED: simila (3325) 2952 638.0 2.3e-179 gi|121941575|sp|Q2NKK8.1|CK047_HUMAN RecName: Full ( 597) 1987 432.3 3.5e-118 gi|12860737|dbj|BAB32030.1| unnamed protein produc ( 285) 1898 413.2 9.9e-113 gi|114636507|ref|XP_001164164.1| PREDICTED: simila (1518) 1867 407.1 3.4e-110 gi|222144249|ref|NP_653267.2| dynein heavy chain d (4753) 1847 403.3 1.5e-108 gi|149068463|gb|EDM18015.1| rCG40291 [Rattus norve ( 302) 1561 341.5 3.8e-91 gi|126330300|ref|XP_001380306.1| PREDICTED: hypoth ( 785) 1343 295.5 6.9e-77 gi|21751758|dbj|BAC04023.1| unnamed protein produc ( 286) 835 187.2 1e-44 gi|119589109|gb|EAW68703.1| hCG1992890, isoform CR ( 319) 835 187.2 1.1e-44 gi|126330302|ref|XP_001380312.1| PREDICTED: simila (2403) 791 178.6 3.4e-41 gi|210127491|gb|EEA75173.1| hypothetical protein B (2944) 591 136.1 2.5e-28 gi|210092175|gb|EEA40408.1| hypothetical protein B (3019) 524 121.9 4.9e-24 gi|198437409|ref|XP_002124989.1| PREDICTED: simila (5486) 479 112.6 5.9e-21 gi|156228595|gb|EDO49393.1| predicted protein [Nem ( 278) 431 101.3 7.1e-19 gi|166788554|dbj|BAG06725.1| DNHD1 variant protein (3841) 385 92.5 4.6e-15 gi|190586187|gb|EDV26240.1| hypothetical protein T (4503) 383 92.1 7e-15 gi|134070475|emb|CAM68818.1| dynein heavy chain, p (4043) 285 71.2 1.2e-08 gi|68127174|emb|CAJ05047.1| dynein heavy chain, pu (4044) 280 70.2 2.5e-08 gi|134062919|emb|CAM39366.1| dynein heavy chain, p (4043) 264 66.8 2.7e-07 gi|121904613|gb|EAY09557.1| hypothetical protein T (2819) 228 59.0 4.1e-05 gi|70884324|gb|EAN97189.1| dynein heavy chain, put (4117) 228 59.1 5.4e-05 gi|211965648|gb|EEB00844.1| dynein heavy chain, pu (4713) 228 59.2 6e-05 gi|221509254|gb|EEE34823.1| dynein heavy chain, pu (4713) 228 59.2 6e-05 gi|62176164|gb|AAX70281.1| dynein heavy chain, put (4112) 226 58.7 7.3e-05 gi|221488763|gb|EEE26977.1| dynein heavy chain, pu (4810) 226 58.7 8.2e-05 gi|121891659|gb|EAX96982.1| Dynein heavy chain fam (3998) 224 58.2 9.5e-05 gi|121905610|gb|EAY10535.1| Dynein heavy chain fam (4008) 210 55.3 0.00075 gi|210096986|gb|EEA45121.1| hypothetical protein B ( 719) 195 51.5 0.0019 gi|121913069|gb|EAY17883.1| Dynein heavy chain fam (3878) 203 53.8 0.0021 gi|210101760|gb|EEA49821.1| hypothetical protein B (3316) 199 52.9 0.0033 gi|119619962|gb|EAW99556.1| hypothetical protein F ( 829) 187 49.8 0.0067 gi|114578586|ref|XP_515578.2| PREDICTED: similar t (3928) 193 51.6 0.0091 >>gi|47847492|dbj|BAD21418.1| mFLJ00251 protein [Mus mus (1029 aa) initn: 7001 init1: 7001 opt: 7001 Z-score: 8034.7 bits: 1498.3 E(): 0 Smith-Waterman score: 7001; 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