FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1985.ptfa, 947 aa vs ./tmplib.26680 library 1768070 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.7351+/-0.00479; mu= 17.8724+/- 0.321 mean_var=101.1659+/-23.047, 0's: 0 Z-trim: 3 B-trim: 4 in 1/35 Lambda= 0.1275 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mFLJ00164 ( 1012 res) mtj00833 (1012) 1828 348 4.5e-96 mKIAA1043 ( 1627 res) mbg05088 (1627) 154 40 0.0031 >>mFLJ00164 ( 1012 res) mtj00833 (1012 aa) initn: 1583 init1: 974 opt: 1828 Z-score: 1817.1 bits: 347.7 E(): 4.5e-96 Smith-Waterman score: 1828; 38.090% identity (39.488% ungapped) in 932 aa overlap (1-919:51-962) 10 20 30 mKIAA1 EERSSLWSPGSERKAECSGFLCSLAHTDIT :::: . : : . .: . ::. mFLJ00 SSVPRCLACPGVWAGTWPLASLESAIFLSEEERSFFRSEGHFSDEDARRLLSRTSGTDVC 30 40 50 60 70 80 40 50 60 70 80 90 mKIAA1 SIYRLSEFEAIQNLQNDLSASQPEGFREARSGGTWMERQTIGSRRSSGSGDSSPEEDELI . :. .: .. : . . . : : .. . . .. . .: : mFLJ00 TTCSLDWLEEAEGEQLEQREMSLPHLNPEPHGTLQMVKNILEKCKACPDHPEAPVSWSLG 90 100 110 120 130 140 100 110 120 130 140 mKIAA1 SASSDSYHLPEPEDLDDPELFMDLSTSLEED--DVEHFAPILAFLDHEGYTDHFKSLYDF ..: . : ::..:.. .: :.: : : . .: :. :: ::.::::. mFLJ00 GVSRRASSL----DLEEPRFCLDP----EDDWTDPEPLDSLLQVLNAPGYGAHFRSLYDI 150 160 170 180 190 150 160 170 180 190 200 mKIAA1 SFSFLTSSFYSFSEEDELVAYLETSRKWAKMSHMTWAHARLCFLLGRLSIRKTKLSQARV :. .:....:.:..:.::. : .: :: .. : ::::.::::: :: ::::::: mFLJ00 SLPWLSTALYGFDDEEELAERLAQARGVAKKVDLSMALARLCLLLGRLCARKLKLSQARV 200 210 220 230 240 250 210 220 230 240 250 260 mKIAA1 YFEEAIRVLDGAFEDLSLVAALYINLAAIYLRQRLRHKGPTLLEKAGALLACLPDHEFST :::::. .:.:.: :::::::.: .:...::.:. .: . ::.::: : : .. mFLJ00 YFEEALGALEGSFGDLSLVAAVYSSLTTVYLKQKNAEKCVQVAPKAAALLLGTPGHSCNA 260 270 280 290 300 310 270 280 290 300 310 320 mKIAA1 KNELDVVTYVLRQGIVVGSGLLEARSCFLAIRLLLSLGRHEEVVPFAERLQLL---SGHP :: . :.::. : : :::.::: : : . ::..:. ::: : .: : mFLJ00 DAEL--LKYALRRVICGLSPQAEARACFLLARHYTHLKQPEEALPYLERLLRLNRDAGSP 320 330 340 350 360 370 330 340 350 360 370 380 mKIAA1 PAS--EATATMLSSLYDKKYLPHLAVASVQKRGPQSARGMSLSIWQAYLVLQNATKILGV :: : .:...: .: :::::.. .. . . .. :. .. ::::: : mFLJ00 QASWPEDCYLLLADIYGRKCLPHLALSCLRVSSLWTRCSLPGSLRSVDLVLQN------V 380 390 400 410 420 390 400 410 420 430 mKIAA1 PSSNWCEVSALACPT-----LRQALAACEEQSDQDIQRTLCLILSKMYLQHQSPDGSVHY :. : . .. . :. ::::::. . : .. : :...: .::. . .. . mFLJ00 PGPNSQRRAGHSLPSQIAYYLRQALASLAPGTGQALRGPLYASLAQLYSHHQQYSQAIAF 430 440 450 460 470 480 440 450 460 470 480 490 mKIAA1 LSQAHVLGKLLGEEEAFESSLCLAWAYLLGRQTEKALEILEPLLC-SLRETECVTQRGVV .::: : . . . . ::: ..: .. :..::. : : . :. :. mFLJ00 MSQAAEADTAAGVHPVVDRLVALAWLHMLCGNSLVAMDILK---CISDAAVANKDQECVM 490 500 510 520 530 540 500 510 520 530 540 550 mKIAA1 HNLLGLAFEDEGRTSRAAKSYLRALIRAREMGNIRNQAVSMANLGHLTLKSCMQQSARGY :....:.. ::: .::..:.::: : .:....::: .::.: : :.. .. :. : mFLJ00 MNMVAMALKRMGRTRQAAEGYFRALHMAYAQGHLQSQAVVLANFGALCLQAGARSLAQHY 550 560 570 580 590 600 560 570 580 590 600 610 mKIAA1 LLQAVRLYSELQASKETDMELVQVLLWLGQASVSGHQLVHSRLCYEMALLFGLRHQHLSS : .:: :.:.. : ...:::::::: . ... :: :.: ... .:: : mFLJ00 LREAVGLFSQVP-SGVCGRDFTQVLLWLGQLCTRRALPQQAKCYYEWAFLVAVETDHLES 610 620 630 640 650 660 620 630 640 650 660 670 mKIAA1 QLQVTKSLCHFYSSVSPNPDACITYHEHWLALAQQLRDREMEGQLLESLGQLYRNLNTSR :::....:: :::.: :: :. ::: ::::.. .. .::::::...::: .:.: : mFLJ00 QLQAVQKLCLFYSKVMPNEVRCVIYHEFQLALARKTANKVLEGQLLEAISQLYLSLGTER 670 680 690 700 710 720 680 690 700 710 720 730 mKIAA1 SLRRSLACIKESLRIFVDLGERDKAAEAWLGAGRLHYLMQEDELVELYLQEAIQTALRSE . . .: :.:: ::.:: ...: :.::: ::...:.....:::.::.: : ..:: . mFLJ00 AYKSALDYTKRSLGIFIDLQQKEKEARAWLQAGKIYYILRQNELVDLYIQVAQNAALYTG 730 740 750 760 770 780 740 750 760 770 780 790 mKIAA1 EPSLALKLYEEAGDVFFNGTRHRHRAVEYYRAGAVPLARRMKALRTELRIFNKLTELQIS .:.:.:.:.: :::.::::: .:..:: .:: :.::: . ..:::. :::. : . mFLJ00 DPKLGLELFEAAGDIFFNGTWEREKAVSFYRDRALPLAVTVGDQEVELRLCNKLVALLSA 790 800 810 820 830 840 800 810 820 830 840 850 mKIAA1 LEGYEKALEFATLAARLSVLTGDQKQELVAFHRLATVYFSLNMYEMAEDCYLKTLSLCPP ::. ...:::: : ::. ::. .: ::.:::::.. :. :.:: .::.:::: mFLJ00 LEAPQEGLEFAHEALALSITLGDRLNERVAYHRLATLHHRLGHGELAEHFFLKALSLCSS 850 860 870 880 890 900 860 870 880 890 900 910 mKIAA1 WLQSPKEALYYAKVYCRLGRLTFYQLKDAHDATEYFLLALAAAVLMGDEELQNTIKNRLD :. .:.:::.::: :: . ::.::: ::. :. ::::::: .: .. : : .:: mFLJ00 PLEFDEETLYYVKVYLVLGDIIFYDLKDPFDAAGYYQLALAAAVDLGHKKAQLKIYTRLA 910 920 930 940 950 960 920 930 940 mKIAA1 SICQSPLWHSNPFGCSSERARWLSGGSLAL .: mFLJ00 TIYHHFLVDREMSLFFYQKARTFASELNLRRTNLVPQRFCGRAPWLAPGHPS 970 980 990 1000 1010 >>mKIAA1043 ( 1627 res) mbg05088 (1627 aa) initn: 95 init1: 95 opt: 154 Z-score: 150.5 bits: 40.0 E(): 0.0031 Smith-Waterman score: 223; 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