FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0980.ptfa, 1292 aa vs ./tmplib.26680 library 1767725 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.5908+/-0.00803; mu= -3.5958+/- 0.530 mean_var=377.1157+/-90.677, 0's: 0 Z-trim: 13 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0660 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1565 ( 2081 res) mpf00737 (2081) 1032 114 3e-25 mKIAA2034 ( 1729 res) meh02376 (1729) 339 48 2e-05 mKIAA0866 ( 1984 res) mtg01789 (1984) 252 40 0.007 >>mKIAA1565 ( 2081 res) mpf00737 (2081 aa) initn: 1223 init1: 660 opt: 1032 Z-score: 545.5 bits: 113.9 E(): 3e-25 Smith-Waterman score: 1512; 29.210% identity (32.858% ungapped) in 1342 aa overlap (7-1276:37-1301) 10 20 30 mKIAA0 TQRSESRASHSPACYGMDNEEENHYVSRLRDVYSSC : . : . ::::. ::... .::.....: mKIAA1 SRGHGLCGGAGRLSPGLELRRRPAWALPRGRRKVSAVGYGMDEVEEDQHEARLKELFDSF 10 20 30 40 50 60 40 50 60 70 80 90 mKIAA0 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. . .: .::: .:.:.:...:. :.:.:: .::: mKIAA1 FYGLFKTGKSLTPSASTPYRQLKRHLSMQSFDESGRRTATSSAMTSTI-GFRVFSCLDDG 290 300 310 320 330 340 340 350 360 370 380 390 mKIAA0 SGFAFPEQVISAWAQEGIQNGREILQSLDFSVDEKVNLLELTWALDNELLTVDGVIQQAA : : :.....: .:::.:..:::..::::.: ..:: ::: ::.::::.. . :.::: mKIAA1 MGQASVERILDTWQEEGIENSQEILKALDFSLDGNINLTELTLALENELLVTKNGIHQAA 350 360 370 380 390 400 400 410 420 430 440 450 mKIAA0 LACYRQELSYHQGQVDQLVQERDKARQDLEKAEKRNLDFVREMDDCHSALEQLTEKKIKH :: .. :. . .:::.:.:..: :.::.:::: . .. :.:: :.:.:. .: .... mKIAA1 LASFKAEIRHLLERVDQVVREKEKLRSDLDKAEKLKSLMASEVDDHHAAIERRNEYNLRK 410 420 430 440 450 460 460 470 480 490 500 510 mKIAA0 LEQEYRGRLSLLRSEVEMERELFWEQARRQRAVLEQDVGRLQAEETSLREKLTLALKENS :..::. :.. :..:...::: . .:. .::. :::.. . ..::. .:..:.:.::::. mKIAA1 LDEEYKERIAALKNELRQEREQMLQQVGKQRVELEQEIQKAKTEENYIRDRLALSLKENN 470 480 490 500 510 520 520 530 540 550 560 570 mKIAA0 RLQKEIIEVVEKLSDSEKLVLRLQSDLQFVLKDK---LEPQSMELLAQEEQFTAILNDYE ::. :..: .:::.. :.:. .:: .:. :: .: :.:.: :.. 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..:: .. .:.. . .. . . . . .. : :.. .. . : ..:: . mKIAA1 RVEHEQERREMTGKLAALESAHRASLERADQEKAEMSTEICRLQNTVKDMQQAASLLMLQ 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1090 1100 1110 1120 1130 mKIAA0 LEEAGCR----EEQQGDQIQNLKIELERVNEECQYLRLS-QAELTESLEESRG---QLYS .::. :: .:: ..: . :.. :: . .: : ....:. ..: mKIAA1 ---GGCQATAGEEAEGDGAMSLLQQGEQLLEENGDVLISLQRAHEHAVKENAKMATEIYR 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1180 mKIAA0 VQLRLEAAQSQHGRIVQRLQEQMSQLVPGARVAELQ----------HLL-NVKEEEARRL .: ::. . . : ... :. .. . :. ... :.: .. ..::: : mKIAA1 LQQRLK--KLEPGSVISSCLEEGTSEISGSSREQVEPIMKQGPATKHFLSDLGDHEARDL 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1210 1220 1230 mKIAA0 SA--QQEEYRQQLKAREDQVE-DAEARLRNVE------WLLQEKVEELREQF-------- .. . ::. :.. ... : ..:.: : : :. .. .::::. mKIAA1 ASTGTSSVQRQECKTEASEASLDCFSELENSEDTRTESWDLKSQISQLREQLTVLRADCD 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1240 1250 1260 1270 1280 mKIAA0 EKNTRSDLLLKELYVENAHLMKAVQLTEEKQR------GAEKKNCVLEEKVRALNKLISK . . :.. :: .. : . .: .: : ..: : ..: :.:..: mKIAA1 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