FASTA searches a protein or DNA sequence data bank
 version 3.4t11 Apr 17, 2002
Please cite:
 W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

 ../query/mKIAA0019.ptfa, 841 aa
 vs ./tmplib.26680 library

1768176 residues in  2168 sequences
  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.4767+/-0.00745; mu= -16.5688+/- 0.491
 mean_var=394.8372+/-97.795, 0's: 0 Z-trim: 13  B-trim: 0 in 0/36
 Lambda= 0.0645

FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width:  16
The best scores are:                                       opt bits E(2168)
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mKIAA1108  ( 1266 res)   mbg02140                  (1266)  437   55 4.7e-08
mKIAA0603  ( 956 res)   mfj60230                   ( 956)  409   53 2.3e-07
mFLJ00006  ( 766 res)   mbj00080                   ( 766)  355   48 6.4e-06
mKIAA1055  ( 979 res)   mpf00228                   ( 979)  346   47 1.4e-05
mKIAA0608  ( 738 res)   mfj39041                   ( 738)  342   46 1.4e-05
mKIAA0882  ( 1229 res)   mfj03243                  (1229)  343   47   2e-05
mFLJ00332  ( 439 res)   msk03045                   ( 439)  328   45 2.4e-05
mKIAA0676  ( 1268 res)   mfj02220                  (1268)  336   46 3.2e-05
mKIAA1322  ( 645 res)   mbh00387                   ( 645)  316   44   7e-05
mFLJ00288  ( 329 res)   mic33003                   ( 329)  303   42 9.8e-05


>>mKIAA4104  ( 1065 res)   mbg15134                       (1065 aa)
 initn: 304 init1: 242 opt: 442  Z-score: 240.5  bits: 55.9 E(): 3e-08
Smith-Waterman score: 442;  27.083% identity (28.889% ungapped) in 336 aa overlap (75-399:513-838)

           50        60        70        80        90       100    
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                                     ... :  .. .: .:.   .    : ..:.
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            490       500       510       520       530       540  

          110         120       130          140       150         
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       ::.   ..  ...   . .:.:  :::::: ::    .  .. :. : : .:        
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     160       170       180       190       200       210         
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       ::.   :  :.::::  : .:.:  :  :.::...  :::.:. :.:::::.: ..:.::
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       ..: ::.:: .:::..    .... .: :.:  :  .: .  :.......  : .:. . 
mKIAA4 LHMPEEQAFSVLVKIMFD--YGLRELFKQNFEDLHCKFYQL-ERLMQEYIPDLYNHFLDI
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mKIAA0 EIYTSFYTMKWFFQCFLDRTPFRLNLRIWDIYIFEGERVLTAMSYTILKLHKKHLMKLSM
        . . .:. .::.  :  . :. . ..: :. . ::  :.  ..  .::  :  :.  ..
mKIAA4 SLEAHMYASQWFLTLFTAKFPLYMVFHIIDLLLCEGISVIFNVALGLLKTSKDDLLLTDF
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       :  ..:..  : : .  :..   ..:   . ..:. .::. . .     ...   . :. 
mKIAA4 EGALKFFRVQLPKRYRSEENAKRLMELACNTKISQKKLKKFEKEYHTMREQQAQQEDPIE
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       ..  :.                                                      
mKIAA4 RFERENRRLQEANMRLEQENDDLAHELVTSKIALRKDLDNAEEKADALNKELLMTKQKLI
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>>mKIAA1108  ( 1266 res)   mbg02140                       (1266 aa)
 initn: 322 init1: 210 opt: 437  Z-score: 237.0  bits: 55.5 E(): 4.7e-08
Smith-Waterman score: 437;  31.111% identity (33.871% ungapped) in 270 aa overlap (94-349:867-1128)

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                                     : :. : :::.   : :   . :: :  . 
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mKIAA0 KGIPLQLRGEVWALLLEIPKMK------EETRDL-YSKLKHRARGCSPDIRQIDLDVNRT
       .:.: . :::.: .: :  ..:      .. .:. :..: ..    . . . : .:..::
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mKIAA0 FRDHIMFRDRYGVKQQSLFHVLAAYSIYNTEVGYCQGMSQITALLLMYMNEEDAFWALVK
       :  : .:  . :. : ::...: :::. . :::::::.: ....::..:.::.::  :  
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mKIAA0 LFSGPKHAMHGFFVQGFPKL--LRFQEHH-EKILNKFLSKLKQHLDSQEIYTSFYTMKWF
       :.        :.  :  : .  :..: ..  ..:. .   : .::. .::  :.:.  ::
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mKIAA0 FQCFLDRTPFRLNLRIWDIYIFEGERVLTAMSYTILKLHKKHLMKL-SMEELVEFLQETL
       .  : .. :. .  :..:. ...: .:.  .. ..:  ::  ...  ..: .:.:...::
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 initn: 371 init1: 193 opt: 409  Z-score: 224.5  bits: 52.7 E(): 2.3e-07
Smith-Waterman score: 409;  29.268% identity (31.343% ungapped) in 287 aa overlap (88-364:544-821)

        60        70        80        90       100       110       
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mKIAA0 RIYKGIPLQLRGEVWALLLEIPKMKEETRDLY----SKLKHRARGCSPDIRQIDLDVNRT
        . .:.: . :::.: .:    .....  . .    .. :.  .  . . . : .:..::
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       :  : .:  . :. : :::..: :::. . :::::::.: ....::..:.::.::  :  
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            :  :.  ::  :  : .. .: .     ..:. .  .: .::. .::  :.:.  
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       ::.  : .. :. .  :..:: ...: .:.  .. ..:. ..  .:.  ..:..::::. 
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       ::      : . .: :.                                           
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>>mFLJ00006  ( 766 res)   mbj00080                        (766 aa)
 initn: 340 init1: 164 opt: 355  Z-score: 198.6  bits: 47.6 E(): 6.4e-06
Smith-Waterman score: 358;  25.817% identity (26.871% ungapped) in 306 aa overlap (39-335:40-342)

       10        20        30        40        50           60     
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mFLJ00 CRRPQHMMSGNHTPSASGPFSALTPSIWPQEILAKYSQKEESSE-QPELCYDEFGFRVDK
      10        20        30        40        50         60        

          70        80         90       100       110           120
mKIAA0 VTDRFGFLHEEELPYHNAAADRQK-QLEIERTSKWLKMLKKWERYK----NTEKFHRRIY
         .. :  .    :  .   .: . : ..: : .       :..       .::..  . 
mFLJ00 EGSEPGCSQMTGSPLVEDPPQRLRWQAHLEFTHNHDVGDLTWDKIAVSLPRSEKLRSLVL
       70        80        90       100       110       120        

              130       140       150        160       170         
mKIAA0 KGIPLQLRGEVWALLLEIPKMKEETRDLYSKL-KHRARGCSPDIRQIDLDVNRTFRDHIM
        :::  .: ..:  :    . :....  : .. :. .   .   .::. :. ::. ..  
mFLJ00 AGIPHGMRPQLWMRLSGALQKKKNSELSYREIIKNSSNDETIAAKQIEKDLLRTMPSNAC
      130       140       150       160       170       180        

     180       190       200       210       220       230         
mKIAA0 FRDRYGVKQQSLFHVLAAYSIYNTEVGYCQGMSQITALLLMYMNEEDAFWALVKLFSGPK
       : .  ..    : .:: : .    :.::::: ....: ::....:::::: .  ..    
mFLJ00 FANVNSIGVPRLRRVLRALAWLYPEIGYCQGTGMVAACLLLFLEEEDAFWMMCAIIEDLL
      190       200       210       220       230       240        

     240       250       260       270       280       290         
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        :  ..:   .  .   :.  .... ..: .: . :. ..:  :. :..::.  : . . 
mFLJ00 PA--SYFSTTLLGVQTDQRVLRHLIVQYLPRLDKLLQEHDIELSLITLHWFLTAFASVVH
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     300       310       320       330       340       350         
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       .:: :::::....::  ::   .  .:.:....:..                        
mFLJ00 IRLLLRIWDLFFYEGSLVLFQTTLGMLRLKEEELIQSENSASIFNTLSDIPAQMDDAELL
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mKIAA0 VIEQLQVSMAELKRAKLDLPEPGKEDEYPKKPLGQLPPESACVNHLSNGQRSVGRPSPKT
                                                                   
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                                     .::  .: ..  .. .. .   : : ..: 
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         ... .:         .::.:  .  : :  : : .  ... ..   ::: :     : 
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       :     ...  :  ::: . :..::   ..    :.:.  . : .. : ..: .  .:  
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       .::.::. ::. ..  . .  .   :.:  :: :.:  : ..:::::.....:. :.:..
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       .::::: :: .        . .... .      :.  . .:.. : .:. :... ..  .
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       . :..::.  :.: .   . ..::: ...:: .:.  .. ...: ......::    :. 
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mKIAA0 ELVEFLQETL--AKDFF---FED--DFVIEQLQVSMA-ELKRAKLDLPEPGKEDEYPKKP
       . .... .:.  :. ..   : :   : ..:..   : .:....:.: :           
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       ::.::.:           : ::   . ::. ...  :. .. ..: :   :.     : :
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       :..::: .  .:. . :  .. :  .:.::. :  .::: :::: :.:.:.. ..: :::
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        :...:.. : .   .::      .:..    : .... ::::  :. : ..  ..: . 
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       :.:  .    :. :  :.::..  .::. :   .  ::.:..  :..... ....:: . 
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       : .:.  :  :   .  :.: :  .  ..  .. .  :: .   .:              
mKIAA0 LPEDITSEKLFSCIAAIQMQNSTKKWTQVFASVAKDIKEGDKNTSPALKS          
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mKIAA0 SNGQRSVGRPSPKTSSRREDGSPRKNHEHSPVHHSRNGTPERAGQSRRKSVDEGSKNLKH

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       :      :  : ... :  .   ..:. :..:.. .:  :....:.   .: .::.::..
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        : ..::::.:. .:..::.: .::.::: :: :    .. .  ..       :  :   
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       .. ..:  .  .:..      .:  : ..:. .  ::                       
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       :.    ::..:  .::.   .  .: . .  ::::  ::.. : ::      ....   :
mFLJ00 EM----KWVEMTLHWEKTMSRRYKKVKIQCRKGIPSALRARCWPLLCGARMCQKNNPGTY
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       ..:   : :    .. :  :..: :  : :: .  :  ::.:..:: ::..:  : ::::
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       ... ..:.:::..  :.::: ::..           .. :.     .  :       .: 
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       .. .::..  .   .:  .::. :.. :. ::   ::::: .. :: .::  .. :...:
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           . .. .   :.: :   ...    . :. :. .  .:...:    .. ...: . .
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mKIAA0 KEDEYPKK-PLGQLPPESACV-NHLSNGQRSVGRPS-PKTSSRR-EDGSP--RKNHEHSP
       :    :   : ..::  .:   ..   : :   .:  :.   .  :. .:  :: . .. 
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       . :.   :   :   : :: .                                       
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